黄健华
- 作品数:6 被引量:24H指数:3
- 供职机构:中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划上海市科学技术委员会基础研究重点项目中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 家蚕基因特异性CAPs标记获得及其分子系统学应用被引量:8
- 2005年
- 选取家蚕attacin和alphaamylase基因序列,设计特异性引物,在家蚕品系P50、C108和子一代(F1)中扩增。分别采用4种不同的限制性内切酶对扩增产物酶切,最后每个基因都获得了一个CAPs分子标记。依据所得的两个CAPs分子标记对12个品系的家蚕遗传多样性进行了初步研究,构建了其分子系统树。
- 黄健华苗雪霞李木旺张勇赵卫国黄勇平
- 关键词:家蚕CAPS标记多态酶切分子系统树
- 基因表达研究新方法SAGE和GLGI及其在家蚕功能基因组研究中的应用前景被引量:7
- 2004年
- 基因表达序列分析技术 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是用于基因表达水平差异性分析和大规模发现新基因的重要分子生物学技术 ,该技术能反映生物个体在不同的发育时期或生理状态下的基因表达全貌 ,在家蚕功能基因组研究中运用该技术有助于找到一些新基因 ,甚至发现一些涉及发育变态、性别调控和蚕丝产量、质量性状的相关基因。结合标签的基因序列延伸 (generationoflongercDNAfragmentsfromSAGEtagsforgeneidentifica tion ,GLGI)是将从SAGE中得到的 10bp的标签tag经过PCR转化成数百碱基对的 3′EST序列 ,大大增加了tag的特异性。GLGI还有助于充分利用那些没有和GenBank数据库匹配的tag ,因而具有重要的应用价值。
- 黄健华苗雪霞黄勇平
- 关键词:TAG基因基因表达
- 家蚕α淀粉酶基因的多态性研究被引量:4
- 2006年
- 【目的】从分子水平研究不同家蚕品种间淀粉酶基因多态性差异,为家蚕的育种选择和遗传进化研究提供有力的证据。【方法】根据网上基因数据库中的家蚕α淀粉酶基因序列(序列号:U07847),在第4和第5外显子区设计了一对特异性引物,在1个镇江野蚕和6个不同的家蚕品种基因组内进行PCR扩增,发现了该基因区域在不同品种间的多态现象。【结果】根据所得基因测序结果信息,用Clustalx软件进行分析并构建了分子系统树。其聚类结果在一定程度上也比较符合家蚕地理和化性的分布,而且镇江野蚕和家蚕品种距离较远。【结论】家蚕淀粉酶是一个为家蚕的起源和进化密切相关的分子标记基因,值得更深入的研究和探讨。
- 黄健华贾世海张勇李木旺刘文彬苗雪霞黄勇平
- 关键词:家蚕淀粉酶基因分子系统树
- 基于SAGE技术的家蚕基因表达谱研究
- 家蚕(Bombyx mori)是我国重要的经济昆虫,一生经历卵、幼虫、蛹和成虫四个发育时期,是完全变态型昆虫,它是研究昆虫变态发育的理想模式昆虫,也是鳞翅目昆虫的模式代表。研究家蚕生命过程中的各种基因及其表达特征是认识家...
- 黄健华
- 关键词:家蚕SAGE基因功能RNAI
- 文献传递
- 利用SAGE方法分析家蚕基因表达数目的初探被引量:1
- 2005年
- SAGE(serial analysis of gene expression)是基因表达水平差异分析和大规模发现新基因的分子生物学技术。已构建了家蚕卵、幼虫、蛹、成虫等4个不同发育时期的SAGE表达库,经测序分别得到69 100、62 232、63 966和62 666个基因标签序列,其中特异标签数目依次为17 718、13 243、14 044和15 224。这些特异标签数目即为家蚕在这4个不同发育时期的基因转录本数量。根据测序数与获得标签的数量动态监测,发现测序的数目尚未达到饱和,因此基因转录本的数目还可能会有所增加。在上述研究的基础上,利用SAGE数据为基础,采用双倒数作图求最大值的方法,推测出了家蚕在4个不同发育时期的基因表达数目,同时也发现家蚕卵期的基因表达数目远远大于其它3个时期。
- 黄健华王四宝苗雪霞黄勇平
- 关键词:家蚕标签
- 家蚕TCTP基因的克隆、分析及其表达被引量:3
- 2007年
- 【目的】在家蚕基因表达谱研究中鉴定了近4万个特异的SAGE标签,为了研究这些标签所对应基因的功能,选择了其中一个SAGE标签,探索这个SAGE标签对应的基因序列,表达特征以及相关的功能。【方法】在SAGE结合GLGI结果的基础上,利用5’RACE获得基因的全长,根据不同物种间该基因的同源性来构建系统发生树,通过PCR检测该基因在家蚕不同时期、不同组织中的表达特征,并在原核表达系统中表达该基因。【结果】从cDNA中获得了家蚕TCTP基因的全长序列,构建了不同物种间TCTP的系统发生树,PCR结果表明TCTP基因在家蚕的各个时期、各个组织中都稳定的表达,并且成功的在原核表达系统中表达了该基因。【结论】从cDNA中获得了TCTP基因的全长序列,并且成功在原核系统中表达,证明了通过笔者的实验方法能够获得新的基因;系统发生树显示亲缘性越近的物种TCTP间的同源性越高;家蚕TCTP基因在家蚕生命的各个时期、各个组织都有重要的生物学功能;这些工作为进一步研究其具体功能奠定了基础。
- 周博黄健华贾世海张勇黄勇平
- 关键词:家蚕TCTP同源性系统发生树原核表达