柳燕
- 作品数：2 被引量：15H指数：2
- 供职机构：福建农林大学园艺学院园艺植物生物工程研究所更多>>
- 发文基金：福建省科技重大专项福建省自然科学基金福建省教育厅A类人文社科/科技研究项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 苋菜甜菜红素合成相关基因AmMYB1的克隆及表达分析被引量：11
- 2016年
- 应用RACE技术,从‘大红’苋菜中克隆到1条MYB基因cDNA全长序列,命名为AmMYB1(登录号为KU557504)。AmMYB1基因开放阅读框为723bp,可编码240个氨基酸。其基因组序列与cDNA比对后显示,AmMYB1基因含有1个内含子。生物信息学分析表明,AmMYB1具有2个连续的MYB结构域,是一个典型的R2R3-MYB;同源分析显示,该基因编码的氨基酸序列与甜菜红素相关BvMYB1的一致性最高,达到54%。亚细胞定位结果显示,AmMYB1蛋白定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析表明,AmMYB1基因在‘大红’苋菜叶片红色部位的表达量高于绿色部位;在甜菜红素含量高的叶和茎中表达量明显高于根;在光照条件下表达量高于遮光处理;在红叶品种中的表达量高于绿叶品种。研究结果表明,AmMYB1基因可能是苋菜甜菜红素合成途径中重要的正调控因子。
- 谢礼洋刘生财白玉柳燕林觅蔡顺亮郑学立谢晓清冯新程春振陈裕坤赖钟雄
- 关键词：苋菜甜菜红素
- 苋菜amaAG基因克隆与生物信息学分析被引量：4
- 2017年
- 以苋菜种子为初始材料,通过离体培养获得苋菜各阶段试管苗,利用实验室构建的苋菜开花过程转录组数据库(NCBI SRA number:SRR924089,SSR924090,SRR924091,SRR924092),采用RT-PCR结合RACE技术进行ama AG基因全长c DNA序列克隆,然后对其进行生物信息学分析。结果表明,苋菜ama AG基因全长为1 123 bp,其中5'UTR 122 bp,3'UTR 243 bp,poly A尾长17 bp,并包含一个741 bp的开放阅读框,编码246个氨基酸。通过生物信息学分析可知,该蛋白属于亲水蛋白,但不是稳定蛋白;属于MADS和K-box超级家族,包含MADS_MEF2-like和K-box功能位点,与植物开花相关。ama AG基因差异表达分析表明,该基因是在开花期表达量最高。说明本研究已获得了苋菜ama AG基因,这为将来深入研究其功能奠定了基础,也为研究苋菜开花分子机制提供参考。
- 柳燕谢礼洋赖钟雄刘生财
- 关键词：苋菜克隆开花生物信息学
