何孝凡
- 作品数:3 被引量:22H指数:2
- 供职机构:西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金:四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 藏绵羊脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因的克隆及序列分析被引量:3
- 2010年
- 利用RT-PCR、T-A克隆技术获得了藏绵羊H-FABP基因,并对克隆序列进行分析.结果显示,藏绵羊H-FABP编码基因全长402bp,编码133个氨基酸.将藏绵羊H-FABP基因及氨基酸序列分别与Gene Bank中公布的山羊、水牛、家牛、野牦牛、猪、马、狗7种动物进行序列一致率比对,结果显示,藏绵羊与所选的7种动物的H-FABP基因序列一致率在90.8%~99.5%之间,H-FABP氨基酸序列一致率在93.2%~100%之间.其中,藏绵羊与藏山羊H-FABP基因存在2个位点核苷酸差异:114位碱基位点A→G和第129位碱基位点T→C,但两个位点的核苷酸差异均为同义密码子,藏绵羊与山羊H-FABP氨基酸无差异.
- 韦吉春徐亚欧毛亮袁伟何孝凡
- 关键词:藏绵羊克隆
- 藏系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊线粒体DNA D-LOOP区遗传多样性研究被引量:1
- 2013年
- 为探讨藏系绵羊贾洛类群的起源、进化和遗传多样性,通过对贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊三个群体51只绵羊的线粒体DNA D-LOOP区全序列进行测序分析.结果表明:51条序列长度范围为1032-1331bp,以1181bp为主(含4个75bp重复序列),A%+T%含量大于G%+C%含量,贾洛类群与阿勒泰羊亲缘关系较近,三个绵羊群体有3个独立的母系起源,没有发现羱羊对臧系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊起源有贡献的证据.
- 何孝凡金红胡建徐亚欧
- 关键词:线粒体DNA全序列
- 藏系绵羊、新疆细毛羊及阿勒泰羊mtDNA D-loop基因序列分析及系统进化研究被引量:19
- 2014年
- 为研究藏系绵羊的贾洛、红原、欧拉3个类群与新疆细毛羊、阿勒泰羊的遗传多样性及系统进化关系,试验对该5个类群89个绵羊个体的mtDNA D-loop区全序列进行测序分析。结果显示,该5个绵羊类群89个个体总共发现有168个多态性位点,单一多态位点(singleton variable sites) 82个,简约信息位点(parsimony informative sites)86个,碱基A+T的平均含量达到了62.5%,明显高于C+G(37.5%),共检测到70种单倍型,核苷酸多样性(Pi)在0.01040~0.02892之间,单倍型多样性在0.640~1.000之间,平均核苷酸差异数(K)为18.340,Tajima’s D中性检验发现这5个类群均不显著。通过构建NJ进化树结果表明,在藏系绵羊中红原类群与欧拉类群的亲缘关系最近,其次藏系绵羊中贾洛类群才与红原、欧拉类群聚为一类,再依次聚类的为新疆细毛羊、欧洲摩弗伦羊、东方盘羊;盘羊与羱羊单独聚为一类。该5个类群存在明显的3个母系起源。
- 王康环金红蒋利何孝凡於建国蒋小松徐亚欧
- 关键词:绵羊线粒体D-LOOP系统进化