赵亚雪
- 作品数：8 被引量：4H指数：1
- 供职机构：上海交通大学药学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- Design and Synthesis of Small Molecules as Therapeutic Agents and Probes in Chemical Biology
- 丁大中赵亚雪吴明轩乔智涛孟青青周虎臣
- hiv-1整合酶与人体蛋白ledgf/p75相互作用及药物设计研究
- 蛋白质-蛋白质相互作用在生命活动中起着十分关键的作用，基因调节、免疫应答、信号转导、细胞组装等等都离不开蛋白质-蛋白质的相互作用。蛋白质的这种相互作用一旦受到外界的干扰或阻断，就可能引起其生物学功能的变化，从而引起疾病。...
- 赵亚雪
- 关键词：相互作用整合酶药物设计分子对接
- 文献传递网络资源链接
- 运用计算的方法来理解激动剂与多巴胺受体3的结合
- ＜正＞多巴胺受体3（D3）是一个治疗神经性紊乱（如帕金森症）的有望药物靶标,当前的研究主要集中在D3激动剂的发现和设计。我们精心设计了计算步骤,包括药效团建立,同源建模,分子对接和分子动力学模拟,来理解激动剂与D3的结合...
- 赵亚雪黄志敏张键
- 文献传递
- 运用计算的方法来理解激动剂与多巴胺受体3的结合
- 2010年
- 赵亚雪黄志敏张键
- 关键词：激动剂多巴胺受体药效团模型药物靶标动力学模拟同源建模
- 蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究进展被引量：4
- 2007年
- 蛋白质-蛋白质相互作用在细胞活动和生命过程中扮演着非常重要的角色。基因调节、免疫应答、信号转导、细胞组装等等都离不开蛋白质-蛋白质的相互作用。近几年,靶向蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究也逐渐成为研究的热点;但是蛋白质复合物相互作用界面的一些特点和性质,如相互作用界面较大、结合界面较为平坦等,使蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究充满了挑战。本文主要总结了蛋白质-蛋白质相互作用界面的一些性质和特点,分析了界面特性与其抑制剂设计的关系,并讨论了蛋白质-蛋白质相互作用的理论预测方法及其抑制剂的类型和特点,最后又通过实例说明了如何进行蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂的设计。
- 赵亚雪唐赟
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂
- 对抗BCMA单链抗体体外亲和力成熟关键位点的模拟
- 2020年
- 为提高人源化的抗B细胞成熟抗原(B-cell maturation antigen,BCMA)单链抗体(scFv)的亲和力,本研究通过计算机模拟初步探索其体外亲和力成熟的关键位点.首先利用ELISA检测噬菌体表面展示的抗BCMA的亲本单链抗体的结合活性,再通过同源模建搭建抗原-抗体复合三维结构,分析抗原-抗体间的相互作用,保留其互作界面处的关键残基,以增加其相互作用为目标而设计突变体,并利用重叠延伸PCR对scFv进行定点突变以构建突变体质粒,最后通过ELISA初步检测突变体的结合活性.结果显示:噬菌体表面展示的抗BCMA的亲本scFv具有结合抗原BCMA的活性,抗原-抗体间的非键相互作用主要为氢键和疏水相互作用,为增加抗原-抗体静电相互作用而设计了3株突变体,但根据ELISA检测结果显示静电相互作用并不是决定scFv和BCMA结合的关键因素,通过创造额外的静电作用,未能明显提高scFv的亲和力.通过计算机模拟构建了抗原-抗体复合物结构模型,确定了其亲和力成熟中应保留的关键位点,并发现静电作用并不是决定scFv与抗原亲和力的关键作用,推测氢键或其他作用力可能对亲和力的提高作用更大,为后续通过引入氢键等其他设计以提高抗体亲和力奠定了基础.
- 王步帆武正华张青赵亚雪赵亚雪
- 关键词：计算机辅助设计噬菌体展示
- SENPs抑制剂及其测试方法的研究进展
- 2017年
- SUMOs(small ubiquitin-like modifiers,小泛素类调节蛋白)是最近发现的一类重要的翻译后修饰蛋白,通过共价修饰底物蛋白而调节细胞的功能。而SENPs(SUMO-specific proteases,SUMO-特异性蛋白酶)通过催化SUMOs前体的成熟启动SUMO化过程,通过催化SUMO化蛋白上SUMO的去除实现去SUMO化。最近研究发现,SENPs与癌症、发育缺陷、神经变性等疾病密切相关,是潜在的药物靶标。SENPs抑制剂及其测试方法也因此受到了越来越多的关注。现主要总结了SENPs抑制剂的发展现状,探讨了目前可行的SENPs抑制剂测试方法,这些将为SENPs抑制剂的进一步发展和以SENPs为靶标的药物开发奠定坚实的基础。
- 张建臣赵亚雪
- 关键词：SUMO抑制剂
- 非自然氨基酸在蛋白质中的引入方法及其在化学生物学中的应Q用
- 2016年
- 蛋白质是生命的物质基础,在生物体中行驶着极为重要的功能,各种细胞活动和生命过程的发生都需要蛋白质的参与。例如,DNA复制转录,RNA翻译,以及信号传导等过程中发挥关键作用的聚合酶、翻译复合物、信号传导受体等都是蛋白质。正常细胞体内的所有蛋白质都由20种天然存在的氨基酸组成,它们通过立体构象变化及翻译后修饰等来控制其功能的发挥。而在实际应用中,学者们为了实现不同的研究目的,发展了很多在蛋白质中引入20种自然氨基酸之外的非自然氨基酸(unnatural amino acid,UAA)的方法,如化学修饰合成、体外翻译、遗传密码扩展等,从而将蛋白质的性质根据研究和应用的需要进行拓展。本文综述了各类化学与生物中引入非自然氨基酸的方法,并介绍了非自然氨基酸在化学生物学研究中的最新应用。
- 王列张煚王中立朱明彦赵亚雪
- 关键词：蛋白质化学生物学
