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嗜热链球菌CRISPR-Cas系统的检测被引量：3: 2016年; 【目的】CRISPR-Cas系统为嗜热链球菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,分析NCBI中已公开发表全基因组序列的9株嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统的数目和类型,对实验室相应菌株的CRISPR-Cas系统进行检测。【方法】利用生物信息学方法对NCBI中9株已测序嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统进行分析,根据其Cas基因序列设计引物,对实验室嗜热链球菌菌株的Cas基因进行扩增、测序,分析实验室6株嗜热链球菌的CRISPR-Cas系统情况。【结果】9株标准菌株均含不同数目的CRISPR-Cas系统,其类型主要为Ⅱ-A型、Ⅲ-A型和Ⅰ-E型,各类型的标志Cas基因高度保守。6株供试菌中,S4仅含Cas9基因,其它5株均含有Cas9基因、Cas10基因和Cas9*基因,79和KLDS3.0207还含有Cas3基因。【结论】可根据标准菌株高度保守的Cas基因设计引物,预测未知嗜热链球菌所含CRISPRCas系统的数目和类型。S4仅含1个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统,其它5株均含有2个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统和1个Ⅲ-A型CRISPR-Cas系统,此外,79和KLDS3.0207均含有1个Ⅰ-E型CRISPR-Cas系统。; 李婉梁宏彰张丹青王娜娜唐雅茹李柏良霍贵成; 关键词：嗜热链球菌 CAS 生物信息学分析

乳酸菌CRISPR-Cas系统同源性分析: 2016年; CRISPR-Cas系统为乳酸菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,利用生物信息学方法分析了CRISPR序列及cas基因在乳酸菌种间的同源性关系。利用生物信息学方法预测NCBI中已测序的部分乳酸菌所含CRISPRCas系统,并对重复序列和Cas蛋白序列进行系统发生学分析。结果显示,嗜热链球菌、德氏乳杆菌和瑞士乳杆菌标准菌株均含不同数目的 CRISPR-Cas系统,各类型的重复序列高度保守,Cas蛋白序列同源性较高。CRISPR-Cas系统的同源性与其亚型密切相关,而与菌种亲缘关系有较大差异,证明了CRISPR-Cas系统能够通过基因水平转移传播这一结论。; 李婉张丹青王娜娜霍贵成; 关键词：乳酸菌 SHORT 同源性

潜在应用乳酸菌安全性的初步评价: 乳酸菌在食品、药品、饲料等行业得到广泛应用，与人们的生活息息相关。近年来，一系列食品安全事件的曝光将人们的注意力集中到食品的安全性上。乳酸菌作为食品发酵剂具有悠久的使用历史，一直以来被认为是安全的(Generally R...; 张丹青; 关键词：乳酸菌安全性抗生素抗性

五株嗜热链球菌抗药性研究被引量：2: 2016年; 采用药敏纸片法研究了五株高产粘嗜热链球菌(KLDS3.1012、KLDS3.1014、KLDS-SM、KLDS3.0206、KLDS3.0207)对15种抗生素的敏感性,结果发现,KLDS3.1014对两种抗生素有抗性,KLDS3.1012、KLDS-SM、KLDS3.0206对3种抗生素有抗性,KLDS3.0207则表现出多重抗药性。对五株嗜热链球菌耐四环素基因(tet M,tet S,tet L)、耐红霉素基因(erm A,erm B,msr A/B)和耐氯霉素基因(cat)的初步研究表明,四环素耐受基因、红霉素耐受基因以及氯霉素耐受基因不位于基因组DNA上,同时,受试菌株均无质粒,因此可以初步判断受试菌株抗药性不会进行传递。; 张丹青李婉丁秀云Shuvan Kumar Sarker霍贵成; 关键词：嗜热链球菌抗药性纸片扩散法抗药基因质粒

嗜热链球菌CRISPR序列的检测及原间隔序列预测被引量：2: 2016年; CRISPR基因座中的间隔序列能够提供特异性免疫使宿主得以对抗那些携带相同序列的入侵元件,本研究旨在预测实验室3株嗜热链球菌的原间隔序列,为探究其抗噬菌体机制奠定基础。本文检测了3株嗜热链球菌的CRISPR序列,预测嗜热链球菌CRISPR基因座的活性,构建重复序列的系统发育树,并对间隔序列进行同源性分析。结果显示供试菌S0含有3个CRISPR,S4仅含1个CRISPR,79含有4个CRISPR,CRISPR1基因座活性最高,CRISPR2基因座最不活跃。重复序列与标准菌株的相应重复序列高度保守,不同CRISPR的间隔序列在内容及数目上高度可变,它们的原间隔序列绝大部分来源于噬菌体,少数来源于质粒或染色体序列。供试菌79与嗜热链球菌MN-BM-A02及嗜热链球菌ASCC 1275的4个CRISPR序列均高度一致,推测其菌株同源性较高。验证了间隔序列是由宿主遭受噬菌体等外源基因元件侵染而获得的。; 李婉王娜娜张丹青霍贵成; 关键词：嗜热链球菌同源性

两株嗜酸乳杆菌体外降解粘蛋白能力的研究: 2016年; 以从人体肠道中筛选,并经16S r DNA鉴定的2株嗜酸乳杆菌KLDS1.0901、KLDS1.0902为研究对象,体外评估两株嗜酸乳杆菌降解粘蛋白的能力。体外粘蛋白降解能力的评估主要是通过液体培养法、SDS-PAGE蛋白分析以及平板降解实验三部分进行。受试菌株在含粘蛋白的液体培养基中生长不良,粪便菌群生长良好;SDS-PAGE粘蛋白残留分析检测以及平板粘蛋白溶圈检测表明受试菌株无粘蛋白降解活性,而粪便菌群产生阳性反应。实验结果表明,两株嗜酸乳杆菌无体外降解粘蛋白活性。; 张丹青丁秀云李婉霍贵成; 关键词：嗜酸乳杆菌安全性

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张丹青