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王硕: 作品数：12 被引量：55H指数：4; 供职机构：中国医科大学附属第一医院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金“重大新药创制”科技重大专项辽宁省科学技术计划项目更多>>; 相关领域：医药卫生更多>>

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利用GEO数据集分析USP51在胃癌中的表达及临床意义: 2018年; 目的:研究USP51在胃癌中的表达情况,探讨USP51表达与胃癌临床病理参数的相关性并预测USP51表达对胃癌预后评估的临床价值。方法:从人类肿瘤相关基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,只保留临床资料和生存信息完整的患者病例,共收录胃癌患者295例。分析不同USP51表达与胃癌临床病理参数的相关性,以及对胃癌预后的影响。采用基因集富集分析方法分析和预测受USP51调控的相关基因。结果:USP51表达水平与胃癌患者年龄、T分期、p TNM分期及Lauren分型均有关(P均<0. 05),与胃癌患者性别及N分期无关(P均> 0. 05)。随着USP51表达程度的增加,胃癌患者总生存时间(overall survival,OS)明显缩短(P <0. 001)。USP51高表达富集了黏着斑通路、钙离子信号通路、细胞黏附分子和细胞外基质等相关的基因通路(P <0. 05,FDR <0. 25)。结论:在胃癌中,USP51高表达是一种预后不良因素,推测其可以作为判断胃癌患者预后的有效生物标志物以及治疗靶点。; 臧丹曲秀娟王硕郭天舒杨子长徐璐李智刘云鹏; 关键词：胃癌

GEO公共数据集分析载脂蛋白D在胃癌中表达及临床意义被引量：1: 2017年; 目的通过基因表达汇编(GEO)公共数据集研究载脂蛋白D(ApoD)在不同分期及不同类型胃癌患者中的表达情况,探讨ApoD与胃癌发生及发展的关系,为临床诊疗及风险预测提供依据。方法从美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)中下载基因表达谱公共数据集GSE62254,纳入标准为包含ApoD表达数据的胃癌肿瘤表达谱。探究ApoD表达与胃癌临床病理学参数之间的相关性及其对预后的影响。采用基因集富集分析(GSEA)法预测ApoD的调控基因。结果 ApoD在女性、年龄≤60岁及弥漫型胃癌的患者中高表达,同时其表达与胃癌的T分期、临床分期呈正相关。在预后方面,ApoD高表达的胃癌患者无进展存活时间、总存活期明显短于低表达患者(P<0.05)。ApoD高表达样本富集了细胞黏附、紧密连接、花生四烯酸代谢等基因集。结论在胃癌中,ApoD高表达为预后不良因素,可作为影响胃癌患者预后的判断因素。; 赵佳王硕李智; 关键词：胃癌预后

乳腺癌分子异质性与分类治疗被引量：5: 2021年; 乳腺癌在组织学、流行病学和分子特性层面是一种高度异质性的疾病。目前,基于免疫组化的乳腺癌分类方法,根据雌激素受体、孕激素受体和人类表皮生长因子受体-2(HER-2)的检测结果将乳腺癌分为临床亚型,显然与基于基因表达谱的固有亚型分类不一致。这表现为临床亚型内治疗反应性和结果的异质性。异质性肿瘤细胞的存在直接反映了亚型内部(或肿瘤内)的异质性。乳腺癌的异质性,特别是亚克隆肿瘤细胞的异质性,决定了乳腺癌的最终治疗必须准确地针对特定的亚克隆肿瘤细胞群。对原发性和转移性乳腺癌分子特征的深入分析表明,遗传改变具有很大的异质性,分子发现有助于开发针对HER-2、细胞周期蛋白依赖性激酶4/6(CDK4/6)、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)或涉及BRCA突变携带者的多聚腺苷二磷酸-核糖聚合酶抑制剂和免疫治疗的新的治疗方法。; 王硕郑新宇; 关键词：乳腺癌分子亚型靶向治疗

利用TCGA及GEO数据集分析claudin11在胃癌中的表达及临床意义被引量：4: 2016年; 【目的】研究claudin11在胃癌中的表达及临床价值,预测claudin11参与肿瘤发生发展的机制。【方法】从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(gene expression omnibu,GEO)数据库收集胃癌数据集,下载claudin11基因表达谱及临床信息。分析claudin11表达和临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测claudin11的调控基因。【结果】在TCGA数据集中claudin11表达水平与年龄(P=0.031)、T分期(P=0.007)、有无淋巴结转移(P=0.039)、TNM分期(P=0.03)及分化程度(P<0.001)相关。Claudin11高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P<0.001)。Claudin11高表达样本富集了细胞黏附、紧密连接、细胞外基质、骨架蛋白调控等相关等基因集。【结论】Claudin11在胃癌中是一种不良预后因素,可以作为判断预后的标志物。; 王硕李智郑春雷曲秀娟刘静曲晶磊车晓芳刘云鹏; 关键词：胃癌

胃癌化疗的现状与研究进展被引量：21: 2019年; 胃癌是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,发病率及死亡均居高不下,目前,无论早期胃癌的术后辅助治疗,还是晚期胃癌的维持治疗,均以化疗为主。近年来,靶向治疗及免疫治疗等多种新型治疗手段的发展,也为胃癌的药物治疗提供了更多的选择。本文对胃癌的药物治疗进展进行综述。; 赵佳王硕曲晶磊; 关键词：胃癌化疗

胃癌组织ATP1 A2的表达及机制探讨被引量：3: 2016年; 目的观察胃癌组织ATP酶α2亚基(ATP1A2)表达情况,探讨其与黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子通路、细胞外基质相关信号通路的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载并预处理胃癌RNASeq V2数据、从人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,通过TCGA数据集纳入胃癌患者293例,通过GEO数据集纳入胃癌患者300例。根据表达谱数据,将胃癌组织ATP1A2表达由低到高排序,按33%、67%者将数据三等分,低于33%者为低表达,高于67%者为高表达,两者之间为中表达。分析不同ATP1A2表达与胃癌患者临床病理参数的关系,比较低、中、高表达者中位生存时间,利用基因集富集分析方法预测ATP1A2相关的基因通路。结果 TCGA数据集纳入的293例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为95、99、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄无关(P均>0.05),与T分期、N分期、p TNM分期及组织分化程度有关(P均<0.05);ATP1A2低、中、高表达者中位生存时间分别为70、36.9和26个月,三者间比较P<0.01。GEO数据集纳入的300例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为99、102、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄、T分期、N分期、p TNM分期及Lauren分型均有关(P均<0.05);ATP1A2高表达者的中位生存时间为31个月,较低表达和中表达者中位生存时间明显延长(P<0.01)。ATP1A2高表达富集了黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等相关的基因通路(P<0.05或<0.01)。结论胃癌组织中ATP1A2高表达,其高表达预示患者预后不良;ATP1A2高表达导致黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等基因通路异常可能是其作用机制。; 李智王硕侯科佐臧丹郑春雷车晓芳曲秀娟刘云鹏; 关键词：胃癌

利用GEO及TCGA数据集分析SMARCA1在胃癌中的表达及其临床意义被引量：2: 2018年; 目的探讨基因表达汇编(GEO)及癌症和肿瘤基因表达图谱(TCGA)数据集中胃癌组织的SMARCA1表达情况及其与胃癌临床病理特征和预后的关系。方法利用GEO和TCGA数据集汇总胃癌相关数据,下载胃癌组织SMARCA1表达数据及临床病理参数。分析SMARCA1表达与胃癌临床病理学特征和总生存期(OS)的关系;采用基因集富集分析(GSEA)预测SMARCA1相关的基因通路。结果在GSE62254数据集中,SMARCA1表达与T分期有关(P=0.022),而与TNM分期、性别、年龄和N分期均无关(P>0.05)。在TCGA数据集中,SMARCA1表达与T分期、性别、年龄、N分期、TNM分期和组织学分级均无关(P>0.05)。GSE62254数据集中,SMARCA1高、中及低表达组胃癌患者的中位OS分别为36.4个月、89.4个月和未达(P=0.001);TCGA数据集中,SMARCA1高、中及低表达组胃癌患者的中位OS分别为23.7个月、29.4个月和56.2个月(P=0.033)。GSEA结果显示,SMARCA1高表达样本富集了K-Ras、Akt、BMI-1和m TOR通路等基因集。结论胃癌组织中SMARCA1的表达与T分期有关,高表达患者的预后不良,可作为潜在评估胃癌预后的分子标志物。; 郭金锋王硕郭天舒李智; 关键词：胃癌

可溶性PD-1、PD-L1分子在肿瘤免疫中研究进展被引量：8: 2015年; 随着对肿瘤免疫耐受和免疫逃逸机制广泛而深入的研究，证实协同刺激分子的异常表达在肿瘤的发生发展中扮演着重要的角色。程序性死亡受体-1（programmed ce11 death-1，PD-1）及其配体 PD-L1（B7-H1）属于 CD28/ B7超家族。PD-1/ PD-L1能够介导负性调控信号，抑制 T 细胞的增殖和功能，减少 IL-2、IL-10、IFN-γ等炎性因子的产生，减弱机体自身抗肿瘤的免疫应答，参与肿瘤的发生发展、侵袭转移、耐药等过程。针对 CTLA-4、PD-1/ PD-L1等抑制性通路的拮抗剂可以解除对 T 细胞功能的抑制，恢复机体抗肿瘤免疫。抗 PD-1/ PD-L1通路的药物更是在黑色素瘤、非小细胞肺癌等领域取得巨大的成功，多项临床试验数据显示这种治疗的平均有效率为30%~50%［1-5］，且不良反应较低。近年来研究发现，许多共刺激分子除了以膜型分子存在外，还存在可溶形式分子。通常，可溶性分子可以通过以下两种方式生成：第一种是膜型分子的蛋白解离，如肿瘤坏死因子（TNF）、IL-1、IL-2等的生成［6］；第二种是通过特定 mRNA 片段编码而成，如IL-4、IL-5、EGFR、INF-α的生成［7］。在恶性肿瘤、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎等多种疾病的患者血清中都可以检测到可溶形式存在的 PD-1及 PD-L1分子［8-13］。那么，可溶性的 PD-1、PD-L1是仅作为膜型分子的储备形式还是可以传递和膜型分子一样的抑制信号，甚至是通过全身血液循环，在远处组织发挥更深更广的抑制效应。笔者就可溶性PD-1及 PD-L1的产生、功能及在肿瘤免疫中的研究进展作一总结。; 王硕曲秀娟刘云鹏; 关键词：可溶性 PD-1 PD-L1 肿瘤免疫

乳腺癌根治术患者化疗相关粒细胞减少与预后的关系被引量：7: 2019年; 目的探讨乳腺癌患者相关粒细胞减少(CIN)与预后的关系。方法选取2010年9月5日至2011年12月29日中国医科大学附属第一医院乳腺外科327例Ⅰ~Ⅲ期乳腺癌患者,患者均进行根治性手术和化疗,记录患者年龄、病理类型、肿物大小、淋巴结转移、HER-2表达、分期、术式、化疗方案等临床指标;对出现CIN患者与未出现CIN患者的无病生存期进行分析,并对预后因素进行Cox回归分析。结果327例患者中,162例(49.5%)患者发生CIN,与未出现CIN患者比较,出现CIN患者具有更好预后(χ^2=4.022,P=0.045)。198例激素受体阳性患者中,出现CIN患者无病生存期显著高于未出现CIN患者(χ^2=9.951,P=0.002)。Cox回归分析显示,CIN不能作为乳腺癌的独立预后因素(P=0.203),但Ⅲ~Ⅳ度CIN可能作为相对独立的预后因素。结论CIN提示乳腺癌患者预后良好,Ⅲ~Ⅳ度CIN对于预后具有更强的提示作用。; 王硕郑新宇; 关键词：乳腺癌化疗粒细胞减少预后

利用TCGA数据集分析AKT3在胃癌中的表达及临床意义被引量：4: 2016年; 目的研究AKT3在胃癌中的表达情况,预测并探讨AKT3参与肿瘤发生发展的可能机制及临床价值。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集胃癌数据集,下载AKT3基因表达谱资料及临床信息资料。分析AKT3表达与胃癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析(GSEA)方法预测AKT3的调控基因。结果 AKT3表达水平与肿瘤浸润深度(P=0.001)、TNM分期(P=0.049)、分化程度(P<0.001)相关,肿瘤恶性程度越高,AKT3表达越高。AKT3高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P<0.001)。AKT3高表达样本富集了细胞黏附、骨架蛋白调控、紧密连接、TGF-β通路等基因集。结论在胃癌中,AKT3高表达是一种预后不良因素,可以作为预测患者转移发生、判断预后的有效生物标志物。; 王硕李智郑春雷曲秀娟刘静曲晶磊车晓芳刘云鹏; 关键词：胃癌预后

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