陈磊
- 作品数：5 被引量：33H指数：4
- 供职机构：安徽农业大学园艺学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金安徽省高校省级自然科学研究项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 石榴木质素合成相关基因PgMYB308的克隆和表达分析被引量：5
- 2017年
- 该研究以‘红玉石籽’(Punica granatumcv.Hongyushizi)石榴为试验材料,采用RACE和RT-PCR方法,获得与木质素的合成相关基因PgMYB308。PgMYB308基因cDNA全长792bp,编码263个氨基酸。分子量为29.56kD,理论等电点为9.07。序列比对和功能域分析发现,PgMYB308包含R2和R3保守域,以及C1、C2、C4和锌指基序。系统进化树分析显示,PgMYB308与其他物种起源相同,而与桉树EgMYB308亲缘关系最近。荧光定量PCR分析表明,PgMYB308在茎、叶和种子等组织中均有表达,其中茎中表达量最高,叶片中表达量最低;PgMYB308在‘突尼斯软籽’中表达最高,而在‘红玉石籽’和‘白玉石籽’中表达量较低;PgMYB308在‘红玉石籽’籽粒的不同时期均有表达,但在花后20d相对表达量最高,以后随发育进程呈现逐渐下降的趋势。
- 黄蓉熊枫陈磊张水明董丽丽
- 关键词：石榴基因克隆
- 石榴对香豆酸-3-羟基化酶C3H基因的克隆和表达分析被引量：3
- 2018年
- 对香豆酸-3-羟基化酶(coumarate-3-hydroxylase,C3H)是木质素合成途径的关键酶。本研究采用RACE方法从‘突尼斯软籽’(Punica granatum cv.Tunisiruanzi)中获得C3H的同源基因PgC3H。该基因开放阅读框为1527bp,编码508个氨基酸。相对分子量为57759.0,等电点为8.37,推测该蛋白定位于叶绿体中。系统进化树分析显示,PgC3H与其他物种起源相同,而与寇阿相思树AkF5H的亲缘关系最近。荧光定量PCR分析表明:PgC3H在花、嫩茎、种皮、叶片四个组织中均有表达,其中嫩茎中的表达量最高,而花中的表达量最低;PgC3H基因在‘突尼斯软籽’籽粒不同发育时期均有表达,呈现先降低、再升高再降低的趋势。30~60d相对表达量逐步下降,后在第75天时表达量升至最高,第90天时急剧下降至最低值,至第120天时维持较低水平表达。该研究对于后续研究PgC3H的功能提供了理论依据。
- 熊枫陈磊刘同瑞王琦刘娜张水明董丽丽
- 关键词：石榴基因克隆
- 石榴肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析被引量：13
- 2016年
- [目的]肉桂酰辅酶A还原酶（CCR）是木质素合成的关键酶。本文旨在通过克隆和鉴定石榴CCR基因（Pg CCR）来探究石榴木质素的合成机制以及培育软籽石榴新品种。[方法]以石榴品种‘红玉石籽’（Punica granatum‘Hongyushizi’）籽粒为材料,利用RACE和RT-PCR的方法,获得Pg CCR基因的全长序列。通过实时荧光定量PCR分析Pg CCR基因在不同品种、不同组织、籽粒不同发育时期的表达水平。[结果]Pg CCR基因c DNA全长序列1 017 bp,编码338个氨基酸,包含被认为是CCR蛋白催化位点的保守序列KNWYCYGK。系统进化树分析表明,Pg CCR与其他物种起源相同,而与葡萄Vv CCR的亲缘关系最近。Pg CCR基因在不同品种的石榴籽粒中均有表达,其中‘红玉石籽’中表达较高,‘会理软籽’和‘突尼斯软籽’中表达量较低。Pg CCR在叶、花、茎中均有表达,茎中的表达量最高,而叶片中的表达量最低。Pg CCR在‘红玉石籽’籽粒的不同时期均有表达,20-80 d相对表达量逐步上升,并在80 d时达到峰值,80 d以后表达量逐渐下降。[结论]克隆得到石榴CCR基因,其表达水平与木质素的合成及含量有一定相关性。
- 董丽丽龚凌燕陈磊涂佳丽张水明
- 关键词：石榴基因克隆
- 石榴果肉PgF3′5′H基因克隆及不同温度处理下的表达分析被引量：4
- 2016年
- 为探讨不同温度处理对采后石榴果肉花青苷含量的影响及花青苷合成相关基因（F3′5′H）在石榴果肉花青苷生物合成途径中的作用,该研究以＂玉石籽＂石榴为试材,于不同温度（0℃、5℃、10℃、15℃）处理下测定石榴果肉花青苷含量,同时利用RACE技术克隆了石榴果肉花青苷合成相关基因,命名为PgF3′5′H,GenBank登录号为KU058892;并利用RT-PCR技术分析PgF3′5′H基因在不同贮期温度下石榴果肉中的表达特性。结果表明：（1）不同温度处理下,石榴果肉花青苷含量随着贮藏时间（0~56d）的增长呈上升趋势;在整个贮藏过程中,15℃条件下,花青苷含量最高,10℃次之,5℃和0℃则处于较低水平;15℃时花青苷含量在14d后表现不稳定。（2）PgF3′5′H基因全长cDNA为1 199bp,开放阅读框918bp,编码305个氨基酸,在N端36~39处含有细胞色素P450家族基因的特征保守氨基酸序列（CYP基序＂PPGP＂）;生物信息学分析表明,该基因编码的氨基酸序列与巨桉的EgF3′5′H2、麻风树的JcF3′5′H2和荷花的NnF3′5′H2氨基酸序列一致性分别高达86%、82%和81%。（3）在0℃、5℃、10℃处理条件下,石榴果肉PgF3′5′H基因表达量随着贮藏时间（0~56d）的延长均呈上升趋势,15℃处理下,石榴果肉PgF3′5′H基因表达量不稳定;石榴果肉PgF3′5′H基因表达与花青苷含量呈显著正相关关系。研究结果为深入探讨采后石榴果肉花青苷的含量变化奠定了基础。
- 关晓弯陈磊涂佳丽张水明
- 关键词：花青苷温度RACE
- 桂花查尔酮异构酶OfCHI基因的克隆与表达分析被引量：10
- 2016年
- 查尔酮异构酶CHI是花青素苷合成途径中的关键酶。为了解桂花花青苷的合成机理,该研究对3个桂花品种的花青苷含量进行了测定。结果显示:(1)‘橙红丹桂’花中的花青苷含量最高,‘金桂’和‘早银桂’中花青苷含量较低。(2)利用RACE和RT-PCR方法获得了桂花查尔酮异构酶基因(OfCHI)的全长cDNA序列1 069bp,该基因编码248个氨基酸,相对分子量为26.85kD,等电点为6.34。(3)多重序列比对显示,OfCHI与金花茶CnCHI、忍冬LjCHI、石榴PgCHI的相似性分别为68.13%、65.86%和63.53%,氨基酸序列中含有CHI蛋白的活性位点Thr47、Tyr108、Met115以及Ser192;系统进化树分析表明,OfCHI与其他物种起源相同,而与油橄榄OeCHI亲缘关系最近。(4)利用qRT-PCR对不同桂花品种、不同组织中OfCHI的表达量检测结果显示,OfCHI在‘橙红丹桂’花中表达量最高,在‘金桂’和‘早银桂’中表达量较低;OfCHI在‘橙红丹桂’、‘金桂’和‘早银桂’的花、茎、叶中均有表达,且表达趋势相同,均为叶中表达量最高。该研究为揭示桂花青素苷的合成机理奠定了理论基础,并为培育不同花色的桂花新品种提供了基因专利。
- 张水明涂佳丽阿不都热扎克.依沙克李川微户倩陈磊董丽丽
- 关键词：桂花花青苷
