李奇威 作品数:13 被引量:47 H指数:4 供职机构: 广东药科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中山市科技计划项目 国家重点实验室开放基金 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 更多>>
基于不同DNA条形码的黄檀属植物分子鉴定 黄檀属(Dalbergia)是广泛分布于南美洲、非洲、亚洲和马达加斯加热带和亚热带地区的树木、灌木植物,其大约包含250个物种。其中一些黄檀属树木被认为是高品质和高价值的木材,如巴西红木(Dalbergia nigra)... 朱爽 李奇威 黄泽波文献传递 降香黄檀DNA提取及其rDNA-ITS序列分子系统发育分析 被引量:4 2016年 以核糖体转录间隔区(rDNA-ITS)序列为分子标记,结合GenBank数据库中已有序列,阐明黄檀属内不同物种之间的分子系统发育关系。通过改良十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取降香黄檀总DNA,利用引物对rDNA-ITS序列进行聚合酶链式反应(PCR扩增)和序列测定。结果表明,基于rDNA-ITS序列测定、位点分析和系统发育树构建方法,可利用ITS序列进行黄檀属树种准确的分子鉴定,为其种类鉴定和种间分类地位提供分子生物学依据。 李奇威 谭贵良 孙瑾 苏越骁 王业胜 周林 朱爽关键词:降香黄檀 DNA提取 ITS序列 分子鉴定 一种降香黄檀的ITS区序列及用其鉴定降香黄檀的方法 本发明公开一种降香黄檀的ITS区序列及用其鉴定降香黄檀的方法,该降香黄檀的ITS区序列的核苷酸性序列如SEQ ID NO:1所示。本发明的方法是采用引物ITS4和ITS5对待测木材样品的DNA进行PCR扩增得到ITS区序... 朱爽 李奇威 王业胜 林月霞 周林文献传递 一种侯钩藤的分子鉴定方法 本发明公开了一种侯钩藤的分子鉴定方法。本发明在首次获得侯钩藤的ITS序列(如SEQ ID NO.1所示)的基础上,以待测样品的总DNA为模板,利用引物ITS5和ITS4扩增得到待测植物的rDNA ITS序列;将rDNA ... 朱爽 王业胜 曾常青 周林 李奇威文献传递 基于DNA条形码的三种沉香属物种鉴定研究 被引量:10 2018年 目的:利用5个DNA条形码(ITS、matK、rbcL、psbA-trnH和trnL-trnF)对3个沉香属物种白木香、马来沉香和Aquilaria crassna Pierre进行分子鉴定,为沉香属药材的种类鉴定和种间分类地位提供分子生物学依据。方法:使用改良CTAB法提取沉香属植物的总DNA,分别对5个条形码序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增与测序。序列经DNAStar软件拼接,MEGA 7.0软件比对分析及计算相关数据,基于K2P模型构建系统发育树。结果:各条形码序列均被成功扩增与测序,其中trnL-trnF由于含有寡核苷酸重复序列而导致测序序列质量低。ITS及matK均能提供较多遗传信息,但在系统发育树中无法准确区分白木香、马来沉香和Aquilaria crassna Pierre这3个物种,而ITS+matK的组合能准确分辨上述物种。结论:ITS+matK组合序列可以用来鉴别沉香属物种,为沉香属药材的种类鉴定和种间分类地位提供分子生物学依据。 朱爽 陈闪冲 李奇威 黄晓莹 章卫民 吴光明 高晓霞关键词:ITS MATK DNA条形码 沉香属 分子鉴定 铁刀木DNA提取及其rDNA-ITS序列的分析 被引量:1 2015年 目的以核糖体转录间隔区(r DNA-ITS)序列为分子标记,对红木木材铁刀木进行遗传分析,并结合Gen Bank数据库中已有的序列阐明黄檀属、紫檀属、决明属之间及属内的分子系统发育关系。方法通过改良CTAB法对铁刀木边材进行总DNA提取,利用引物对r DNA-ITS序列进行PCR扩增和序列测定,用Mega软件进行系统发育分析,构建红木木材的分子系统发育树。结果用改良CTAB法可以成功提取铁刀木边材总DNA,并在模板稀释倍数为1×102~1×103时可成功PCR扩增出r DNA-ITS序列,片段长度大约为730 bp。结论基于通过r DNA-ITS序列进行序列测定和系统发育树构建的分子生物学方法,可利用ITS序列对红木木材铁刀木进行准确的分子鉴定,为红木的种类鉴定和种间分类提供分子生物学根据。 李奇威 谭贵良 孙瑾 苏越骁 王业胜 周林 朱爽关键词:铁刀木 红木 DNA提取 ITS序列 分子鉴定 一种钩藤属植物的rDNA ITS序列分析 被引量:1 2016年 目的以核糖体转录间隔区(r DNA ITS)序列作为分子条形码,对一种常用中药材钩藤进行分子鉴定和遗传分析,并阐明其在钩藤属内种间的分子系统发育关系。方法通过改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法对2015年7月采集的钩藤进行总DNA提取,利用通用引物对rDNA ITS序列进行PCR扩增,经克隆、测序后,运用MEGA软件进行系统发育分析和构建系统发育树。结果测序得到该钩藤的rDNA ITS区序列长度为718 bp,序列分析结果显示其与Gen Bank数据库中已有的钩藤(Uncaria rhynchophylla)rDNA ITS区序列之间相似度达99.8%,并且在系统发育树中并排聚类成一支。结论基于ITS区序列测定分析的分子生物学方法和构建系统发育树的分子遗传学方法,可以对钩藤属药用植物进行分子鉴定和遗传分析,为钩藤属药用植物的种间分类地位以及种类鉴定提供准确的分子证据。 王业胜 李奇威 周林 管润锋 曾常青 朱爽关键词:钩藤 ITS序列 分子鉴定 系统发育树 基于ITS序列的南岭黄檀分子鉴定 被引量:1 2016年 以南岭黄檀(Dalbergia balansae)为研究对象,采用改良CTAB法对南岭黄檀边材进行总DNA提取,利用引物对r DNA-ITS序列进行PCR扩增和序列测定,用MEGA软件进行系统发育分析,构建南岭黄檀及其近缘树种的分子系统发育树。结果表明:用改良CTAB法可以成功提取南岭黄檀边材总DNA,并在模板稀释倍数为1×10-2~1×10-3倍时可成功PCR扩增出r DNA-ITS序列,并基于r DNA-ITS序列测定和系统发育树构建的分子生物学方法,利用ITS序列对南岭黄檀进行分子鉴定,为南岭黄檀的种类鉴定和种间的分类地位提供分子生物学根据。 李奇威 杜贵锋 谭贵良 孙瑾 王业胜 周林 朱爽关键词:南岭黄檀 DNA提取 ITS序列 分子鉴定 华南地区肉芽肿性小叶性乳腺炎患者的细菌鉴定与分析 被引量:13 2016年 目的以细菌16S r DNA序列为分子标记,对12例来自华南地区肉芽肿性小叶性乳腺炎(GLM)患者的脓液标本进行细菌培养和分子鉴定,从而探讨该地区肉GLM与潜在致病细菌之间的关系。方法将收集到的12例脓液标本接种于血琼脂平板,对在平板上生长的细菌进行革兰染色并进行初步的鉴定。进一步通过DNA提取试剂盒提取细菌总DNA并利用通用引物对其16S r DNA序列进行PCR扩增,然后测定其核酸序列,在GenBank中通过BLAST比对查找其同源序列并进行分子鉴定,最后利用MEGA 6.0软件构建所鉴定细菌的分子系统发育树。结果 12例脓液标本经血琼脂平板培养后2例呈阳性,细菌检出率为16.7%,革兰染色结果表明细菌为革兰阳性杆菌。序列分析结果显示两个标本的16S r DNA序列与Gen Bank中已有的棒状杆菌属16S r DNA序列达到99%的相似度,并且在系统发育树中与Corynebacterium kroppenstedtii DNF00591(KJ082041)和Corynebacterium kroppenstedtii CIBU 090024(JF299190)聚类成为一枝。结论基于收集到华南地区12例GLM标本,通过16S r DNA基因测序分析和系统发育树构建的分子生物学方法,能够对GLM的细菌进行鉴定与分析。数据分析结果表明由kroppenstedtii棒状杆菌为致病菌导致华南地区GLM的概率约为16.7%。 王业胜 黄松音 张杰豪 李奇威 周林 饶南燕 朱爽关键词:肉芽肿性小叶性乳腺炎 RDNA 系统发育树 基于DNA条形码的三种药用植物分子系统学研究 三种药用植物沉香、降香、钩藤均具有较多药理活性和较高的药用价值,但存在以假乱真、以次充好及近缘物种难以区分等现象。DNA条形码技术经过10多年的发展与应用,被广泛用于药用植物的物种分类与鉴定,可以弥补传统鉴定方法的不足。... 李奇威关键词:DNA条形码 沉香属 黄檀属 分子系统学 物种鉴定