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刘丽: 作品数：21 被引量：34H指数：3; 供职机构：四川省疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：四川省科技计划项目国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>

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三代宏基因组测序在食源性疾病事件中的应用被引量：1: 2022年; 目的探索三代宏基因组测序在食源性疾病事件中病原菌快速识别的运用。方法随机选取1份2021年四川某地食源性疾病事件中的腹泻样本作为研究对象,应用三代宏基因组建库测序,基于测序数据进行快速识别引起食源性疾病的病原体。结果传统分离鉴定方法经过3 d分离鉴定出由肠炎沙门引起的食源性疾病暴发事件,宏基因组测序6 h就能快速识别出丰度很高的肠炎沙门菌。结论三代宏基因组测序技术在处理食源性疾病事件中时效性性及准确性较高,具有一定的可行性。; 刘丽杨小蓉彭凯孙欣然王乐; 关键词：食源性疾病

四川省部分地区产超广谱β-内酰胺酶的大肠埃希菌检测及分析被引量：2: 2018年; 目的了解四川部分地区产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌的污染情况,为疾病预防治疗提供科学依据。方法采集四川省攀枝花、绵阳、南部县、德阳等地区食品、肉猪肛拭子和腹泻患者粪便样本,用含有头孢噻肟(终浓度为4μg/ml)的缓冲蛋白胨水进行增菌,接种ESBL平板,挑取可疑菌落,运用PCR方法鉴定菌株并检测耐药基因。结果共采集356份样本,其中食品样本186份、患者样本72份、猪肛拭子98份。从202份样本检出产ESBLs大肠埃希菌,检出率为56. 7%。从食品样本中分离出114株,猪肛拭子样本中分离出41株,腹泻患者粪便样本中分离47株;耐药基因显示CTX-M型中Group2型最多,为104株。结论四川省食品、患者、肉猪中产超广谱β-内酰胺酶的大肠埃希菌均有检出,肉猪分离株携带CTX-M耐药基因更广泛。; 刘丽黄玉兰张林雷高鹏吕虹杨小蓉; 关键词：超广谱Β-内酰胺酶大肠埃希菌耐药基因

1998-2007年绵阳市霍乱流行特征及高危因素分析被引量：2: 2008年; 目的分析绵阳市霍乱流行特征,探讨霍乱疫情发生的高危因素,为霍乱防控工作提供科学依据。方法用描述流行病学方法对霍乱疫情流行特征进行分析,对霍乱流行因素进行问卷调查。结果1998-2007年共发生霍乱暴发疫情40次,发病人数255人,农民占霍乱发病人数的54.09%;近4年,80%的霍乱疫情和92.86%(26/27)的患者是由农村群体聚餐引起;乡村医生霍乱流行病学知识知晓率为68.79%;84.62%的农村居民选择在自家举办宴席,78.85%会使用甲鱼;农村村厨卫生安全意识不高;2006-2007年3次在8份市售海水产品中检出O139群霍乱弧菌。结论近年来绵阳发生的霍乱疫情主要由外来污染海水产品引起,农村群体聚餐、村厨、农村居民和村医卫生防病知识缺乏和卫生安全意识淡薄是造成霍乱疫情发生和疫情难以早期发现的主要原因。; 周云刘丽李永清刘昌弟刘友全江智辉; 关键词：霍乱流行病学特征农村聚餐

SPF大鼠感染金黄色葡萄球菌原因的调查分析被引量：5: 2019年; 目的连续监测某实验动物饲养场SPF大鼠携带的金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus(SA)情况,结合该饲养场环境、人员等检测结果,查找污染源,为保障和提高实验动物质量提供依据。方法2011—2017年依据《实验动物金黄色葡萄球菌检测方法(GB/T 14926.14-2001)》对SPF大鼠进行SA监测,并采集饲养环境和饲养人员的样本进行检测。对所有分离的SA菌株应用金黄色葡萄球菌A蛋白(SPA)基因分型和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,分析污染源。结果35份SPF大鼠检出16株SA,检出率45.71%;18份饲养环境和饲养人员样本检出2株SA,检出率11.11%。SPA分型可分成5个型别,T2360为优势型别,主要由2013年和2017年SPF大鼠中的菌株组成。PFGE有5种带型,SA4为主要带型。饲养环境中SA的PFGE带型与2017年SPF大鼠中的完全一致。结论饲养环境中存在的SA与SPF大鼠感染的SA具有紧密联系。; 黄伟峰黄玉兰刘丽张林吕虹雷高鹏李莉刘科亮杨小蓉; 关键词：金黄色葡萄球菌 PFGE分型

四种新型冠状病毒抗原快速检测试剂比对分析: 2023年; 目的对4种市售国产SARS-CoV-2抗原检测试剂进行分析比较,为SARS-CoV-2抗原检测提供参考。方法选择4种市售国产SARS-CoV-2抗原检测试剂盒,分别为试剂A、B、C和D,对54份新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例呼吸道样本进行抗原检测,以实时荧光聚合酶链式反应(Real-time PCR,RT-PCR)检测结果为标准。结果 54份COVID-19病例呼吸道样本,48份为阳性样本,1份为ORF1ab单靶标阳性,3份为N单靶标阳性,2份为阴性。4种抗原检测试剂的阳性率分别为试剂A 56.25%、试剂B 58.33%、试剂C 60.42%及试剂D 58.33%,阳性检出率差异无统计学意义(χ^(2)=0.171,P=0.982)。4种抗原检测试剂检测结果一致性从高到低依次为:试剂B和试剂D>试剂A和试剂B=试剂A和试剂D>试剂B和试剂C>试剂A和试剂C。结论 4种抗原检测试剂的一致性较高,对CT值低于25的样本阳性检出率达64.29%~93.33%,而CT值高于30的样本阳性检出率很低,提示试剂厂家需进一步优化性能,提高检测灵敏度。试剂C为荧光免疫层析法,需要配套使用荧光免疫分析仪,不便于普通群众使用。; 徐朝花刘丽杨慧萍马小珍; 关键词：新型冠状病毒抗原检测

椰毒假单胞菌酵米面亚种选择性分离培养基的比较研究被引量：7: 2018年; 目的比较4种椰毒假单胞酵米面亚种选择性分离培养基(马铃薯葡萄糖琼脂,PDA;改良马铃薯葡萄糖琼脂,mPDA;椰毒假单胞菌酵米面亚种分离琼脂,PCFA;银耳卵黄氯霉素琼脂,TYCA)的分离效果,为修订GB/T4789.29—2003《食品卫生微生物学检验椰毒假单胞菌酵米面亚种检验》提供技术支持。方法接种椰毒假单胞菌酵米面亚种于4种选择性分离培养基,观察各培养基上目标菌菌落形态,计算生长率;接种10种常见致病菌和环境中常见菌于4种选择性分离培养基,进行生长特异性试验;通过直接涂布和增菌划线的加标试验,验证这4种选择性分离培养基对粪便、食品和环境土壤等不同标本/样品中椰毒假单胞菌酵米面亚种的分离检出情况。结果 mPDA和PCFA能够分别抑制8种和6种致病菌的生长,且椰毒假单胞菌酵米面亚种的生长率都高于75%;在mPDA和PCFA上,目标菌与多数杂菌形态有明显区别,而在PDA和TYCA上,形态相近不易区分;在粪便、土壤和食品等不同标本/样品的直接涂布和增菌划线分离的加标试验中,mPDA和PCFA上的检出率均超过80%,明显高于PDA和TYCA。结论 mPDA和PCFA分离效果比原标准的PDA明显提高,建议在标准修订中增加此两种选择性分离培养基。; 黄伟峰黄玉兰杨祖顺张林刘丽李莉杨小蓉; 关键词：培养基食源性致病菌

四川省23株红菇菌的分子鉴定及系统发育分析: 2023年; 目的基于ITS序列对四川省23株红菇菌进行鉴定分析。方法以2020年7月至2022年7月采自四川省部分地区的23株红菇菌为研究材料,采用离心柱法提取基因组DNA后对内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增,并对测序所得序列进行遗传距离分析和发育树构建。结果经鉴定23份红菇菌标本共有19个品种,其中包括3种毒蘑菇:日本红菇、亚臭红菇和密褶红菇。经ITS序列分析,23株红菇菌的平均遗传距离为0.340,其中日本红菇与密褶红菇的亲缘关系较近,遗传距离为0.124。而亚臭红菇与日本红姑、密褶红菇的亲缘关系较远,在0.572~0.581之间。结论 ITS序列初步实现了对红菇菌种类的鉴定和系统发育分析。可以将形态上与可食红菇相似的毒蘑菇进行区分、鉴定,为红菇菌中毒事件的应急处置提供科学的技术手段。; 赵雯霞刘丽张林黄玉兰雷高鹏杨小蓉; 关键词：系统发育分析

四川省514例新型冠状病毒感染者血清抗体水平分析被引量：2: 2022年; 目的了解人感染新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)后血清特异性抗体的变化规律。方法收集四川省514例新型冠状病毒肺炎(Coronavirus Disease 2019,COVID-19)确诊病例及无症状感染者(包括既往感染康复者、正在住院的病例和新病例)不同时间的血清样本1705份,采用直接化学发光免疫分析法检测血清中的IgM和IgG抗体。采用SPSS26.0对IgM和IgG抗体检测数据进行统计学分析,揭示IgM和IgG抗体的动态变化。结果研究共纳入确诊病例352人、无症状感染者162人。自确诊(或2019-nCoV核酸检测阳性)后8~149 d,92.75%~100%的感染者血清中IgG抗体呈阳性;持续至360 d后,仍有超过60%的感染者IgG抗体呈阳性,随时间增加,IgG抗体的S/CO值有下降趋势。连续观察15例感染者在确诊(或2019-nCoV核酸检测阳性)后8~14 d,血清中抗体阳性率达100%,120 d后IgM抗体转为阴性,随病程时间增加IgM抗体的S/CO值变化趋势明显。自确诊(或2019-nCoV核酸检测阳性)0~7 d和23~89 d时,确诊病例组与无症状感染者组IgM抗体阳性率差异均有统计学意义(P<0.05),至150 d后,确诊病例组的IgG抗体阳性率高于无症状感染者组,两者差异有统计学意义(χ^(2)=7.65,P=0.006)。结论不同类型的2019-nCoV感染者血清中IgM和IgG抗体水平随时间变化的规律不同。; 杨慧萍韩媛媛刘丽徐佳楠周丽君黄伟峰张韬; 关键词：新型冠状病毒血清抗体

四川省一些实验动物养殖场SPF大鼠和小鼠肠内容物中金黄色葡萄球菌的检测被引量：4: 2019年; 调查四川省一些实验动物养殖场的实验动物中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)携带情况,找出传播途径和进化规律,分析其污染原因,为保障实验动物质量提供技术支撑。按照GB/T 14926.14-2001《实验动物金黄色葡萄球菌检测方法》对2011年-2017年四川省部分实验动物中SA进行检测,对分离的SA菌株进行PCR耐药基因mecA检测,并应用金黄色葡萄球菌A蛋白(Staphylococcus protein A,SPA)和脉冲场电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)进行分子分型。结果显示,2011年-2017年共从7家实验动物养殖场采集并完成370只实验动物中SA的检测,共检出SA 31株,总分离率为12.16%,且均从SPF大鼠中分离所得。31株SA的mecA基因均为阴性。SPA可分成5个型别,其中T2360为优势型别,PFGE型别有10个带型。四川省养殖实验动物中仅SPF大鼠携带SA,不同年份检出SA基因型别基本不同,不同养殖场同一年检出的SA具有相同基因型,说明不同养殖场中的SA可能来自同一污染源,应加强SPF大鼠监控,以确保实验动物的质量。; 黄伟峰刘科亮刘理达刘丽黄玉兰雷高鹏杨小蓉; 关键词：实验动物金黄色葡萄球菌 PFGE分型

2008-2018年四川省肠炎沙门菌暴发的分子分型比较被引量：3: 2021年; 目的比较四川省肠炎沙门菌暴发菌株的分子分型方法,为暴发溯源提供快速可靠的依据。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点可变数目重复序列分析(MLVA)、规律间隔成簇短回文重复序列(CRISPR)、多位点序列分型(MLST)和基于全基因组测序的单核苷酸多态性(WGS-SNP)对2008—2018年四川省肠炎沙门菌暴发分离株进行分型。以辛普森多样性指数(DI)为指征,比较单一方法及方法联用的分型能力差异。结果PFGE、MLVA、CRISPR和MLST单独使用时,其DI值均<0.9,PFGE_XbaⅠ和MLVA联合使用DI值能提高到0.9以上,WGS-SNP的DI值最高,可达0.971。结论对四川省肠炎沙门菌暴发菌株进行分子分型的最适方法为WGS-SNP,在缺乏基因组分析能力的情况下,推荐使用PFGE_XbaⅠ与MLVA联合的方法。; 肖桃雷高鹏黄伟峰吕虹刘丽杨小蓉何树森; 关键词：肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳全基因组测序分子分型

刘丽

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