李石法
- 作品数：4 被引量：2H指数：1
- 供职机构：东南大学更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 基因表达数据集成、分析和可视
- 李石法
- 关键词：基因表达数据集成可视化
- 基因调控数据自动处理系统的设计及实现
- 2005年
- 随着人类基因组测序工作的完成,产生了大量的生物数据,这些数据以不同的形式分布在世界各地。为使基因调控和表达信息相关联,建立了基因调控信息集成数据库系统。由于数据来源分布广泛且数据格式不统一,影响了数据库的数据集成。此研究使用了网络智能代理的相关技术,自动下载Web数据,并且进行处理,从中提取出启动子、调控因子、结合位点等有效数据。本程序大大减轻了将网络数据集成到本地数据库的负担。
- 李石法吴俊夏小俊翁建洪孙啸
- 关键词：基因调控启动子
- 基因表达数据的集成、分析和可视化
- 随着人类基因组计划的完成以及分子生物学等相关学科的发展，基因组学的研究重心开始从揭示生命的所有遗传信息转移到分子水平功能的研究上。生物信息学的研究重心也随之由基因组序列转移到序列生物学意义的研究上。在后基因组时代，生物信...
- 李石法
- 关键词：基因调控基因表达数据集成生物信息学基因工程
- 文献传递
- 基于特征的核酸序列数据库搜索系统被引量：1
- 2006年
- 随着后基因组时代的到来,建立生物数据库并且在其上开发各种分析工具进行数据分析和挖掘,已经成为了生物学研究的一种新方法。目前国际上流行的通过序列比对搜索相似序列的方法主要是针对短的序列,将这样的方法应用于大规模基因组序列时搜索速度很慢。针对基因组序列搜索的特点,从提高序列搜索效率出发,提出了一种新的、速度更快的搜索方法,其核心是通过序列特征的分析和比较搜索相似序列。在此基础上,建立了基于特征的序列数据库搜索系统,并利用序列的碱基关联性特征搜索人类基因组序列,结果表明,新搜索方法具有较高的命中率,并且搜索速度非常快,适合于大规模基因组序列的搜索。
- 焦典顾珉傅静李石法谢建明孙啸
- 关键词：基因组数据库
