常亚萍
- 作品数：5 被引量：6H指数：1
- 供职机构：吉林大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 基于ARM微处理器的siRNA干扰效率预测系统
- 本发明提供一种RNA干扰时预测siRNA干扰效率的方法，涉及生物信息学研究领域，其目的在于解决现有预测siRNA干扰效率方法中准确率不高的问题。本发明包括如下的步骤：将siRNA序列输入CPLD；按照特征提取规则表将si...
- 刘元宁张浩段云娜常亚萍张晓旭韩烨
- 文献传递
- 基于ARM微处理器的siRNA干扰效率预测新方法
- 本发明提供一种RNA干扰时预测siRNA干扰效率的方法，涉及生物信息学研究领域，其目的在于解决现有预测siRNA干扰效率方法中准确率不高的问题。本发明包括如下的步骤：将siRNA序列输入CPLD；按照特征提取规则表将si...
- 刘元宁张浩段云娜常亚萍张晓旭韩烨
- 针对H1N1病毒的多特征siRNA设计被引量：5
- 2010年
- 针对甲型流感病毒H1N1基因,从RNAi的角度出发,采用多特征融合的方法,进行siRNA预测。对2009年的46株病毒序列的PA片段进行分析,从经过序列分析所获得的众多靶序列中,采用结构分析手段对靶序列进行筛选,获得较易干扰的靶序列及设计出相应的siRNA。2009年爆发的H1N1病毒,序列保守性高,靶序列一致性高,结构保守性高。该方法可以有效选择可能的靶序列,并在此基础上进一步筛选,以获得少量较易干扰的靶序列,该方法为复杂序列siRNA的设计提供了新思路,对siRNA的优化设计有指导意义,有助于利用RNAi进行H1N1治疗的后续研究。
- 刘元宁常亚萍李誌张浩田明尧
- 关键词：生物信息学RNAISIRNA
- siRNA设计中若干关键问题的研究
- RNA干扰是由双链RNA引起的基因沉默现象，广泛应用于研究基因的功能、药物靶点筛选、疾病治疗等方面。siRNA设计是实现RNA干扰的有效途径，siRNA设计的优劣将直接影响RNA干扰的效果。 目前siRNA设计方法中，设...
- 常亚萍
- 关键词：生物信息学H1N1流感病毒RNA干扰SIRNASIRNA设计
- 基于动态算法的序列分析
- 2010年
- 为了获得2009年新型甲型H1N1流感病毒与2008流感病毒的基因序列及氨基酸序列的一致性,以便对一个基因家族的生物学特征有一个简明扼要的了解,针对目前流行的新型甲型H1N1流感病毒的基因序列及其所编码的氨基酸序列,采用动态规划算法对其一级序列进行序列相似度分析,获得了2009年新型甲型H1N1流感病毒的NA和M基因片段以及2008年猪源性甲型H1N1流感病毒的相应基因片段同源性高、在有些位点发生了基因突变增添和突变缺失等重要基因信息。为此次新型甲型H1N1流感病毒的研究提供了依据。
- 李誌刘元宁武泽旭常亚萍何飞徐宝林张浩
- 关键词：生物信息学
