姜茂竹
- 作品数：21 被引量：17H指数：2
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- Hsa-mir-196b慢病毒表达载体的构建及鉴定
- 2010年
- 目的构建Hsa-mir-196b慢病毒表达载体并对其进行鉴定。方法以正常人外周血DNA为模板,PCR扩增得到目的基因。通过HpaⅠ/XhoⅠ双酶切及其后的连接将其插入Lentilox3.7(pLL-3.7)质粒中。PCR筛选阳性克隆,测序鉴定。用pLL-3.7-mir-196b、pCMV-VSV-G和pCMV-dR8.91三质粒系统共感染HEK-293FT细胞,包装生产慢病毒。将所得病毒悬液梯度稀释后感染HEK293FT细胞,以检测病毒滴度,并用实时定量PCR检测慢病毒感染后Hsa-mir-196b的表达变化。结果 PCR及测序结果证明成功构建了pLL-3.7-mir-196b重组质粒。所得慢病毒上清滴度为(7.2±1.1)×107TU/ml。感染慢病毒的239FT细胞中,Hsa-mir-196b的表达量相对于未感染细胞提高了约24倍。结论成功构建Hsa-mir-196b慢病毒表达载体。
- 向星宇马文丽宋艳斌姜茂竹王妮莎郑文岭
- 关键词：慢病毒肿瘤
- 人瘦素基因的克隆及在酿酒酵母中的表达和生物信息学分析
- 2010年
- 目的构建人瘦素基因和蛋白转导肽Tat基因的融合表达载体,转入酿酒酵母表达系统进行诱导表达,并对融合瘦素蛋白进行生物信息学分析。方法脂肪组织中提取总RNA,逆转录为cDNA,以此cDNA为模板扩增瘦素基因,构建重组质粒pYES2-Tat-leptin,转入酿酒酵母表达菌株INVSc1诱导表达Tat-leptin融合蛋白,利用相关在线软件对融合瘦素蛋白相关的生物学功能进行分析。结果经SDS-PAGE电泳和Western blotting鉴定,酿酒酵母成功表达融合蛋白Tat-leptin。经生物信息学分析后获得了融合瘦素蛋白的相关生物学特性。结论 Tat-leptin融合蛋白在酿酒酵母中成功表达,并对融合瘦素蛋白的生物学特征进行了预测,为消化道基因治疗肥胖的研究奠定了基础。
- 韩晋云郑文岭宋艳斌姜茂竹王妮莎马文丽
- 关键词：瘦素酿酒酵母消化道基因治疗
- Her2(+)/Her2(-)乳腺癌差异表达microRNAs的生物信息学分析
- 2012年
- 目的通过文献挖掘与生物信息学分析的方法,探讨Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达的microRNAs可能涉及的生物学功能和信号通路。方法在NCBI数据库的GEO子数据库及EBI数据库中的ArrayEx-press子数据库开展检索,使用关键词"breast cancer"、"microRNA"进行检索,获取Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达microRNAs。利用microRNAs靶基因预测软件预测所有差异表达microRNAs的靶基因,进行通路分析。结果找到2个在Her2表型不同的乳腺癌中差异表达的microRNAs数据集,利用软件TargetScan预测差异表达microRNAs的靶向基因,取其合集进行富集分析,最后将富集得到的基因利用David数据库进行分析,从而得到了上述差异表达的microRNAs可能具有的生物学功能和参与的调节通路。结论差异表达的microRNAs通过调节靶向基因参与不同信号通路,实现多种生物学功能。
- 曾融张积仁姜茂竹麦仲伦吴钢郑燕芳
- 关键词：乳腺肿瘤小RNA病毒
- ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs相关信号通路的分析被引量：2
- 2012年
- 目的:利用生物信息的方法,建立一种对不同ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs生物学功能和信号通路系统分析的方法,探讨microRNAs在不同ER状态中可能发挥的调控作用。方法:通过文献挖掘,找出不同ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs,利用预测软件TargetScan、PicTar、miRanda和TarBase数据库得出microRNAs可能靶向的基因集,对靶基因集进行去除随机化的富集分析后,再利用DAVID数据库进行相关生物学功能和信号通路分析。结果:通过文献挖掘的方法找到了5个不同ER表达状态乳腺癌microRNAs差异表达数据集,分别包含了11、43、25、6及19个差异表达的microRNAs。经过靶基因预测及富集后,得到的不同microRNAs靶基因集分别包括1 553、1 750、1 905、1 250和1 826个靶基因。进一步功能及通路分析发现,这些靶基因集可能参与转录相关蛋白质定位及转移、RNA代谢、细胞周期、细胞凋亡和细胞分裂等多个生物学过程,并发现3条共同的BIOCARTA细胞信号通路可能与ER表达调节相关。结论:找到了不同ER表达状态乳腺癌差异表达的microRNAs,并利用生物信息学方法对这些mi-croRNAs进行系统分析,为进一步研究microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化中的调控机制奠定基础。
- 姜茂竹曾融麦仲伦吴钢郑燕芳张积仁
- 关键词：乳腺肿瘤MICRORNAS信号传导计算生物学
- 乳腺癌易感性相关基因研究状况分析被引量：1
- 2012年
- [目的]了解乳腺癌易感性相关基因的研究现状。[方法]对Embase、Pubmed/Medline和BIOSIS Preview数据库中2001～2010年期间乳腺癌易感性相关基因的研究文献进行文献计量学分析和生物信息学分析。[结果]筛选出相关文献1126篇,近10年文献量呈上升趋势,457个研究机构进行相关研究,涉及基因291个,主要涉及DNA损伤修复、氧化应激反应、细胞生长、增殖和凋亡等通路。[结论]通过文献计量学及生物信息学分析,对乳腺癌易感性相关基因研究现状和发展趋势有了一个系统的认识。
- 姜茂竹岑东芝王贻锘杨菲张积仁
- 关键词：乳腺癌易感性基因计量学分析生物信息学
- 维甲酸受体β在宫颈癌中的表达及其意义被引量：2
- 2013年
- 目的:检测维甲酸受体β(RARβ)基因在宫颈癌组织中的表达及其意义。方法:收集该院68例宫颈癌和28例宫颈炎患者的临床资料和组织标本,RT-PCR法检测宫颈癌和宫颈炎组织中RARβmRNA的表达水平。采用免疫组织化学法和酶联免疫吸附试验检测宫颈癌和宫颈炎组织中RARβ蛋白的表达情况。统计两组临床资料并对随访的患者资料进行对比。结果:宫颈癌组中的RARβmRNA相对表达量低于宫颈炎组,宫颈癌组中的RARβ蛋白表达阳性比例低于宫颈炎组,宫颈癌组中的RARβ蛋白含量平均值低于宫颈炎组平均值,差异均具有统计学意义(P<0.05)。RARβ蛋白在宫颈癌Ⅲ/Ⅳ期阳性表达比例低于Ⅰ/Ⅱ期,差异具有统计学意义(P<0.05)。有淋巴结转移患者中RARβ表达阳性比例低于无淋巴结转移,差异具有统计学意义(P<0.05)。RARβ表达阴性的宫颈癌患者中死亡率和复发率高于阳性表达患者,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论:RARβ在宫颈癌的发生过程中发挥重要作用,故其可作为宫颈癌患者发生、发展和预后判断的重要参考指标。
- 衷敬华王勇王祥财许明君施华球王钇力姜茂竹孟辉张积仁
- 关键词：宫颈癌定量RT-PCR免疫组织化学酶联免疫吸附试验
- PR(+)/PR(-)乳腺癌差异表达microRNAs潜在作用通路的生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 目的通过对乳腺癌中与孕激素受体(PR)状态相关的microRNAs差异表达谱进行生物信息学分析,探讨microRNAs在PR表达状态中可能参与的调控机制,为深入研究乳腺癌不同分子亚型的分化提供新思路。方法利用文献挖掘方法找到与PR状态相关的microRNAs差异表达数据集,然后利用生物信息学方法(Targetscan软件和DAVID数据库)预测microRNAs的靶基因,再对靶基因进行基因本体论(GO)富集和通路分析。结果通过文献挖掘找到3个差异表达microRNAs数据集,生物信息学分析获得3个相应靶基因集和1个靶基因合集。靶基因的GO分类主要涉及细胞内的信号级联、蛋白氨基酸磷酸化、蛋白质甲基转移酶活性及转录因子活性等生物学过程及分子功能。通路分析发现3条KEGG信号通路和3条BIOCARTA代谢通路可能参与不同PR表达状态的调节。结论通过生物信息学方法,初步分析了microRNAs在不同PR表达状态中可能参与调控的信号和代谢通路,为进一步探索microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化的调控机制奠定基础。
- 麦仲伦姜茂竹曾融吴钢郑燕芳张积仁
- 关键词：乳腺癌孕激素受体MICRORNAS生物信息学
- hsa-miR-30e的克隆及其慢病毒表达载体的构建
- 2010年
- 目的克隆hsa-miR-30e并构建其慢病毒表达载体。方法 PCR扩增hsa-miR-30e的前体序列,克隆于慢病毒载体pll3.7,转染包装细胞293FT细胞,收获病毒颗粒,荧光定量PCR检测hsa-miR-30e的表达。结果经双酶切及测序鉴定,hsa-miR-30e的慢病毒表达载体构建成功,倒置荧光显微镜下观察转染后293FT细胞发出绿色荧光。结论成功构建hsa-miR-30e的慢病毒表达载体,为进一步研究hsa-miR-30e的生物学功能奠定了基础。
- 姜茂竹马文丽宋艳斌向星宇韩晋云郑文岭
- 关键词：慢病毒表达载体肿瘤
- 表达融合基因FCU1骨髓间充质干细胞自杀基因系统的建立及其对结肠癌抑制作用的体外验证被引量：1
- 2012年
- 目的:构建腺病毒载体介导表达融合自杀基因FCU1的骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs),验证其对结肠癌CT-26细胞生长的抑制作用。方法:体外分离小鼠BMSCs,构建重组FCU1基因腺病毒表达载体,包装获取病毒上清并感染BMSCs,MTT法检测5-FC对感染重组腺病毒后的BMSCs的抑制作用。感染重组腺病毒后BMSCs与CT-26细胞共培养,MTT法检测5-FC对CT-26细胞增殖的影响。结果:成功构建FCU1融合基因重组腺病毒载体,包装获得病毒滴度为2.6×1010pfu/mL,可有效感染小鼠BMSCs,MOI为200时,可感染95%以上的BMSCs,并且对5-FC敏感。与CT-26细胞共培养后,重组腺病毒感染的BMSCs达到7%时,可对超过50%的CT-26细胞发挥旁观者效应。结论:研究建立的表达融合基因FCU1的骨髓间充质干细胞自杀基因系统,可有效实现对CT-26细胞的抑制作用。
- 孟辉姜茂竹卜俊国丁为民
- 关键词：骨髓间充质干细胞腺病毒自杀基因
- 结直肠癌诊断相关基因的文献计量学与生物信息学分析被引量：5
- 2015年
- 目的对结直肠癌诊断相关基因的临床资料进行分析,为寻找结直肠癌诊断相关关键基因提供参考。方法以Embase、Pubmed为文献检索数据库(2001年1月至2010年12月),对纳入的255篇文献分别对其出版年、国家、期刊、研究机构、作者及所研究基因进行计量学与生物信息学分析。结果结直肠癌诊断相关基因文章在2006年最高;发文量最多的国家、期刊、机构分别为China、Anticancer Res、Zhejiang University,Dimberg,Yang,Zhang 3个人发文量最多;其中KRAS是最为热点的基因(58篇);255篇文献共涉及193个结直肠癌诊断相关基因,其蛋白主要涉及细胞生理过程调节、细胞增殖、细胞周期、细胞周期调控、细胞程序调节等。Cytoscape分析Hub基因共有15个,bottleneck基因有12个。结论结直肠癌诊断相关基因成为研究热点,TP53、CTNNB1、CDH1、AKT1、EGFR、MYC、CCND1、ESR1等基因在结直肠癌诊断中可能起关键作用。
- 郑燕芳李纪强姜茂竹曾融麦仲伦张积仁
- 关键词：结直肠癌文献计量学生物信息学
