叶琛
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院生物物理研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金河北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 产油细菌中的中性酯储存机制研究
- 2016年
- 传统化石燃料的日渐枯竭迫使我们寻找新型可再生清洁能源。与此同时,随着大气中二氧化碳的浓度的日益升高,温室效应越来越严重。人工构建以阳光为能源、以二氧化碳为原料合成高能源物质长链脂质的光合产油菌可以同时解决这两个问题。自然界已存在多种光合菌,这些光合菌虽然能够利用太阳光能固定二氧化碳产烃和产脂肪酸,但产率较低。其中一个关键原因是这些光合菌缺乏有效的脂质储存机制。首先要研究清楚产油细菌中的中性酯储存机制,发现构建光合菌的基本元件,然后构建和优化光合产油菌。这里我们选取浊红球菌Rhodococcus opacus PD630为模式生物进行相关研究。(1)完成了一株高效产油菌的基因组测序工作,并使用比较基因组学等生物信息学技术比较了其转录组和蛋白组,找到与脂滴形成的关键蛋白。(2)利用生物化学、分子生物学和信息生物学等多学科交叉方法,寻找并分析研究对脂滴形成和动态变化的关键蛋白,例如目前正在研究的SNARE样蛋白和Dynamin样蛋白等。(3)将脂滴形成或脂质代谢相关的目标基因整合至光合蓝细菌中。(4)利用Rhodococcus sp.RHA1强大的降解能力有效清除污染物,并将这些污染物转化为甘油三酯作为生物柴油的原料。
- 丁云峰杭海英刘平生叶琛
- 关键词：生物能源脂滴
- 高质量抗体揭示Rad1蛋白在细胞中新的潜在活动机理（英文）
- 2016年
- 一组在进化上(从酵母到人)保守的基因Rad9、Rad1和Hus1在细胞周期监控点调控和DNA损伤修复中发挥重要作用.这三个蛋白可以形成环形异源三聚体,即9-1-1蛋白复合体.9-1-1复合体被认为是Rad9、Rad1和Hus1行使功能的主要形式.到目前为止,没有一个好的抗Rad1的抗体,严重阻碍了对Rad1和9-1-1复合体的研究.在本研究中,我们成功地制备了一株小鼠抗Rad1蛋白的单克隆抗体.这个抗体能够有效地检测小鼠和人的内源Rad1蛋白,可以用于酶联免疫吸附、蛋白质免疫印迹、免疫共沉淀和免疫荧光等实验.利用该抗体,我们发现在DNA损伤剂羟基脲(HU)的诱导下,小鼠Rad1蛋白在Rad9+/+小鼠胚胎干细胞中表达明显增加,而在Rad9-/-的小鼠胚胎干细胞中没有观察到该现象,这表明Rad9对Rad1的蛋白表达有调控作用.此外,内源的Rad1蛋白主要分布在细胞质中,在HU处理后并没有迁移进入细胞核的现象,这与先前广泛被人们所接受的在DNA损伤压力下Rad1和Hus1能够迁移进入细胞核并与Rad9形成9-1-1蛋白复合体的说法相矛盾.综合看来,Rad1和9-1-1蛋白复合体的分子作用机制比预期的要复杂,我们成功制备的Rad1单克隆抗体将成为研究Rad1以及9-1-1蛋白复合体的强有力的工具.
- 王海凤安莉莉孙爽陈川叶琛杭海英张秀军
- 细胞周期监控点蛋白Rad9与非同源末端连接修复蛋白Ku70的相互作用研究（英文）被引量：1
- 2018年
- Rad9是一种重要的细胞周期监控点调控蛋白.越来越多的证据显示,Rad9也可与多种DNA损伤修复通路中的蛋白质相互作用,并调节其功能,在DNA损伤修复中发挥重要作用.非同源末端连接修复是DNA双链断裂的一条重要修复途径.Ku70、Ku80和DNA依赖的蛋白激酶催化亚基(DNA-PKcs)共同组成DNA依赖的蛋白激酶复合物(DNA-PK),在非同源末端修复连接中起重要作用.本研究中,检测到Rad9与Ku70有直接的物理相互作用和功能相互作用.我们在不同的细胞模型中发现,Rad9基因敲除、Rad9蛋白去除或Rad9表达降低会导致非同源末端连接效率明显下降.已有的研究表明,DNA损伤可导致细胞中Ku70与染色质结合增加及DNA-PKcs激酶活性增强.我们的结果显示,与野生小鼠细胞相比,Rad9基因敲除的小鼠细胞中, DNA损伤诱导的上述效应均减弱.综上所述,我们的研究首次报道了Rad9与非同源末端连接修复蛋白Ku70间有相互作用,并提示Rad9可通过调节Ku70/Ku80/DNA-PKcs复合物功能参与非同源末端连接修复.
- 范英俊刘宇恒王玉兰孔冰洁赵云赵云叶琛安莉莉
- 关键词：KU70
