张春秀 作品数:15 被引量:79 H指数:5 供职机构: 国家工程研究中心 更多>> 发文基金: 重庆市科技攻关计划 南通市科技局社会发展科技计划项目 上海市科学技术委员会资助项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 轻工技术与工程 环境科学与工程 更多>>
基因芯片技术的发展和应用 被引量:6 2010年 基因芯片技术是以基因序列为分析对象的生物芯片.是技术最成熟、最早进入应用和实现商业化的生物芯片。基因芯片是把大量已知序列探针集成在同一个基片上,经过标记的靶核苷酸序列与芯片特定位点上的探针杂交,通过检测杂交信号,对细胞或组织中大量的基因信息进行检测与分析。1991年Affymetfix公司的Fodor等人应用光刻技术研发了世界上第一张基因芯片。 张春秀 肖华胜关键词:基因芯片技术 生物芯片 基因序列 探针杂交 核苷酸序列 基因芯片技术检测常见革兰阴性杆菌耐药基因的研究 被引量:7 2011年 目的设计一种耐药基因检测芯片,可并行检测临床常见的革兰阴性杆菌中较常见耐药基因。方法收集临床分离的70株革兰阴性杆菌:肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、铜绿假单胞菌、鲍氏不动杆菌,根据已知耐药基因序列设计并合成引物及探针,制备耐药基因检测芯片,进行杂交及扫描。结果耐药基因检测芯片除未检到IMP耐药基因外,其他耐药基因检测结果均与PCR检测结果一致。结论该研究设计的革兰阴性杆菌耐药基因检测芯片有较好的应用价值。 蔡挺 李巧云 张顺 张春秀 常燕子关键词:革兰阴性杆菌 耐药基因 基因芯片 生物芯片技术的发展与应用 2010年 生物芯片的概念于20世纪90年代初期提出.之后便涌现出大量关于生物芯片的报道.尤其是进入21世纪,随着生物芯片技术所涉及的物理、化学、生物等技术的快速发展,生物芯片技术取得了很好的进展.技术平台日益稳定.开发的产品越来越多,已经在生命科学,药物研发,临床疾病检测与诊断.环境,农林业等领域中得到了广泛的应用。本文对生物芯片技术的原理、制备、试验设计和应用等方面进行了简要的综述。 肖华胜 张春秀关键词:生物芯片技术 生命科学 药物研发 疾病检测 农林业 56例疑诊颅内感染患者脑脊液中病原菌的基因芯片技术检测结果 被引量:2 2014年 目的观察基因芯片技术用于疑诊颅内感染患者脑脊液中病原菌的检测结果。方法对56例疑诊颅内感染患者的脑脊液进行细菌培养,鉴定细菌种类。根据颅内感染常见菌(金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、肺炎双球菌)的特异性DNA序列设计并制作PCR引物及相应的探针,采用基因芯片技术检测脑脊液细菌感染情况,并与脑脊液细菌培养结果进行比对。结果脑脊液细菌培养确诊颅内感染18例,诊断阳性率为32.14%,病原菌为金黄色葡萄糖球菌6例,肺炎克雷伯菌3例,大肠杆菌2例,肺炎双球菌2例,鲍曼不动杆菌2例,铜绿假单胞菌2例,耳葡萄糖球菌1例;基因芯片技术确诊颅内感染38例,诊断阳性率为39.29%,明确颅内感染致病菌22例,其中金黄色葡萄糖球菌8例,肺炎克雷伯菌5例,大肠杆菌5例,肺炎双球菌4例,与脑脊液细菌培养阳性标本结果完全符合;16例未能鉴定出致病菌,但检出16S基因。结论基因芯片技术对颅内感染的诊断阳性率及脑脊液中金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、肺炎双球菌的检出率高于常规细菌培养。 丁锦荣 管义祥 吴德模 张春秀关键词:颅内感染 脑脊液 基因芯片 一种新的基于单碱基延伸的SNP芯片技术 被引量:7 2009年 单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是人类基因组中最常见的一种变异,与疾病易感性、药物代谢等有着密切的关系。已经建立了多种SNP检测技术并得到了应用。单碱基延伸(Single base extension,SBE)是常用的SNP分型技术之一。文章建立了SBE结合Zip-code芯片技术对SNP进行分型,为个体化用药及临床诊断芯片的研究与开发提供技术和方法。 董园园 盛海辉 杨茜 曾娴婷 武雪梅 张春秀 陈光 肖华胜关键词:单核苷酸多态性 基因芯片 基因分型 食源性致病菌快速检测技术研究进展 被引量:19 2009年 食源性致病菌是影响食品安全的主要因素之一,传统的细菌分离、培养与鉴定由于需时较长,特别是有的细菌难以培养,难以适应食源性疾病预防控制的需要,因而快速、简便、特异的检测方法成为研究的热点。对电阻抗、放射测量、微热量、ELISA、PCR、基因芯片和生物传感器技术在金黄色葡萄球菌、沙门菌、肠出血性大肠埃希菌等食源性致病菌快速检测中的应用研究进行综述。 王大勇 方振东 谢朝新 张春秀关键词:食品安全 食源性致病菌 基因芯片早期检测中枢神经系统感染耐药基因 被引量:2 2017年 目的探讨基因芯片技术在早期快速检测中枢神经系统感染耐药基因的临床意义。方法选取6种常见耐药基因的特异性DNA序列,设计并制作PCR引物及相应的探针,对60例中枢神经系统感染患者的脑脊液行基因芯片检测耐药基因及病原菌,将结果与传统脑脊液培养方法进行对比。结果传统脑脊液培养方法确诊中枢神经系统感染24例;基因芯片方法确诊中枢神经系统感染30例,并鉴定出菌种及耐药基因,另有30例未鉴定出菌种,但仍多数检出了耐药基因。结论基因芯片技术可以早期快速并灵敏的检测出中枢神经系统感染细菌的耐药基因,在早期明确诊断方面明显优于脑脊液细菌培养法。 王海波 陈建 张春秀 管义祥 张强关键词:基因芯片 中枢神经系统感染 耐药基因 基因芯片技术快速诊断颅内细菌感染临床应用 被引量:3 2014年 目的:探讨基因芯片技术在快速诊断颅内细菌感染的临床应用。方法:选择金葡菌,肺炎克雷伯菌,大肠杆菌,肺炎双球菌4种常见致病菌的特异DNA序列,设计相应的引物与探针。对颅内感染30例脑脊液培养阳性12例,阴性18例标本行多重PCR扩增、基因芯片检测,进行菌种鉴定与脑脊液细菌培养结果比较。结果:(1)细菌培养阳性脑脊液标本12例中,基因芯片鉴定出金黄色葡萄球菌5例,肺炎克雷伯菌3例,大肠杆菌2例,肺炎双球菌2例。(2)细菌培养阴性18例中,基因芯片鉴定出金葡菌1例,大肠杆菌2例;检出16S基因8例,未鉴定出菌种,未检出16S基因7例。结论:基因芯片可灵敏、快速诊断出颅内感染患者脑脊液中致病菌。 崔益秋 居兴云 姜素兰 张春秀关键词:颅内感染 基因芯片 多重聚合酶链反应 肺炎克雷伯菌 肺炎双球菌 浓缩富集+基因芯片快速检测水体中致病菌 被引量:5 2010年 为了实现对水体致病菌的快速检测和监控,研究开发了一套预浓缩富集配合基因芯片检测的方法,对模拟和实际水样进行了检测,并与传统检测方法进行了比较。结果表明,通过对水样的浓缩集菌,基因芯片对致病菌的检出率(以肠炎沙门氏菌为单一检测对象)达到1.0×10^3cfu/mL,较原来提高了100倍;可以在8h内同步完成13种对人类有重大危害的致病菌的快速检测。 王大勇 肖进文 方振东 王昱 敖漉 张春秀关键词:基因芯片检测 基于单碱基延伸标签反应的常见食源性致病菌基因芯片检测方法的建立 被引量:17 2009年 针对8种常见的食源性致病菌(金黄色葡萄球菌、副溶血弧菌、单核细胞增生李斯特菌、沙门氏菌、阪崎肠杆菌、志贺氏菌、肠出血性大肠杆菌O157:H7和空肠弯曲杆菌),建立了基于单碱基延伸标签反应原理的基因芯片检测方法。筛选和整合8种食源性致病菌基因组中的特异性序列和相应PCR引物,致病菌靶DNA片段被扩增和纯化作为单碱基延伸标签反应的模板,反应产物在DNA芯片上与探针进行杂交反应,然后通过扫描基片的荧光强度进行判断。实验结果表明,可采用基于单碱基延伸标签反应的基因芯片方法同时特异性检测8种食源性致病菌,基因组DNA多重检测灵敏度可达到0.1pg,以鼠伤寒沙门氏菌为单一检测对象的细菌纯培养物灵敏度可达到5×102CFU/mL。本方法可以快速灵敏地检测食源性致病菌,为食源性疾病的诊断和防治提供了一个有效的方法。 陆长勇 施春雷 张春秀 陈婧 史贤明关键词:食源性致病菌 基因芯片