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麦仲伦

作品数:9 被引量:12H指数:2
供职机构:南方医科大学更多>>
发文基金:卫生部科技专项基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 8篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 9篇医药卫生

主题

  • 8篇生物信息
  • 8篇生物信息学
  • 8篇生物信息学分...
  • 5篇乳腺
  • 5篇MICROR...
  • 4篇乳腺癌
  • 4篇腺癌
  • 3篇直肠
  • 3篇直肠癌
  • 3篇受体
  • 3篇肿瘤
  • 3篇文献计量学
  • 3篇结直肠
  • 3篇结直肠癌
  • 3篇计量学
  • 3篇肠癌
  • 2篇孕激素
  • 2篇孕激素受体
  • 2篇乳腺肿
  • 2篇乳腺肿瘤

机构

  • 9篇南方医科大学

作者

  • 9篇麦仲伦
  • 8篇张积仁
  • 7篇曾融
  • 7篇姜茂竹
  • 6篇郑燕芳
  • 4篇吴钢
  • 3篇李纪强
  • 1篇孙瑶
  • 1篇岑东芝
  • 1篇黄东兰

传媒

  • 2篇肿瘤防治研究
  • 1篇中国老年学杂...
  • 1篇山东医药
  • 1篇中国肿瘤
  • 1篇实用肿瘤杂志
  • 1篇热带医学杂志
  • 1篇中华肿瘤防治...

年份

  • 1篇2015
  • 5篇2013
  • 3篇2012
9 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
Her2(+)/Her2(-)乳腺癌差异表达microRNAs的生物信息学分析
2012年
目的通过文献挖掘与生物信息学分析的方法,探讨Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达的microRNAs可能涉及的生物学功能和信号通路。方法在NCBI数据库的GEO子数据库及EBI数据库中的ArrayEx-press子数据库开展检索,使用关键词"breast cancer"、"microRNA"进行检索,获取Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达microRNAs。利用microRNAs靶基因预测软件预测所有差异表达microRNAs的靶基因,进行通路分析。结果找到2个在Her2表型不同的乳腺癌中差异表达的microRNAs数据集,利用软件TargetScan预测差异表达microRNAs的靶向基因,取其合集进行富集分析,最后将富集得到的基因利用David数据库进行分析,从而得到了上述差异表达的microRNAs可能具有的生物学功能和参与的调节通路。结论差异表达的microRNAs通过调节靶向基因参与不同信号通路,实现多种生物学功能。
曾融张积仁姜茂竹麦仲伦吴钢郑燕芳
关键词:乳腺肿瘤小RNA病毒
PR(+)/PR(-)乳腺癌差异表达microRNAs潜在作用通路的生物信息学分析被引量:1
2013年
目的通过对乳腺癌中与孕激素受体(PR)状态相关的microRNAs差异表达谱进行生物信息学分析,探讨microRNAs在PR表达状态中可能参与的调控机制,为深入研究乳腺癌不同分子亚型的分化提供新思路。方法利用文献挖掘方法找到与PR状态相关的microRNAs差异表达数据集,然后利用生物信息学方法(Targetscan软件和DAVID数据库)预测microRNAs的靶基因,再对靶基因进行基因本体论(GO)富集和通路分析。结果通过文献挖掘找到3个差异表达microRNAs数据集,生物信息学分析获得3个相应靶基因集和1个靶基因合集。靶基因的GO分类主要涉及细胞内的信号级联、蛋白氨基酸磷酸化、蛋白质甲基转移酶活性及转录因子活性等生物学过程及分子功能。通路分析发现3条KEGG信号通路和3条BIOCARTA代谢通路可能参与不同PR表达状态的调节。结论通过生物信息学方法,初步分析了microRNAs在不同PR表达状态中可能参与调控的信号和代谢通路,为进一步探索microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化的调控机制奠定基础。
麦仲伦姜茂竹曾融吴钢郑燕芳张积仁
关键词:乳腺癌孕激素受体MICRORNAS生物信息学
基底样型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱的生物信息学分析
2013年
目的对基底型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱进行分析,找出两种分子亚型乳腺癌之间差异表达的microRNAs,并对差异表达microRNAs在不同分子亚型乳腺癌中可能发挥的生物学功能进行初步探讨。方法从公共基因芯片数据库GEO中筛选基底样型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱数据,利用BRB-arrayTools软件筛选出差异表达的microRNAs。对差异表达的microRNAs,利用TargetScan和miRDB靶基因预测软件及TarBase数据库获得可能的靶基因集。利用DAVID数据库,对差异表达micorRNAs的靶基因集进行进一步GeneOntology和信号通路分析。结果通过对基底样型和Luminal A型乳腺癌microRNAs表达谱分析获得54个差异表达的microRNAs(P≤0.001)。相对于Luminal A亚型乳腺癌,31个microRNAs在基底样型乳腺癌中上调表达,而23个microRNAs下调表达。上调和下调表达microRNAs可能的靶基因集数目分别为4 916和3 217个。对于上调和下调microRN As的靶基因集,Gene Ontology分析表明,两个靶基因集分别在不同的生物学过程显著富集;KEGG通路分析分别涉及了35条和39条(P≤0.05);BIOCARTA通路分析则分别涉及5条和9条(P≤0.05)。结论本研究获得了基底样型和Luminal A型乳腺癌差异表达的microRNAs,并通过靶基因功能分析获得差异表达microRNAs在两种分子亚型乳腺癌之间可能参与的不同生物学过程及信号通路,可能在不同分子亚型乳腺癌中发挥不同的调节作用。
姜茂竹麦仲伦曾融吴钢郑燕芳张积仁
关键词:LUMINAL微小RNAS生物信息学
ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs相关信号通路的分析被引量:2
2012年
目的:利用生物信息的方法,建立一种对不同ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs生物学功能和信号通路系统分析的方法,探讨microRNAs在不同ER状态中可能发挥的调控作用。方法:通过文献挖掘,找出不同ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs,利用预测软件TargetScan、PicTar、miRanda和TarBase数据库得出microRNAs可能靶向的基因集,对靶基因集进行去除随机化的富集分析后,再利用DAVID数据库进行相关生物学功能和信号通路分析。结果:通过文献挖掘的方法找到了5个不同ER表达状态乳腺癌microRNAs差异表达数据集,分别包含了11、43、25、6及19个差异表达的microRNAs。经过靶基因预测及富集后,得到的不同microRNAs靶基因集分别包括1 553、1 750、1 905、1 250和1 826个靶基因。进一步功能及通路分析发现,这些靶基因集可能参与转录相关蛋白质定位及转移、RNA代谢、细胞周期、细胞凋亡和细胞分裂等多个生物学过程,并发现3条共同的BIOCARTA细胞信号通路可能与ER表达调节相关。结论:找到了不同ER表达状态乳腺癌差异表达的microRNAs,并利用生物信息学方法对这些mi-croRNAs进行系统分析,为进一步研究microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化中的调控机制奠定基础。
姜茂竹曾融麦仲伦吴钢郑燕芳张积仁
关键词:乳腺肿瘤MICRORNAS信号传导计算生物学
结直肠癌诊断相关基因的文献计量学与生物信息学分析被引量:5
2015年
目的对结直肠癌诊断相关基因的临床资料进行分析,为寻找结直肠癌诊断相关关键基因提供参考。方法以Embase、Pubmed为文献检索数据库(2001年1月至2010年12月),对纳入的255篇文献分别对其出版年、国家、期刊、研究机构、作者及所研究基因进行计量学与生物信息学分析。结果结直肠癌诊断相关基因文章在2006年最高;发文量最多的国家、期刊、机构分别为China、Anticancer Res、Zhejiang University,Dimberg,Yang,Zhang 3个人发文量最多;其中KRAS是最为热点的基因(58篇);255篇文献共涉及193个结直肠癌诊断相关基因,其蛋白主要涉及细胞生理过程调节、细胞增殖、细胞周期、细胞周期调控、细胞程序调节等。Cytoscape分析Hub基因共有15个,bottleneck基因有12个。结论结直肠癌诊断相关基因成为研究热点,TP53、CTNNB1、CDH1、AKT1、EGFR、MYC、CCND1、ESR1等基因在结直肠癌诊断中可能起关键作用。
郑燕芳李纪强姜茂竹曾融麦仲伦张积仁
关键词:结直肠癌文献计量学生物信息学
乳腺癌内分泌治疗敏感相关基因的文献计量学和生物信息学分析被引量:4
2012年
[目的]了解乳腺癌内分泌治疗敏感相关基因的研究现状,构建相关基因相互联系的网络模块。[方法]在Embase、Medline/Pubmed及BIOSIS Preview数据库中检索2001~2010年发表的有关乳腺癌内分泌治疗敏感相关基因的文献进行计量学分析,并对相关基因及其产物进行生物信息学分析。[结果]168篇文献纳入研究,共涉及267个基因。文献计量分析结果显示近3年来该领域的研究目前处于快速发展阶段;美国在该领域研究水平处于明显领先地位;Breast Cancer Research and Treatment与Clinical Cancer Research为载文量最多的期刊。生物信息学分析提示关键基因和瓶颈基因具体包括CCND1、AKT1、NFKB1、PIK3CA、TPX2、EGFR、Bcl-2、BRCA1、MYC、SRC、VEGFA、AR、ESR1、TNF、BIRC5、CDK1、TP53、Jun。[结论]通过对乳腺癌内分泌治疗敏感相关基因的文献计量学分析及生物信息学分析,我们可清楚了解目前该领域研究现状及基因网络模块对未来研究的预测作用,帮助研究人员作进一步研究打下基础。
麦仲伦岑东芝王贻锘杨菲张积仁
关键词:乳腺癌内分泌治疗文献计量学生物信息学
PR(+)/PR(-)乳腺癌差异表达MicroRNAs潜在作用通路的生物信息学分析及初步实验验证
研究背景:   乳腺癌是严重危害女性健康的主要恶性肿瘤之一,近年来发病率有增高趋势。中国乳腺癌发病率较低,但却以年均3-4%的速度上升,远高于全球年均0.5%的上升速度。事实上,乳腺癌是一类分子水平上高度异质性的疾病,...
麦仲伦
关键词:乳腺癌孕激素受体生物信息学
2001—2010年结直肠癌易感基因的生物信息学分析
2013年
目的通过对2001—2010国内外涉及的结直肠癌易感基因的临床研究资料进行生物信息学分析,为寻找结直肠癌预警关键基因提供参考。方法以Embase、Pubmed为文献检索数据库(2001年1月—2010年12月),对纳入的1 453篇文献所涉及的基因进行生物信息学分析。结果 1 453篇文献共涉及185个结直肠癌易感基因,其蛋白主要涉及细胞周期调控、细胞周期、细胞增殖、细胞周期负调控、内源性刺激反应、DNA损伤反应、DNA修复、凋亡调节等。Cytoscape分析Hub基因共有31个,bottleneck基因有15个。结论通过对结直肠癌易感基因的生物信息学分析,寻找其敏感和特异的基因及基因组合是目前的需要和以后的发展趋势。
李纪强黄东兰孙瑶姜茂竹麦仲伦曾融张积仁郑燕芳
关键词:结直肠癌易感基因生物信息学
结直肠癌5-FU敏感性相关基因的文献计量学与生物信息学分析
2013年
目的对结直肠癌5-FU敏感相关基因的临床资料进行分析,为寻找5-FU敏感相关关键基因提供参考。方法以Embase、Pubmed为文献检索数据库,对纳入的105篇文献分别对其出版年、国家、期刊、研究机构、作者及所研究基因进行计量学与生物信息学分析。结果结直肠癌5-FU敏感相关基因文章在发表年限上呈波动式分布;发文量最多的国家、期刊、机构、作者分别为USA、Clin Cancer Res、University of Southern California;W.Ichikawa;其中TYMS是最为热点的基因(36篇);105篇文献共涉及57个结直肠癌5-FU敏感相关基因,其蛋白主要涉及细胞增殖、细胞周期调控、细胞周期等。Hub基因共有21个,bottleneck基因有16个。结论结直肠癌5-FU敏感相关基因已形成多基因预测模型趋势,TP53、YMS等基因在结直肠癌5-FU疗效预测中可能起关键作用。
李纪强姜茂竹曾融麦仲伦张积仁
关键词:结直肠肿瘤文献计量学生物信息学
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