郝长付
- 作品数：101 被引量：188H指数：7
- 供职机构：郑州大学公共卫生学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金河南省教育厅自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学环境科学与工程理学更多>>
- A549细胞上皮-间质转分化中差异表达基因的生物信息学分析被引量：1
- 2021年
- [背景]在肺纤维化中,上皮-间质转分化(EMT)具有重要的作用。肺泡上皮细胞的EMT是肌成纤维细胞的一个重要来源。而随着高通量测序技术的发展,利用生物信息学的分析筛选EMT过程中的关键基因(Hub基因)引起了学者们的关注。[目的]分析人肺泡Ⅱ型上皮细胞(A549细胞)相关EMT过程中的差异表达基因,以此筛选肺纤维化相关EMT过程中的Hub基因以及相关的关键信号通路,以期为肺纤维化相关的EMT研究提供新的思路。[方法]从美国国立信息中心的基因表达综合数据库下载芯片数据集GSE17708,运用R语言中的limma包进行差异表达基因的分析。采用DAVID 6.8对差异表达基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,并运用相互作用基因库检索工具数据库和Cytoscape软件绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用Cytoscape软件中的CytoHubba插件筛选Hub基因,最后通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术对A549细胞相关EMT过程中的Hub基因进行验证。[结果]基于高通量测序芯片的筛选,55个差异表达的基因主要参与的生物学途径包括胶原蛋白分解代谢的过程、细胞迁移正调控、生长负调节、内皮细胞凋亡过程的负调控以及细胞外基质组织;细胞组分的富集结果显示55个差异表达基因集中在胞外区和细胞外间隙;分子功能的富集显示差异表达基因主要具有细胞外基质结构组成、肝素结合、磷脂酰丝氨酸绑定、酶抑制剂的活动、纤连蛋白结合等功能。KEGG结果表明,差异表达基因可能参与细胞外基质受体相互作用、阿米巴类感染、黏着斑的形成、PI3K-Akt信号通路、矿物质吸收、血小板激活、补体及凝血级联反应、小细胞肺癌等信号通路。随后,通过最大团性中心方法筛选出得分最高的前8个基因(THBS1、COL4A1、COL5A1、COL4A2、FGG、SERPINE1、LAMC2、IGFBP5)作为EMT相�
- 杨果李超姚武夏佳蕊祁远梦郝长付
- 关键词：A549细胞差异表达基因生物信息学肺纤维化
- 二氧化硅诱导大鼠肺成纤维细胞转分化中基因组甲基化水平被引量：3
- 2012年
- 目的探讨二氧化硅（SiO2）诱导大鼠肺成纤维细胞转分化过程中基因组的甲基化水平。方法采用直接和间接细胞共培养方法对sD大鼠巨噬细胞、肺成纤维细胞进行原代培养，以25、50、100μg／ml的SiO2作为受试物，采用免疫细胞化学方法对肺成纤维细胞转分化为肌成纤维细胞进行鉴定，采用高效液相色谱法检测成纤维细胞的基因组甲基化水平。结果间接共培养方式下，与空白组比较，25、50、100μg／ml SiO：剂量组成纤维细胞的基因组甲基化水平分别降低19．9％、26．9％、30．3％，差异有统计学意义（P〈0．05）；与100μg／ml SiO2剂量组比较，对照组5一氮杂-2-脱氧胞苷（5-aza—dC）处理后成纤维细胞基因组甲基化水平降低22．0％，差异有统计学意义（P〈O．05）。ThinCertTM共培养方式下，与空白组比较，25、50、1013μg／ml SiO2剂量组成纤维细胞的基因组甲基化水平分别降低22．2％、30．2％、36．7％，差异有统计学意义（P〈0．05）；与100μg／ml SiO2剂量组比较，对照组5-aza-dC处理后成纤维细胞基因组甲基化水平降低20．6％，差异具有统计学意义（P〈0．05）。结论矽肺体外细胞模型共培养方式下，SiO2可引起成纤维细胞基因组甲基化水平降低，用ThinCertTM共培养方式建立的体外细胞模型在矽肺纤维化发生研究中有应用前景。
- 王永星姚武高彬姚永成吴逸明郝长付
- 关键词：二氧化硅甲基化
- 采用MeDIP-seq检测二氧化硅诱导的肺成纤维细胞转分化前后的特异甲基化改变
- [目的]采用MeDIP-seq的方法检测二氧化硅诱导的肺成纤维细胞转分化前后的特异甲基化改变,探讨表观遗传学变化在肺成纤维细胞转分化过程中的机制。[材料和方法]使用组织块法取SD大鼠肺成纤维细胞进行原代培养至6-8代,肺...
- 侯建永陈慧婷李娟刘素娜张红义王迪姚武郝长付
- 关键词：二氧化硅肺成纤维细胞转分化
- 医务人员遭受工作场所暴力伤害调查被引量：14
- 2011年
- 目的:调查河南省某市综合医院医务人员遭受工作场所暴力的发生情况。方法:采取整群抽样法,采用医院工作场所暴力量表调查某市2家医院499名医务人员工作场所暴力发生情况。结果:499名调查对象中,1年内各种工作场所暴力事件总发生率为58.1%,其中遭受情感虐待比例最高达到49.7%。结论:医务人员工作场所遭受工作场所暴力伤害是普遍现象,应采取措施减少医院工作场所暴力的发生。
- 吴留广郝长付王威许东姚武
- 关键词：暴力医务人员
- 测定人PON1基因rs854560位点多态性的方法及试剂盒
- 测定人PON1基因rs854560位点多态性的方法及试剂盒。该方法包括：提供待测人基因组DNA；提供扩增人PON1基因rs854560位点附近序列的上游引物和下游引物，其中下游引物具有错配碱基T；以所述待测人基因组DNA...
- 王威王团伟王彭彭冯斐斐燕贞段晓冉冯晓蕾刘文佳郝长付姚武杨永利施学忠
- 文献传递
- 大鼠实验性矽肺中树突状细胞及其相关细胞因子分布规律
- 目的:树突状细胞(dendritic cell,DC)是已知功能最强的抗原呈递细胞,且与巨噬细胞有相近、交叉的结构与功能,推测DC在矽尘识别与摄取、矽肺获得性免疫应答中很可能也是极其重要的效应细胞。初步探讨其在矽肺发生发...
- 于兴浩暴磊郝长付李娟张林王迪陈慧婷李一平张淼岳中正张建会曲雅倩姚武
- 关键词：矽肺树突状细胞细胞因子
- 文献传递
- 树突状细胞在实验性矽肺发生发展中的作用初探
- 目的:初步探讨树突状细胞在矽肺发生发展过程中作用。方法:体外细胞因子诱导培养外周血来源的树突状细胞。用不同浓度的SiO2对树突状细胞进行染毒处理24h后,MTT法检测SiO2对树突状细胞活性的影响;应用扫描电镜和投射电镜...
- 姚武郝长付刘素娜暴磊张红义侯建永
- 游离二氧化硅诱导肺泡Ⅱ型上皮细胞转分化的Western blot鉴定
- 目的：探讨游离二氧化硅诱导大鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞(RLE-6TN)发生上皮间质转分化的细胞表面标志物蛋白表达情况.方法：提取SPF级SD大鼠原代巨噬细胞,并常规培养巨噬细胞和RLE-6TN.CCK-8细胞活性实验确定SiO...
- 陈慧婷姚武李娟暴磊王迪岳中正李一平张淼曲雅倩张建会于兴浩郝长付
- 煤工尘肺患者血清中血管内皮生长因子抗体的表达被引量：3
- 2014年
- 目的检测煤工尘肺患者及接尘工人血清中血管内皮生长因子抗体（VEGF-Ab）的表达水平,探讨其在尘肺病发病过程中的意义。方法将对象分为4组：以230例煤工尘肺观察对象（已出现尘肺病变但尚未达到壹期尘肺）为观察对象组,以328例煤工尘肺患者为煤工尘肺组,以309例正在接尘的工人为接尘组（尚未出现尘肺病变）,以393例医院健康体检人员为对照组,对所有研究对象进行问卷调查,并采集外周静脉血,分离收集血清,采用酶联免疫吸附试验（ELISA）法检测血清中VEGF-Ab的表达水平。结果煤工尘肺组和接尘组血清中VEGF-Ab表达水平均高于健康对照组和观察对象组（P〈0.05）。随着尘肺病期别的增高,煤工尘肺组患者血清中VEGF-Ab的表达水平虽有增加的趋势,但差异无统计学意义（P〉0.05）。观察对象组中20~岁组和40~岁组VEGF-Ab表达水平均高于60~岁组（P〈0.05）;煤工尘肺组和健康对照组中20~岁组和40~岁组VEGF-Ab表达水平均低于60~岁组（P〈0.05）。煤工尘肺组中采煤组血清VEGF-Ab高于辅助工种组（P〈0.05）,接尘组中掘进组血清VEGF-Ab高于采煤组（P〈0.05）。观察对象组和煤工尘肺组的壹期尘肺组中,工龄〈25年的患者血清中VEGF-Ab表达低于工龄≥25年者（P〈0.05）。结论血清中VEGF-Ab的表达水平可能与煤工尘肺的发生发展过程相关,随着年龄的增大、接尘工龄的增加VEGF-Ab的表达水平升高。
- 程远博刘素娜暴磊张红义侯建永郝长付姚武
- 关键词：血管内皮生长因子抗体煤工尘肺接尘工人
- 尘肺病噬菌体单链抗体库的构建及鉴定被引量：2
- 2011年
- 目的:构建具有良好多样性的人尘肺病噬菌体单链抗体(ScFv)库。方法:收集25例尘肺病患者外周血标本共50mL,密度梯度离心法分离淋巴细胞,Trizol法提取总RNA,逆转录后参考文献设计并合成半巢式PCR引物,扩增抗体重链(VH)和轻链(VL)可变区基因,Linker连接VH和VL,继而连接到噬菌体载体pCANTAB-5E中,连接产物转入感受态大肠杆菌TG1,超感染辅助噬菌体M13KO7,构建噬菌体ScFv库。结果:扩增出VH和VL基因序列并有效地连接,经转化和超感染,构建了库容为2.4×107pfu/mL的ScFV库。结论:成功构建人尘肺病噬菌体ScFV库。
- 翟伟郝长付高彬姚武
- 关键词：尘肺噬菌体单链抗体库单链抗体
