李誌
- 作品数：9 被引量：9H指数：1
- 供职机构：长春理工大学应用技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金吉林省科技发展计划基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学文化科学一般工业技术更多>>
- 基于高通量数据的人体外源性植物miRNA跨界调控建模
- 2018年
- 以基于人体血清的高通量测序数据为研究对象,采用生物计算方法对数据进行分析,以目前已知的人类和植物的RNA数据作为参照集,从中筛选出可能的人体外源植物miRNA;基于miRNA的调控机制原理,获得可能的植物miRNA干扰人类mRNA的靶基因;构建植物miRNA-人类mRNA调控网络模型,分析可能的跨界调控作用。本文通过构建植物-人体跨界调控模型,共挖掘出9个核心模块。研究结果表明,外源性植物miRNA参与调控人体胺代谢、酒精代谢以及脂肪酸代谢等生物过程。
- 张浩张浩郭刘香李誌李誌刘元宁常浩武王志强
- 关键词：人工智能
- 针对H1N1病毒的多特征siRNA设计被引量：5
- 2010年
- 针对甲型流感病毒H1N1基因,从RNAi的角度出发,采用多特征融合的方法,进行siRNA预测。对2009年的46株病毒序列的PA片段进行分析,从经过序列分析所获得的众多靶序列中,采用结构分析手段对靶序列进行筛选,获得较易干扰的靶序列及设计出相应的siRNA。2009年爆发的H1N1病毒,序列保守性高,靶序列一致性高,结构保守性高。该方法可以有效选择可能的靶序列,并在此基础上进一步筛选,以获得少量较易干扰的靶序列,该方法为复杂序列siRNA的设计提供了新思路,对siRNA的优化设计有指导意义,有助于利用RNAi进行H1N1治疗的后续研究。
- 刘元宁常亚萍李誌张浩田明尧
- 关键词：生物信息学RNAISIRNA
- 基于动态规划RNA二级结构的比较被引量：1
- 2011年
- 从RNA的二级结构描述着手,建立基于向量的RNA二级结构树的描述方法,并以该种描述方法为基础,应用动态规划算法,以高致病性的H5N1病毒的NA片段为例,对RNA二级结构进行树状比较。比较结果发现,在时间复杂性上,该方法优于利用最小自由能的方法,并且致病性越强,该结构的相似性越高,对生物实验具有指导意义。
- 李誌刘元宁张浩沈廷杰李杰翟洪亮
- 关键词：生物信息学RNA二级结构H5N1病毒动态规划
- 计算机实习教学模式改革的探讨被引量：1
- 2013年
- 在分析计算机实习教学存在的问题的基础上,结合多年的实验教学经验,对计算机实习教学的目标定位、教学内容、教学手段和方法、考核方式等方面进行探讨。
- 高宁黄春雨陈毓李誌
- 关键词：计算机教学实习教学教学模式
- 调控流感病毒基因片段的人编码microRNA的新方法被引量：1
- 2011年
- 提出了基于流感病毒片段保守区的microRNA(简写为miR-CR)方法来寻找调控流感病毒的人编码miRNA。以H1N1流感病毒的HA、NA、NP、PB2、PA片段为例,最终得到7条能够调控以上5个片段的人编码miRNA,结果有待于进一步实验验证。本文的研究结果对于找出流感病毒致病性与传染性的变化规律以及流感病毒的靶基因药物设计具有重要意义。
- 刘元宁李鑫张浩沈廷杰李誌田明尧鲁会军
- 关键词：生物信息学流感病毒
- 探讨基于平衡能的禽流感病毒结构分析
- 2010年
- 该文针对高致病禽流感病毒中的H5N1亚型,利用平衡能的方法,从二级结构的角度,对19株病毒做出功能分类,针对其所包含的八个片段,进行关联分析,对于不同片段对病毒的生物特性的影响做出解释。
- 李誌刘元宁张浩鲁会军李达
- 关键词：禽流感病毒H5N1RNA二级结构
- RNA假结结构分析被引量：1
- 2009年
- 根据RNA二级结构的5个基本组成部分———自由单链、发夹环、凸环、内环、多分支环,补充提出了14种类型的假结结构,并使用一种改进的RNA平面结构表示法———弧图。依据弧图,不仅给出了假结的形式化定义,而且将这14种结构分为三类:单交叉、自交叉与双交叉。上述三类交叉是假结的基本交叉类型,所有的假结结构或属于这三种交叉中的一种或属于其组合,研究结果可有助于提高包括假结的二级结构预测的可靠性和准确性。
- 刘元宁张浩李誌崔广迪苗轶蝉
- 关键词：人工智能RNA二级结构
- 基于动态算法的序列分析
- 2010年
- 为了获得2009年新型甲型H1N1流感病毒与2008流感病毒的基因序列及氨基酸序列的一致性,以便对一个基因家族的生物学特征有一个简明扼要的了解,针对目前流行的新型甲型H1N1流感病毒的基因序列及其所编码的氨基酸序列,采用动态规划算法对其一级序列进行序列相似度分析,获得了2009年新型甲型H1N1流感病毒的NA和M基因片段以及2008年猪源性甲型H1N1流感病毒的相应基因片段同源性高、在有些位点发生了基因突变增添和突变缺失等重要基因信息。为此次新型甲型H1N1流感病毒的研究提供了依据。
- 李誌刘元宁武泽旭常亚萍何飞徐宝林张浩
- 关键词：生物信息学
- 基于局部结构交互的RNA假结预测
- 2015年
- 基于RNA局部结构间的交互作用,提出一种含假结的RNA二级结构预测新方法LIFold。对给定的RNA序列,首先通过能量计算得到不含假结的能量最优结构,然后应用局部结构交互配对生成假结茎区,在已得到的最优结构基础上构建含假结的能量计算模型,最后通过优化算法得到含假结的RNA二级结构。应用该方法基于HotKnots测试数据的敏感性和阳性预测值(PPV)分别达到84%和80%,基于PseudoBase数据库测试数据的敏感性和阳性预测值分别达到78%和73%,与HotKnots、ILM、PknotsRG、IPknot及FlexStem等知名软件相比较,准确率均有所提高。
- 刘元宁艾露露段云娜李誌田明尧张浩
- 关键词：计算机应用RNA二级结构
