张倩
- 作品数：8 被引量：41H指数：4
- 供职机构：北京市昌平区结核病防治所更多>>
- 发文基金：首都卫生发展科研专项北京市科技计划项目北京市科委重大项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- GeneXpert MTB/RIF技术对结核病及对利福平耐药性检测的价值被引量：9
- 2020年
- 目的分析基层结核病防治所采用GeneXpert MTB/RIF(简称"GeneXpert")技术对结核病及其对利福平耐药性检测的可行性。方法回顾性分析2019年1月1日至12月31日就诊于北京市昌平区结核病防治所的全部肺结核可疑症状者,共计1719例。对1719例肺结核可疑症状者开展痰涂片、罗氏固体培养、GeneXpert检查,其中经临床和实验室检测结果证实为其他疾病的患者587例,非活动性肺结核患者550例,共确诊582例活动性肺结核患者。582例活动性肺结核患者中,237例患者有实验室病原学依据(同一例患者同一份痰标本同时经过罗氏固体培养后采用结核分枝杆菌MPB64抗原进行菌种鉴定,以及采用GeneXpert检测系统进行检测),诊断为病原学阳性患者,其余345例患者为临床诊断患者。对237例患者的痰标本分别进行阳性检出率的比较,以及采用罗氏固体比例法和GeneXpert技术对利福平耐药性进行检测。采用χ^2检验对计数资料进行比较;当理论频数小于5时,采用Fisher精确概率法进行比较,以P<0.05为差异有统计学意义。结果237例病原学阳性患者中,痰涂片阳性检出率为25.3%(60/237),罗氏固体培养为79.7%(189/237),GeneXpert技术为96.2%(228/237);GeneXpert的阳性检出率明显高于罗氏固体培养和痰涂片检查,差异均有统计学意义(χ^2=249.742,P<0.001;χ^2=30.332,P<0.001)。以罗氏固体比例法利福平耐药性检测结果为参考标准,GeneXpert技术对利福平耐药的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、一致率分别为99.6%(232/233)、100.0%(4/4)、100.0%(232/232)、80.0%(4/5)、99.6%(236/237)。结论GeneXpert技术对病原学阳性患者的检出率和对利福平耐药性检出率均较高,对基层开展结核病检测及耐利福平结核病检测具有较高的价值。
- 唐桂华孙倩王潇凡咸海滨张倩杨小薇王莉
- 关键词：微生物敏感性试验利福平核酸扩增技术
- 北京市昌平区耐多药结核分枝杆菌对新抗结核药品的耐药情况分析
- 2021年
- 目的探讨北京市昌平区耐多药结核分枝杆菌对左氧氟沙星(levofloxacin,Lfx)、莫西沙星(moxifloxacin,Mfx)、贝达喹啉(bedaquiline,Bdq)、利奈唑胺(linezolid,Lzd)、氯法齐明(clofazimine,Cfz)和德拉马尼(delamanid,Dlm)的耐药特点和耐药突变类型,为临床用药提供依据。方法收集2011—2015年北京市昌平区结核病防治所收治的经分离培养及菌种鉴定后获得的83株耐多药结核分枝杆菌。采用最低药物浓度法对耐多药结核分枝杆菌进行药物敏感性检测,并扩增耐药相关基因序列,将耐药基因测序结果与标准株进行比对分析。结果 83株耐多药结核分枝杆菌菌株对Lfx和Mfx的耐药率最高,均为41.0%(34/83);对Bdq的耐药率最低,为2.4%(2/83),对Lzd、Cfz和Dlm的耐药率分别为4.8%(4/83)、3.6%(3/83)和4.8%(4/83)。39株对Lfx和Mfx耐药的菌株中,gyrA基因第94位密码子的碱基替换是最常见的突变类型,占87.2%(34/39)。2株Cfz-Bdq交叉耐药菌株均在Rv0678基因中存在突变。4株Lzd耐药菌株中有2株存在rplC基因突变。4株Dlm耐药菌株中,1株突变发生在fbiC基因的第318位密码子,2株发生在ddn基因的第81位密码子。结论北京市昌平区耐多药结核分枝杆菌对Lfx或Mfx耐药率较高,对Bdq的耐药率较低;应根据本地区耐多药结核病患者的特点选择耐药率较低的药品。
- 刘新宇张倩孙倩
- 关键词：分枝杆菌结核结核抗多种药物性
- 扩增子测序技术检测石蜡包埋组织标本耐药结核基因的研究被引量：5
- 2020年
- 目的 用基于多重PCR (multiplex PCR,mPCR)扩增子的二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术(mPCR-NGS)检测MTB的耐药基因突变,并评估其检测石蜡包埋组织标本诊断耐药结核病的临床应用价值.方法 选取北京市昌平区结核病防治所2013年4月至2015年10月常规进行了利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星和氧氟沙星比例法检测且具有药敏试验结果的50株MTB临床分离株,包括42株耐药MTB和8株敏感MTB菌株.参考耐药基因数据库及相关文献,针对以上8种抗结核药物主要耐药基因及常见位点设计耐药基因组合,建立有效的检测方案.收集首都医科大学附属北京胸科医院病理科2017年11月至2018年9月耐药结核病患者55例的石蜡包埋组织标本,探针熔解曲线法检测结果为利福平、异烟肼、乙胺丁醇和氟喹诺酮类至少存在一种耐药相关基因突变.首先对已知表型药敏试验结果的MTB临床分离株进行mPCR-NGS检测,验证该方法检测纯菌样本的有效性,再进一步检测结核病患者石蜡包埋组织标本进行临床验证.主要评价指标为敏感度和特异度以及一致性.结果 以比例法为金标准,mPCR-NGS检测利福平、异烟肼、链霉素和乙胺丁醇的敏感度分别为95% (38/40)、93%(27/29)、93% (27/29)和72%(13/18),特异度分别为100%(10/10)、95% (20/21)、100%(21/21)和94%(30/32);二线注射类药物卷曲霉素、卡那霉素和阿米卡星敏感度均为100% (2/2,3/3,3/3),特异度分别为98%(47/48)、100%(33/33)和100%(47/47);氧氟沙星的敏感度为70%(7/10),特异度为100%(40/40).总符合率为94%,一致性检验Kappa值为0.87.纳入的55例石蜡包埋组织标本经探针熔解曲线法检测,28例利福平耐药,37例异烟肼耐药,13例乙胺丁醇耐药,17例氟喹诺酮类耐药.mPCR-NGS与探针熔解曲线法比较,利福平、异烟肼、乙胺丁醇和氟喹诺酮类的敏感度分别为100%(28/28)、95%(35/37)、100%(13
- 宋婧张治国董宇杰杜伟丽王宇轩刘子臣李琨张倩孙倩车南颖
- 关键词：分枝杆菌结核石蜡包埋组织基因测定
- 扩增子测序技术检测石蜡包埋组织标本耐药结核基因的研究
- 2020年
- 目的用基于多重PCR(mutiplex PCR,mPCR)扩增子的二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术(mPCR-NGS)检测MTB的耐药基因突变,并评估其检测石端包埋组织标本诊断耐药结核病的临床应用价值。方法选取北京市昌平区结核病防治所2013年4月至2015年10月常规进行了利福平、异烟阱、乙胺丁醇、链霉素、卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星和氧氟沙星比例法检测且具有药敏试验结果的50栋MTB临床分离株,包括42株耐药MTB和8株敏感MTB菌株。参考耐药基因数据库及相关文献,针对以上8种抗结核药物主要耐药基因及常见位点设计耐药基因组合,建立有效的检测方案。收集首都医科大学附属北京胸科医院病理科2017年11月至2018年9月耐药结核病患者55例的石蜡包埋组织标本,探针熔解曲线法检测结果为利福平、异烟腓、乙胺丁醇和氟喹诺酮类至少存在一种耐药相关基因突变。首先对已知表型药敏试验结果的MTB临床分离株进行mPCR-NGS检测,验证该方法检测纯菌样本的有效性,再进一步检测结核病患者石蜡包埋组织标本进行临床验证。主要评价指标为敏感度和特异度以及一致性。结果以比例法为金标准,mPCR-NGS检测利福平、异烟阱、链霉素和乙胺丁酶的敏感度分别为95%(3840)、93%(2729)、93%(217129)和72%(13/18),特异度分别为100%(10/10)、95%(20/21)、100%(21/21)和94%(30/32);二线注射类药物卷曲霉素、卡那霉素和阿米卡星敏感度均为100%(22,3/3,3/3),特异度分别为9%(47148)、100%(3/33)和100%(4747),氧氟沙星的敏感度为70%(710),特异度为100%(40/40)。总符合率为94%,一致性检验Kappa值为0.87。纳人的55例石蜡包埋组织标本经探针熔解曲线法检测,28例利福平耐药,37例异烟腆耐药,13例乙胺丁醇耐药,17例氟喹诺酮类耐药。mPCR-NGS与探针熔解曲线法比较,利福平、异烟阱、乙胺丁醇和氟喹诺郦类的敏感度分别为100%(28/28)95%(35/37)、:100%(1
- 宋婧张治国董宇杰杜伟丽王宇轩刘子臣李琨张倩孙倩车南颖
- 关键词：石蜡包埋组织抗药性基因测定
- 我国结核分枝杆菌gyrA不同突变类型对氟喹诺酮类药物耐药水平的相关性研究被引量：20
- 2016年
- 【摘要】目的研究gyrA基因在我国耐氟喹诺酮类药物结核分枝杆菌菌株中的突变特征，以及不同突变类型与氟喹诺酮类药物最低抑菌浓度（MIC）的关系。方法2007年我国开展结核病耐药基线调查，调查选取了70个调查点，共分离结核分枝杆菌4017株，其中145株为对氧氟沙星耐药的结核分枝杆菌菌株，有7株菌株在传代中发生污染或传代失败，本研究共纳入138株对氧氟沙星耐药的结核分枝杆菌菌株。对上述菌株的氟喹诺酮类药物耐药相关基因（gyrA）进行测序，分析耐药相关基因突变的特征；用微孔板稀释法检测这些菌株对氧氟沙星、左氧氟沙星和莫西沙星的MIC，统计不同突变类型菌株对氟喹诺酮类药物耐药率的差别。采用SPSSIi．0统计软件进行统计学处理，同种突变类型对不同氟喹诺酮类药物耐药率的比较采用Fisher确切概率法进行检验，以P〈O．05为差异有统计学意义。结果在138株氧氟沙星耐药菌株中，总计有90株（65．200）检测到氟喹诺酮类药物耐药相关基因gyrA发生突变，其中最常见的突变发生在第94位点（34．8％，48／138）。gyrA基因第88、89和91这3个位点的突变菌株（分别为2株、3株和5株），除莫西沙星有2株在91位点表现为高水平耐药，其余均表现为对3种氟喹诺酮类药物低水平耐药；第94位点突变类型较多，导致不同的耐药水平，第94位点天冬氨酸突变为天冬酰胺时氧氟沙星、左氧氟沙星和莫西沙星的高水平耐药比例分别为80．0％（8／10）、30．0％（3／10）和100．0％（10／10）；此外，1株第94位点天冬氨酸突变为半胱氨酸的菌株同时表现为对3种氟喹诺酮类药物的高水平耐药；而第94位点突变为丙氨酸时与低水平氟喹诺酮类药物耐药有关，其对氧氟沙星、左氧氟沙星和莫西沙星低水平耐药率分别为91．7%（11／12）、100．0％（12／12）和58�
- 张治国杜春英张倩王玉峰逄宇赵雁林
- 关键词：分枝杆菌氟喹诺酮类氧氟沙星
- 2009和2019年北京市非结核分枝杆菌流行特征比较被引量：3
- 2021年
- 目的 分析北京市非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)分离率及菌种分布情况,为科学制订北京地区分枝杆菌病的预防和控制策略提供理论依据。方法 采用回顾性调查方法,采用微阵列基因芯片法对本实验室2009和2019年度经对硝基苯甲酸(PNB)鉴别培养基鉴定为非结核分枝杆菌的菌株进行菌种鉴定,基因芯片检测技术与表型方法检测结果不同的菌株,经传代分离纯化后提取核酸对16SrRNA基因测序进行最终鉴定,两个年度非结核分枝杆菌分离率、菌种分布及流行病学情况均采用SPSS 17.0统计软件进行统计分析。结果 2009年分枝杆菌培养阳性菌株1 552株,鉴定出非结核分枝杆菌45株,分离率为2.90%,共分离出9个分枝杆菌菌种,2019年分枝杆菌培养阳性菌株1 254株,鉴定出非结核分枝杆菌81株,分离率为6.46%,共分离出9个分枝杆菌菌种;2009年缓慢生长型占86.67%,快速生长型占13.33%,2019年缓慢生长型占59.26%,快速生长型占40.74%,2009和2019年两年NTM分离率(χ^(2)=21.065,P﹤0.001)、菌种分布(χ^(2)=19.602,P=0.014)比较,差异均有统计学意义。2009年感染者中年龄在40岁以上人群占77.78%,2019年感染者中,年龄在40岁以上人群占67.90%;两个年份的年龄分布比较,差异具有统计学意义(χ^(2)=10.527,P=0.015),NTM分离率在0~19岁、20~39岁及60岁以上年龄段差异无统计学意义,在40~59岁年龄段差异有统计学意义(χ^(2)=9.800,P=0.002)。结论 北京地区非结核分枝杆菌分离率呈显著增高趋势,菌种分布从缓慢生长型占绝对优势向快速生长型、缓慢生长型趋于平均化转变,北京市40岁以上患者为高危人群,应积极开展分枝杆菌菌群、菌种鉴定。
- 杨新宇张洁易俊莉赵琰枫陈昊陈双双代小伟丁北川孙闪华李波张治国张倩李元悦宋卫萍李传友
- 关键词：分枝杆菌非结核分枝杆菌分离率菌种分布
- 北京市昌平区2016年和2019年耐药监测分析
- 2021年
- 目的分析2016年和2019年北京市昌平区结核病防治所就诊患者的耐药情况.方法对2016年和2019年痰培养阳性患者分离株进行固体药物敏感性试验,并对其相应药敏结果的一线及二线抗结核药物情况、非结核分枝杆菌构成比及非结核风险因素等指标进行系统分析.结果北京昌平地区2016年和2019年不同药物耐药率之间无统计学意义(P>0.05).耐多药结核病(MDR-TB)的比率分别是2.07%(5/243)和3.68%(7/190),两年份之间耐多药比率无统计学意义(P>0.05).2016年耐药比例为14.88%(36/242),敏感菌株比例为85.12%(206/242),2019耐药比例为32%(54/190),敏感菌株比例为68%(136/190),两年份之间总的耐药比例具有统计学差异(P<0.05).2016年和2019年非结核分离株比例分别为1.22%(3/245)和5.00%(10/200).其中在非结核病风险因素分析中,男性相比于女性不易感染非结核分枝杆菌(OR=0.6795),年龄<45岁的人群相比年龄≥45的人群不易感染非结核分枝杆菌(OR=0.2289).结论耐药结核病在本地区仍然是重要挑战,且本地区非结核病呈现一种上升趋势,此地区女性和45岁及以上人群仍是非结核病监测和防控关注的重点对象.
- 刘新宇张倩吴进凤李元悦韩露孙倩
- 关键词：耐药结核病耐药监测非结核分枝杆菌
- Genotype MTBDRplus检测结核分枝杆菌耐药性的临床应用研究被引量：4
- 2018年
- 目的探讨Genotype MTBDRplus检测结核分枝杆菌(MTB)耐药性的临床适用性。方法对2013-2015年昌平区结核病防治所479株培养分离菌株进行Genotype MTBDRplus检测和比例法药敏试验,并对结果进行分析比较。结果479株培养分离株中,有434株两种检测方法均显示为MTB,对这434例MTB的分离株使用Genotype MTBDRplus检测进行分析,其对利福平(RIF)耐药性的灵敏度和特异度分别为96.55%(28/29)和99.51%(403/405),两种检测方法的符合率为99.31%(431/434);突变位点主要为S531L;对异烟肼(INH)耐药性的灵敏度和特异度的分别为88.14%(52/59)和94.93%(356/375),两种检测方法的符合率为94.01%(408/434),突变位点主要为C15T和S315T1。结论 Genotype MTBDRplus检测能快速提供RIF和INH耐药结果,是传统比例法药敏试验的有效补充。
- 孙倩张倩张治国
- 关键词：结核分枝杆菌GENOTYPE耐药突变
