陈晓珍
- 作品数:2 被引量:9H指数:2
- 供职机构:华南农业大学兽医学院更多>>
- 发文基金:广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 兔肠艾美耳球虫实时荧光定量PCR检测方法的建立被引量:4
- 2015年
- 为建立一种肠艾美耳球虫定量的检测方法,在肠艾美耳球虫核糖体第二内转录间隔区(ITS2)序列设计一对特异性引物,以10倍倍比稀释的已知卵囊含量的肠艾美耳球虫DNA为模板进行SYBR GreenⅠreal-time PCR的扩增和标准曲线的建立。结果显示,最低可检测1个卵囊含量的样品,与同属的黄艾美耳球虫、中型艾美耳球虫、大型艾美耳球虫均不发生交叉反应,重复性变异系数小于2%。表明建立的实时荧光定量PCR检测方法灵敏度高,特异性强,重复性好,可为快速检测肠艾美耳球虫提供有效的方法。
- 许家园程田胡会朋陈晓珍翁亚彪林瑞庆
- 关键词:SYBR实时荧光定量PCR
- 3种兔艾美耳球虫rDNA ITS序列测定与系统进化分析被引量:6
- 2014年
- 为研究内转间隔区(ITS)序列能否作为鉴别不同种兔球虫的分子标记,本试验以兔肠艾美耳球虫、黄艾美耳球虫和大型艾美耳球虫为研究对象,对其核糖体DNA(rDNA)ITS全序列进行PCR扩增,扩增产物纯化后连接至pGEM-T Easy载体上,重组质粒通过菌液PCR鉴定后测序,将测序结果与GenBank中公布的兔球虫ITS序列进行同源性比对,用Mega 5.0绘制系统进化树。结果显示,兔肠艾美耳球虫、黄艾美耳球虫和大型艾美耳球虫ITS序列长度分别为1065、1009和1047bp,与GenBank公布的同种球虫相应序列同源性分别为99.2%、99.0%和94.5%,与其他种球虫序列的同源性为55.3%~82.1%。系统进化树显示兔球虫ITS序列形成单系群,该单系群又根据卵囊外残体的有无分为2个亚群。研究结果表明ITS序列种内同源性高于种间同源性,可作为3种兔球虫种间鉴定的分子标记。
- 许家园廖贵城胡会朋陈晓珍刘丽丹吴松明温远辉刘园翁亚彪林瑞庆
- 关键词:RDNAITS系统进化分析