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不同性别与不同患龋状况儿童唾液微生物群落分析被引量：1: 2009年; 目的:比较不同性别、不同患龋状况儿童唾液样本的微生物群落结构,分析其中主要的功能微生物及其与龋病的相关性。方法:分别采集24例不同性别、不同患龋状况儿童唾液样本,提取细菌总基因组DNA,利用16S rDNA通用引物扩增片段后进行变性梯度凝胶电泳,最后进行测序,比对和聚类分析。结果:不同性别的儿童唾液样本都表现出复杂的微生物多样性。可检出的共同优势菌属为29个,较多属于杆菌和变形菌的β、γ亚纲,占检出微生物的69.0%。唾液样本中检出较多量的链球菌和奈瑟菌,其数量随患龋程度加深而增多。UPGMA聚类分析显示:除中度患龋外不同性别微生物群落具有一定差异性。结论:儿童唾液样本微生物群落多样性较为丰富,其微生物群落随其性别和龋状况不同而有所差异。; 孟玲娜仪虹张坤; 关键词：变性梯度凝胶电泳微生物群落唾液性别

菌B49乙醛乙醇脱氢酶基因克隆中的引物设计被引量：1: 2008年; 为研究乙醛乙醇脱氢酶基因及其在乙醇发酵生物制氢中的重要作用,采用clustalw对12个菌种的乙醛乙醇脱氢酶蛋白质序列进行多重比对分析,共得到6个保守区,以这6个保守区设计引物,共选用9对简并引物,命名为ADHJ1、ADHJ2、ADHJ3、ADHJ4、ADHJ5、ADHJ6、ADHJ7、ADHJ8、ADHJ9.用这9对引物对B49总DNA进行简并PCR,共有两对引物的扩增得到预期的结果.其PCR产物经pMD18-T克隆转化至大肠杆菌DH5α中,经筛选后测序.结果表明,这两段DNA推导的氨基酸序列与Bacillus cereus的乙醛乙醇脱氢酶基因的相似性最高为69%,证实所克隆的序列为乙醛乙醇脱氢酶基因DNA片段.尽管采用clustalw软件设计ADHJ5简并引物的简并度分别达1048576倍和98304倍,引物长度分别为30 bp和26 bp,但扩增结果特异性强.说明采用clustalw软件设计的简并引物可信度高,同时,也说明简并度不是合理评判简并引物质量的标准.; 林海龙任南琪郑国香张坤段志洁

中国城市污水处理厂脱氮除磷工艺的应用与运行现状: 介绍了中国河流湖泊海洋的氮磷污染现状、来源、程度，国家控制水体氮磷污染的水环境标准，城市污水的水质现状和提升污水处理厂脱氮除磷能力的紧迫性。综述了中国现有污水处理厂的发展概况，传统的脱氮除磷工艺如A/O、A2/O、氧化沟...; 王秀蘅李楠任南琪张坤; 关键词：氮磷污染城市污水处理厂脱氮工艺除磷工艺; 文献传递

我国城镇污水处理厂脱氮除磷工艺的应用现状被引量：46: 2008年; 介绍了我国水环境的氮磷污染现状和来源、国家控制水体氮磷污染的水环境标准、提高污水处理厂脱氮除磷能力的紧迫性以及相应污水处理工艺的应用和发展。脱氮除磷工艺如A/O工艺、A2/O工艺、氧化沟工艺,SBR及其变型工艺(ICEAS、DAT-IAT、CASS)和UNITANK工艺在我国都有应用。我国自主开发的倒置A2/O工艺,A-A2/O和改进AB工艺也有很好的发展前景。; 李楠王秀衡任南琪张坤亢涵; 关键词：城镇污水处理厂脱氮除磷处理工艺

生物除磷系统不同阶段性能及微生物群落分析被引量：8: 2009年; 为探讨工艺运行与微生物群落的关系,在厌氧/好氧SBR反应器中考察生物除磷系统的启动期、稳定期和恶化期的性能,并利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术研究该系统各阶段功能微生物群落结构特征.启动期历时26d,包括适应期和上升期两个阶段,磷的去除率从40%以下提高到80%,之后进入稳定期,磷去除率维持在80%以上.稳定期的功能微生物为Tetrasphaera elongate,Gemmatimonas aurantiaca和Uncultured γ-proteobacterium.稳定运行80d后进入恶化期,磷去除率降到70%以下.恶化期和稳定期的微生物群落结构差别很大,功能微生物Uncultured γ-proteobacterium被淘汰,竞争菌Candidatus Competibacter phosphatis clone SBRQ22显著增加.; 任南琪李楠王秀蘅张坤亢涵; 关键词：生物除磷聚磷菌群落结构

高效产氢菌B49菌株adh和L-ldh基因克隆及序列分析被引量：2: 2008年; 设计细菌adh基因和L-ldh基因简并引物,采用降落PCR并结合Cassette PCR方法从高效产氢菌B49中扩增全长基因。共获得两段基因组DNA片段。其中一段序列长1902bp,包括adh基因开放阅读框1101bp,共编码366个氨基酸,编码产物分子量为39.71kD,理论等电点为pH5.93。该基因与Clostridium thermocellum ATCC27405的adh位点序列一致性为73%。另一段序列长2490bp,包括L-ldh基因开放阅读框951bp,共编码316个氨基酸,编码产物分子量为34.23kD,理论等电点为pH6.09。该基因与Bacillus megaterium的L-ldh位点一致性为74%。试验结果表明,采用CodeHop和Genefisher程序化设计的简并引物可信性强,阳性率高,CodeHop设计简并引物效果要好于Genefisher。adh和L-ldh的成功克隆为通过代谢工程手段敲除adh和L-ldh基因提供了科学依据,从而为进一步提高B49产氢能力的代谢工程研究奠定基础。; 林海龙任南琪郑国香张坤; 关键词：引物设计乙醇脱氢酶 L-乳酸脱氢酶

参数可调的自扩展聚类算法及其应用被引量：2: 2007年; 针对大规模样本聚类的时间复杂度过高和聚类结果对经验参数设置的依赖性过强的问题,提出一种基于密度网格可变参数的自扩展聚类算法.算法将数据空间分割成相同大小的网格单元,再将样本归一化后映射到相应的网格单元中,然后从指定密度较大的网格单元向周围扩展,直到其平均密度达到指定的下限或可扩展的聚类边界为止.聚类过程中,通过下限密度和均值密度限制聚类间的过度扩展,如果有效样本的比率低于阈值,则自适应调整扩展密度并重新聚类.仿真试验表明,本算法可以以较小的时间代价获得较高的聚类精度和有效样本率.; 张洪涛张坤马培军; 关键词：模糊神经网络

高温(70℃)玉米秸秆水解液产氢行为及群落结构被引量：2: 2011年; 考察了高温条件下(70℃)牛粪堆肥、土壤、厌氧污泥、腐烂秸秆种接种物利用玉米秸秆水解液的产氢行为。结果表明:牛粪堆肥接种时达到最大的产气量(1355.7mL/L)和氢气产量(608.4mL/L),随后依次为腐烂秸秆、厌氧污泥和土壤。修改的Gompertz方程可以较好描述产氢量随时间变化趋势(R2>0.99)。牛粪堆肥接种时达到最大的产氢潜力(676.0mL/L),而土壤接种时的迟滞时间最小(9.8h)。DGGE图谱显示:不同接种物对应不同的微生物群落结构。Bacillus thermozeamaize,Enterobacter sp.JDM-19和Thermoanaerobacterium polysaccharolyticum strain,KMTHCJT和可能分别是牛粪堆肥,厌氧污泥和腐烂秸秆接种条件下的关键产氢微生物。; 张坤任南琪曹广丽王爱杰; 关键词：生物制氢高温接种物微生物群落结构

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张坤