邓桢
- 作品数：13 被引量：78H指数：7
- 供职机构：南昌大学第一附属医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江西省科技支撑计划项目江西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生电子电信更多>>
- LPS诱导的小鼠腹腔巨噬细胞炎症反应中环状RNA表达谱变化分析被引量：7
- 2017年
- 目的 分析环状RNA（circRNA）在脂多糖（LPS）诱导小鼠腹腔巨噬细胞炎症反应中的表达差异,初步探讨mmu_circ_0000790（以下简称为circ790）对LPS诱导小鼠腹腔巨噬细胞分泌促炎性细胞因子的影响.方法 提取C57BL/6雌性小鼠腹腔巨噬细胞,用1 mg/L LPS刺激巨噬细胞,12 h后收集细胞及上清液,采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测上清液中炎症因子IL-1β、IL-6和TNF-α的含量;利用circRNA芯片检测LPS诱导组（n=3）和空白对照组（n=3）细胞中circRNA表达谱的变化.采用实时荧光定量PCR（RT-PCR）对部分差异表达的circRNA进行验证,并以circ790为研究对象,检测LPS诱导巨噬细胞炎症反应中circ790的动态变化.用小干扰RNA诱导小鼠腹腔巨噬细胞中circ790沉默,检测炎症因子IL-1β、IL-6和TNF-α的表达变化;运用生物信息学方法预测circ790相关的microRNA.结果 与空白对照组相比,LPS诱导巨噬细胞12 h后上清液中IL-1β、IL-6、TNF-α含量明显升高（P〈0.01）,证实巨噬细胞炎症反应模型构建成功.芯片筛查结果提示有34个circRNA的表达在LPS诱导组和对照组之间的差异有统计学意义（P〈0.05）,其中12个circRNA上调,22个circRNA下调.RT-PCR验证结果和芯片结果一致.LPS刺激巨噬细胞3、6、12 h后,circ790表达水平较空白对照组上调了（1.94＆#177;0.15）、（3.18＆#177;0.13）和（4.21＆#177;0.22）倍（P〈0.05）.在转染si-circ790后,IL-6的分泌水平明显降低（P〈0.05）,但对IL-1β和TNF-α的水平没有明显影响（P〉0.05）.生物信息学提示circ790可能通过与microRNA发生相互作用从而调控巨噬细胞炎症反应.结论 LPS诱导小鼠腹腔巨噬细胞炎症反应后,circRNA表达谱发生显著变化,circ790可能参与调控了巨噬细胞分泌IL-6.
- 罗清姚芳苡邓桢苏日古廖岚黄自坤
- 关键词：脂多糖巨噬细胞炎症反应
- 基于PASS技术的EGFR基因突变比例检测方法的建立与评价
- 2023年
- 目的近期临床研究发现EGFR-TKI并非对所有EGFR基因激活突变的NSCLC患者都有效,提示EGFR-TKI的治疗效果也可能与NSCLC患者中EGFR基因突变比例相关。本研究基于平行等位基因特异性测序(Parallel Allele-Specific Sequencing,PASS)方法,建立一个稳定可靠的EGFR突变基因比例检测平台。方法构建野生型和突变型EGFR基因重组质粒,建立EGFR基因突变比例检测的PASS平台,从灵敏度、精密度以及准确度对PASS检测平台进行性能评价。结果建立的PASS平台可用于EGFR基因点突变和缺失突变的检测,能够检测到的最小基因拷贝数为1,能够稳定检测到的最小基因拷贝数为10,在野生型基因中最低能检测出0.01%的突变基因。线性回归分析显示,检测到的突变型/野生型比例与预期的突变型/野生型比例呈良好的线性相关(R_(2)=0.9962)。结论该方法的建立能够对EGFR基因突变比例进行灵敏、准确测定,这对其在临床中的应用奠定了良好的技术基础,对于评价EGFR基因突变比例与EGFR-TKI靶向治疗NSCLC患者疗效的关系也具有重要意义。
- 邓桢曾璐璐呙阳呙阳李俊明李俊明
- 关键词：表皮生长因子受体
- 长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录本1在结核感染中的表达及意义被引量：14
- 2016年
- 目的：探讨长链非编码RNA（lncRNA）肺腺癌转移相关转录本1（MALAT1）在结核感染中的表达及其临床意义。方法采用实时荧光定量PCR（ RT-PCR）技术检测75例肺结核病患者（结核组）及32例健康体检者（健康对照组）外周血单个核细胞（ PBMC）中MALAT1的表达量,分析其与结核病发生发展以及转归的相关性。采用RT-PCR技术检测感染结核分枝杆菌（ Mycobacterium tuberculosis,Mtb）的人巨噬细胞（THP-1）中MALAT1的差异表达；用小干扰RNA诱导THP-1细胞中MALAT1沉默,检测Mtb感染后炎症因子TNF-α、IL-6的表达及THP-1细胞对Mtb杀菌功能的变化。结果 RT-PCR检测结果显示 MALAT1在肺结核患者 PBMC 中的相对表达水平是健康对照组的（4.05＆#177;0.86）倍,差异有统计学意义（P〈0.01）。 MALAT1在初治和复治肺结核病例中表达差异无统计学意义（P〉0.05）；MALAT1随结核病患者肺部空洞累及范围的增加而升高。肺结核患者PBMC中MALAT1表达量随着治疗时间逐渐下降,恢复至正常水平。 THP-1细胞感染Mtb后MALAT1表达显著上调（P〈0.01）；沉默MALAT1的THP-1细胞感染Mtb后TNF-α和IL-6水平显著升高（P〈0.01）。以Mtb感染后0 h时间点的细胞内荷菌量为基准,Mtb感染后72 h时沉默MALAT1的THP-1细胞内Mtb的存活率显著低于对照感染组（P〈0.01）。结论 MALAT1在结核感染过程中表达升高,且与结核的发展和转归有关。下调MALAT1表达可增强巨噬细胞对胞内Mtb的清除能力。
- 黄自坤姚芳苡罗清邓桢彭亦平呙阳李俊明
- 关键词：结核病长链非编码RNA巨噬细胞
- 血清长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录本1在肺结核中的诊断价值被引量：10
- 2017年
- 目的检测肺结核患者血清中长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）肺腺癌转移相关转录本1（metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1, MALAT1）的表达水平，探讨其在肺结核诊断中的应用价值。方法肺结核患者56例、结核潜伏感染者35例及健康对照者40名，采用实时荧光定量PCR检测其血清中MALAT1的表达水平。对16例接受抗结核治疗的肺结核患者治疗前及治疗后3、6个月血清MALAT1水平进行动态监测。应用受试者工作特征曲线（receiver operating characteristic, ROC）分析MALAT1诊断肺结核的敏感度和特异度。两组间比较采用t检验，多组间比较采用方差分析。结果肺结核患者血清MALAT1表达水平为2.10±1.05，显著高于结核潜伏感染者的1.16±0.51和健康对照者的1.02±0.44，差异有统计学意义（F＝28.53，P〈0.01）。痰涂片抗酸阳性的肺结核患者血清MALAT1表达显著高于抗酸阴性的肺结核患者，差异有统计学意义（2.42±1.03比1.43±0.74，t＝2.66，P〈0.01）。与治疗前（2.28±0.79）相比，肺结核患者血清MALAT1表达水平在抗结核治疗后3个月（1.35±0.39）及6个月（1.05±0.30）均显著降低，差异有统计学意义（t值分别为4.33、6.05，P〈0.01）。血清MALAT1诊断肺结核的ROC下面积（area under of ROC curve, AUC）为0.821，敏感度和特异度分别为0.732和0.850。结论肺结核患者血清MALAT1表达水平明显升高，MALAT1有望作为肺结核诊断的潜在生物标志物。
- 罗清姚芳苡彭亦平苏日古邓桢黄自坤
- 关键词：结核长链非编码RNA标志物
- lincRNA-cox2对小鼠腹腔巨噬细胞极化的影响
- 目的:观察小鼠腹腔巨噬细胞不同极化状态下lincRNA-cox2表达变化,初步探讨lincRNA-cox2对小鼠腹腔巨噬细胞极化的影响。方法:以20 ng/ml IFN-γ及100 ng/ml LPS刺激C57BL/6小...
- 黄自坤罗清邓桢李俊明
- 关键词：长链非编码RNA
- 文献传递
- 系统性红斑狼疮患者外周血NK细胞TIGIT的表达和意义被引量：10
- 2018年
- 目的探讨TIGIT在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血NK细胞上的表达及临床意义,以阐明其在SLE发生和发展中的作用。方法应用流式细胞仪检测44例SLE患者和27例健康对照外周血NK细胞表面TIGIT表达水平,比较SLE组和健康对照组以及SLE稳定组与SLE活动组之间NKT细胞表面TIGIT表达水平,并分析其与实验室检查数据及治疗的相关性。2组间比较采用t检验或者非参数检验,2变量之间相关性采用Pearson相关分析。结果 SLE组NK细胞TIGIT表达百分率显著低于健康对照组(P<0.01),SLE组NK细胞TIGIT表达平均荧光强度(MFI)显著低于健康对照组(P<0.05),SLE活动组NK细胞TIGIT表达百分率显著低于SLE稳定组(P<0.05),而SLE活动组NK细胞TIGIT表达MFI与SLE稳定组之间无差异(P>0.05)。SLE患者中抗r RNP抗体阳性组外周血NK细胞TIGIT表达百分率显著低于对应阴性组(P<0.05)。SLE患者NK细胞TIGIT表达百分率与C3呈正相关(P<0.05),与SLE疾病活动度指数(SLEDAI)呈负相关(P<0.05)。经过治疗后SLE患者NK细胞TIGIT表达百分率可明显升高(P<0.05)。结论 SLE患者外周血NK细胞TIGIT表达异常,与SLEDAI、自身抗体产生、炎症有明确的相关性。
- 李雪黄自坤邓桢罗清
- 关键词：系统性红斑狼疮NK细胞
- 长链非编码RNA在脂多糖诱导人巨噬细胞炎症反应中的表达变化被引量：8
- 2017年
- 目的 分析长链非编码RNA（lncRNA）在脂多糖（LPS）诱导人巨噬细胞炎症反应中的表达差异.方法 分离健康者外周血单个核细胞,采用贴壁法培养纯化为巨噬细胞并分为空白对照组和LPS刺激组.用1 mg/L LPS刺激巨噬细胞12 h后收集细胞及其培养上清液,采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测细胞培养上清液中白细胞介素（IL-1β、IL-6）和肿瘤坏死因子-α（TNF-α）含量;利用lncRNA基因芯片检测两组细胞中lncRNA表达谱的变化,筛选出差异表达lncRNA分子并进行分析.采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应（qRT-PCR）对部分差异表达lncRNA分子进行验证;并以NR_028034为研究对象,检测LPS诱导巨噬细胞炎症反应中NR_028034的动态表达变化.结果 ① 与空白对照组相比,LPS诱导巨噬细胞12 h后上清液中炎性细胞因子含量均明显升高〔IL-1β（ng/L）：562.93±61.17比59.74±15.68,IL-6（ng/L）：702.46±92.31比71.66±18.25,TNF-α（ng/L）：794.50±63.89比85.12±22.07,均P〈0.01〕,证实巨噬细胞炎症反应模型构建成功.② 以LPS刺激组与空白对照组表达比值≥2倍且P〈0.05作为差异表达lncRNA.LPS刺激巨噬细胞后差异表达lncRNA有1479条,上调2倍以上的lncRNA共953条,其中上调5倍以上的lncRNA有49条;下调2倍以上的lncRNA共526条,其中下调5倍以上的lncRNA有35条.③ 用qRT-PCR对部分lncRNA进行验证的结果与lncRNA芯片检测结果一致.④LPS刺激巨噬细胞后3、6、12 h,NR_028034表达水平较空白对照组分别上调了（4.41±0.65）、（11.56±2.04）、（18.58±1.36）倍（均P〈0.01）.结论 LPS诱导人巨噬细胞炎症反应后,lncRNA表达谱发生显著变化,lncRNA可能参与调控了巨噬细胞炎症反应.
- 邓桢姚芳苡叶建青徐建青卿城罗清黄自坤
- 关键词：长链非编码RNA脂多糖巨噬细胞炎症反应
- lincRNA-cox2对小鼠腹腔巨噬细胞极化的影响
- 目的：观察小鼠腹腔巨噬细胞不同极化状态下lincRNA-cox2表达变化，初步探讨lincRNA-cox2对小鼠腹腔巨噬细胞极化的影响。方法：以20 ng/ml IFN-γ及100 ng/ml LPS刺激C57BL/6小...
- 黄自坤罗清邓桢李俊明
- 关键词：长链非编码RNA
- 循环lncRNA作为疾病诊断潜在标志物的研究进展被引量：8
- 2017年
- 人类基因组计划研究结果表明，在人类基因中只有不到2％的RNA编码蛋白质，其余均为非编码RNA（non—codingRNA，ncRNA）。根据ncRNA的长度，将ncRNA分为小非编码RNA和长链非编码RNA（longnon-codingRNA，lncRNA），后者碱基长度在200。100000nt之间。
- 邓桢苏日古黄自坤
- 关键词：疾病诊断人类基因组计划标志物非编码RNA编码蛋白质
- lincRNA—cox2对小鼠RAW264．7巨噬细胞极化的影响被引量：3
- 2016年
- 目的观察小鼠RAW264.7巨噬细胞不同极化状态下lincRNA-cox2表达变化，初步探讨lincRNA-cox2对巨噬细胞极化的影响。方法以IFN-γ/LPS刺激小鼠RAW264.7细胞诱导M1型极化，IL-4刺激RAW264.7细胞诱导M2型极化，采用实时荧光定量PCR（RT-PCR）检测各组细胞lincRNA-cox2的表达。设计并合成针对lincRNA-cox2基因的siRNA及无关序列，脂质体转染RAW264.7细胞，48 h后分别加入IFN-γ/LPS或IL-4继续诱导M1/M2型巨噬细胞，采用酶联免疫试验（ELISA）检测细胞因子IL-12及IL-10的分泌量；RT-PCR检测与巨噬细胞极化相关的iNOS、TNF-α、Arg-1、Fizz1的表达。将lincRNA-cox2-siRNA转染M1型巨噬细胞，检测其对M1极化表型的影响。结果RT-PCR结果显示，M1型巨噬细胞的lincRNA-cox2表达水平显著高于未极化细胞和M2型巨噬细胞。与对照组相比，lincRNA-cox2-siRNA转染RAW264.7细胞后，经IFN-γ/LPS诱导的M1型巨噬细胞中IL-12分泌降低，iNOS和TNF-α表达下降；而经IL-4诱导的巨噬细胞中IL-10产生增加，Arg-1和Fizz1表达升高。lincRNA-cox2-siRNA转染M1型巨噬细胞后，IL-12分泌降低，IL-10产生增加，其特点向M2样巨噬细胞转换。结论lincRNA-cox2参与调控小鼠巨噬细胞的极化，促进M1型巨噬细胞极化，抑制M2型巨噬细胞极化。
- 黄自坤姚芳苡罗清叶建青邓桢呙阳江红李俊明
