王存新
- 作品数：187 被引量：256H指数：9
- 供职机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学文化科学更多>>
- 生物物理课中“互动式”教学方法初探被引量：11
- 2010年
- "互动式"教学模式突出"以人为本"的教育思想,是以培养学生自主意识和创新能力为目标的教学结构模式。在生物物理教学改革中,探索了互动式教学方法的应用,取得了良好的教学效果。
- 李春华张小轶王存新
- 关键词：生物物理互动式教学模式课程教学改革
- 一种非核糖体蛋白质‑RNA复合物近天然结构的筛选方法
- 一种非核糖体蛋白质‑RNA复合物近天然结构的筛选方法，属于蛋白质‑RNA分子对接复合物结构预测领域。首先，通过构象搜索获得蛋白质‑RNA各种可能的结合模式；然后，对其合理性进行评价，其间综合考虑了蛋白质‑RNA分子间的静...
- 李春华张弘古村刘斌谢小露张蕾谭建军张小轶王存新
- 文献传递
- 氨基酸的表面特性和溶剂化自由能
- 1991年
- 我们计算了氨基酸的溶剂可接近面积,局域偶极矩及表面电场.结果显示了亲、疏水基团与水相互作用具有不同的微观本质,由此提出了新的估计氨基酸溶剂化能的方法.
- 陈宏善黄复华辛厚文施蕴渝王存新
- 关键词：氨基酸表面特性
- 全文增补中
- HIV-1跨膜蛋白gp41螺旋结构的原核表达及功能研究被引量：2
- 2008年
- HIV-1跨膜蛋白gp41是HIV-1包膜与靶细胞膜的融合过程中的关键蛋白,是理想的HIV-1融合抑制剂靶点。为开展以gp41为靶点的抑制剂筛选,以HIV-1B亚型病毒基因为模板,通过PCR、酶切、连接等方法构建得到gp415-helix与6-helix重组质粒,转入大肠杆菌BL21(DE3)进行表达,经变性和复性后亲和层析纯化蛋白。经SDS-PAGE鉴定,纯化后蛋白纯度较高。通过非变性凝胶电泳证明gp415-helix与C-多肽衍生物T-20存在相互作用,为下一步药物筛选模型的建立奠定了基础。
- 刘斌何红秋程绍辉陈慰祖王存新
- 关键词：GP41纯化
- 针对蛋白质复合物Other类型的打分函数被引量：3
- 2006年
- 在不同类型复合物结合界面的物理化学特征不同的基础上,针对较难预测的Other类型复合物设计出特异性打分函数,用于在对接过程中挑选出有效结构.该函数由原子接触能(EACE)、范德华和静电相互作用能组成,通过多元线性回归方法获得各项的权重系数.对来自CAPRIbenchmark1中17个Other类复合物例子进行打分测试.结果表明,组合打分能够刻画出Other类型复合物单体间相互作用的特征,反映出复合物形成前后的能量变化,具备一定的从众多样本中筛选出有效结构的能力.相对于残基成对势(RP),该组合打分获得了更高的打分成功率.对CAPRI第八轮竞赛中两个结构预测模型进行打分排序,该组合打分也体现出强于RP的鉴别有效结合模式潜力.
- 沈龙珠李春华马晓慧常珊陈慰祖王存新
- 关键词：打分函数CAPRI
- 抗HIV-1融合抑制剂耐药机制研究
- 谭建军张小轶陈慰祖王存新
- 一种喷雾式微生物液体样品分布装置
- 本发明公开了一种喷雾式微生物液体样品分布装置，包括气囊(1)、吸管(3)和喷雾管(5)，这三者依次紧密相连并可拆卸，吸管上设有刻度(4)，喷雾管(5)末端的喷雾头(6)设有数个均匀分布的液体分配孔，吸管(3)的近气囊端填...
- 王存新刘斌张海锋陈慰祖何红秋谭建军张小轶李春华
- 文献传递
- HIV-1 gp41蛋白与其抑制剂NB-2的结合模式
- 2010年
- 为了设计以HIV-1跨膜蛋白gp41为靶点的抑制剂,采用分子对接、分子动力学模拟及自由能计算方法研究了gp41与其抑制剂NB-2的结合模式,利用从头药物设计方法,通过改造NB-2的结构,设计了有效的gp41选择性抑制剂,并用分子对接方法评价了这些新化合物的结合模式和能力.从分子对接结果得到2种主要的NB-2与gp41的结合模式.分子动力学模拟和自由能计算结果表明,结合模式1优于模式2,所以模式1是比较合理的结合模式.从结合模式1出发设计了103个新的化合物,这些化合物具有已知gp41抑制剂所没有的结构特征且大部分化合物比NB-2与gp41的结合自由能低.得到的结合模式合理解释了NB-2与gp41的相互作用.
- 王存新丛肖静孔韧谭建军陈慰祖
- 关键词：HIV-1GP41抑制剂分子模拟
- 用分子模拟方法研究胰岛素二聚体的相互作用和识别
- ＜正＞ 蛋白质-蛋白质相互作用,包括蛋白质亚基之间、抗原-抗体之间的相互作用与识别,是生命过程中的重要组成部分.近年来,对于蛋白质分子聚集体结构与功能的研究以及如何正确合理地设计出可以造福于人类的新的蛋白质分子聚集体,一...
- 陈慰祖庄彦王存新
- 文献传递
- 基于能量的氨基酸加权网络的构建及其应用
- ＜正＞1 引言蛋白质分子,可视作以氨基酸为节点,以其间相互作用为连接而组成的复杂网络。关于氨基酸网络,尤其是加权的氨基酸网络方面的工作在国际上刚刚起步。诸如什么样的氨基酸网络加权方式更加合理以及网络特征量如何随蛋白质结构...
- 王存新焦雄陈慰祖李春华
- 文献传递
