基于VHSE(Principal component score vector of hydrophobic,steric,and electronic properties)结构表征方法,采用支持向量机结合遗传算法变量筛选技术,分别建立B*5701和B*5801多肽亲和活性的分类预测模型,其最优线性模型内部验证的灵敏度(Sensitivity,Sen)、特异性(Specificity,Spe)、接受者操作特征曲线下面积(Area under receiver operating characteristics curve,AUC)和马休斯相关系数(Matthews coefficient of correlation,MCC)分别为77.29%、93.99%、93.02%、67.65%(B*5701)和78.08%、89.62%、88.34%、64.73%(B*5801);外部验证的Sen、Spe、AUC和MCC分别为80.02%、94.53%、94.62%、72.09%(B*5701)和77.43%、90.79%、87.98%、66.20%(B*5801)。依据最优模型,分别对B*5701和B*5801配体的亲和特性进行了细致的比较和分析,研究结果可为Abacavir的HLA-B*5701限制性药物毒副作用(Serious Adverse Drug Reactions,SADR)机理研究提供重要的参考依据。
随着高通量基因测序技术的发展,全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)被越来越多地应用到遗传异质性药物毒副作用(adverse drug reactions,ADRs)研究中。越来越多的研究发现:遗传异质性ADRs与人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)密切相关,如阿巴卡韦(abacavir)与HLA-B*5701、别嘌醇(allopurinol)与HLA-B*5801、卡马西平(carbamazepine)与HLA-B*1502等基因关联。针对上述基因关联现象,相继提出半抗原理论、危险因子理论、"P-I"理论以及最新提出的自身免疫机制。本文就遗传异质性ADRs与HLA基因关联及其机制研究的最新进展进行了详细综述。
