马晓慧
- 作品数：19 被引量：44H指数：3
- 供职机构：北京工业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学理学更多>>
- 天然胰岛素及其速效突变体的稳定性研究
- ＜正＞众所周知,胰岛素在糖代谢方面起重要作用。用蛋白质工程方法进行改造的速效胰岛素突变体在治疗糖尿病方面有着实际应用价值。因此,我们以天然胰岛素2Zn及其速效突变体B9D（B9Ser→Asp）、B9E（B9Ser→Glu...
- 王存新马晓慧李春华卢本卓陈慰祖
- 文献传递
- 抗艾滋病毒的药物设计研究
- 本实验室以病毒生命周期中的新靶点整合酶和在病毒进入过程中发挥重要作用的病毒膜蛋白进行了一系列抗病毒药物分子设计的基础及应用研究。
- 王存新孔韧马晓慧谭建军张小轶何红秋陈慰祖
- 关键词：药物设计生命周期整合酶
- 文献传递
- 蛋白质-蛋白质对接及结构预测方法研究
- 王存新陈慰祖李春华苏计国马晓慧常珊焦雄
- 该课题受到国家自然科学基金(30170230，30400087，10174005，10574009)和高等学校博士点基金(20040005013)的资助，在蛋白质-蛋白质对接及结构预测方法学方面进行了一系列基础性研究。蛋...
- 关键词：
- 关键词：蛋白质
- 静电和疏水效应对胰岛素二聚体稳定性的影响被引量：10
- 2001年
- 从猪胰岛素二聚体的结构出发 ,着重研究了胰岛素二聚体单体之间的静电和疏水相互作用 ,用连续介质模型的有限差分方法计算得到胰岛素二聚体的静电势 ,用溶剂可接近表面 (ASA)模型分析了分子表面积及疏水性 ,还考察了不同pH值对胰岛素二聚体静电和疏水相互作用的影响。结果分析表明 ,当pH值处于弱酸弱碱范围内时 (4.6 -8.5) ,静电相互作用能和疏水自由能都呈现出较小的值 ,当pH为6.2时 ,疏水性出现一个明显的峰值 ,这与猪胰岛素二聚体结晶的实验条件相吻合。
- 马晓慧陈慰祖庄彦王存新侯廷军乔学兵徐筱杰
- 关键词：静电作用疏水作用稳定性
- 原胶原分子间的交联结构拉伸力学特性的量子化学计算模拟被引量：1
- 2006年
- 目的了解成骨过程胶原分子组装结构的力学特性;方法采用量子化学计算软件模拟骨I型胶原中的赖氨酸残基-羟赖氨酸残基醛缩交联结构的拉伸力-位移关系。结果模拟结果显示:拉伸力-位移曲线为非线性;初始能量优化后,连接结构分子体系两α碳原子间的起始距离(两端无约束)为10.05?,伸长率达到约130%后,有一个较明显的转折,之后曲线斜率明显高于其前半段;断裂时长度为16.05?;断裂时力值达到最大,为5622pN;断裂发生在羟赖氨酸残基α碳原子和β碳原子间的单键;结论该研究结果为I型胶原分子二元交联结构(bivalentcross-link)的拉伸力学特性提供了一种理论预测,有待实验确证。
- 钟红刚马晓慧袁小龙王存新
- 关键词：量子化学计算
- 蛋白质-蛋白质对接中打分函数的研究被引量：3
- 2003年
- 通过分析蛋白质-蛋白质间的静电、疏水作用和熵效应与相对于晶体结构的蛋白质主链原子的均方根偏差(RMSD)的相关性,定量地考查了它们在蛋白质-蛋白质对接中作为打分函数评价近天然构象的能力。对7个蛋白质复合物体系的分析表明,就水化能而言,原子接触势模型(ACE)优于原子水化参数模型(ASP),且修正的ACE模型具有更好的评价近天然构象的能力;水化能与静电能结合对评价能力有进一步的提高。最后,我们将静电和修正的ACE水化能结合作为打分函数用于36个蛋白质复合物体系的对接研究,进一步证实了这两种能量项的组合能有效地将近天然结构从分子对接模式中区分出来。
- 李春华马晓慧陈慰祖王存新
- 关键词：静电能
- 针对蛋白质复合物Other类型的打分函数被引量：3
- 2006年
- 在不同类型复合物结合界面的物理化学特征不同的基础上,针对较难预测的Other类型复合物设计出特异性打分函数,用于在对接过程中挑选出有效结构.该函数由原子接触能(EACE)、范德华和静电相互作用能组成,通过多元线性回归方法获得各项的权重系数.对来自CAPRIbenchmark1中17个Other类复合物例子进行打分测试.结果表明,组合打分能够刻画出Other类型复合物单体间相互作用的特征,反映出复合物形成前后的能量变化,具备一定的从众多样本中筛选出有效结构的能力.相对于残基成对势(RP),该组合打分获得了更高的打分成功率.对CAPRI第八轮竞赛中两个结构预测模型进行打分排序,该组合打分也体现出强于RP的鉴别有效结合模式潜力.
- 沈龙珠李春华马晓慧常珊陈慰祖王存新
- 关键词：打分函数CAPRI
- 用从头药物设计方法合理设计HIV-1整合酶抑制剂被引量：1
- 2005年
- 目的:合理设计新的HIV-1整合酶抑制剂。方法:采用从头药物设计方法,从苯乙烯基喹啉抑制剂与整合酶的活性位点出发,产生3220个化合物。同时,通过分子对接方法模拟分析这些化合物与整合酶的结合能和结合模式。结果:设计产生的这些化合物能结合于HIV-1整合酶的活性区域中,包含4类在已知苯乙烯基喹啉类抑制剂中没有的新结构:乙烯基萘类、苯乙烯基苯并氮蒽类、苯乙烯基苯并喹啉类和杂环类。结论:本研究对进一步进行苯乙烯基喹啉类抑制剂的结构改造以及研制新的HIV-1整合酶抑制剂具有一定的指导意义。
- 马晓慧陈慰祖王存新
- 关键词：HIV-1整合酶抑制剂分子对接
- 锚定表达GM-CSF疫苗的抑瘤效果研究被引量：3
- 2004年
- 目的:研究锚定表达GM—CSF的小鼠黑色素瘤作为肿瘤疫苗的有效性。方法:GM-CSF基因嵌合GPI信号肽修饰序列实现在B16小鼠黑色素瘤细胞表面的锚定表达,研究锚定修饰的B16细胞于同源C57BL/6小鼠的成瘤性及诱导抗肿瘤免疫的效果。结果:抑瘤实验结果表明,锚定修饰GM—CSF的肿瘤细胞免疫原性增强,成瘤性明显下降;成瘤率为58.8％,而肿瘤对照组为100％。活瘤苗接种实验结果显示锚定修饰的肿瘤细胞可以预防肿瘤的发生,肿瘤发生率仅为20％,说明抗肿瘤的免疫应答有记忆性,能够有效地防止野生型肿瘤细胞的攻击。结论:锚定修饰GM-CSF的肿瘤细胞可以诱导抗特异性的抗肿瘤反应,这种设计可以应用于肿瘤疫苗的研究中。
- 程绍辉马晓慧陈兴于继云
- 关键词：膜表达抗肿瘤免疫
- 分子对接方法及HIV整合酶抑制剂的设计研究
- 蛋白质分子是生命活动的重要物质，它与包括自身在内的生物分子的相互作用是生命自组织复杂体系得以正常调控运转的分子基础，一直备受生命科学领域的关注，是二十一世纪生命科学研究的前沿与热点。继人类基因组计划之后，生命科学已经进入...
- 马晓慧
- 关键词：分子对接计算机辅助药物设计HIV-1整合酶原核表达抑制剂
