傅静
- 作品数：4 被引量：5H指数：1
- 供职机构：东南大学生物科学与医学工程学院更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于全基因组的系统发生分析被引量：4
- 2003年
- 系统发生 (phylogeny)是指生物之间的进化关系。系统发生分析就是通过比较物种的特征 ,研究物种之间的进化关系。本文主要对系统发生分析中 ,基于全基因组分析的各个特征提取的方法进行了综述。首先阐述了用基于全基因组进行系统发生分析的原因 ,然后介绍了六种基于全基因组的系统发生分析方法 ,最后对这些方法的优缺点进行了总结。
- 傅静孙啸
- 关键词：全基因组进化生物学物种
- 基于特征的核酸序列数据库搜索系统被引量：1
- 2006年
- 随着后基因组时代的到来,建立生物数据库并且在其上开发各种分析工具进行数据分析和挖掘,已经成为了生物学研究的一种新方法。目前国际上流行的通过序列比对搜索相似序列的方法主要是针对短的序列,将这样的方法应用于大规模基因组序列时搜索速度很慢。针对基因组序列搜索的特点,从提高序列搜索效率出发,提出了一种新的、速度更快的搜索方法,其核心是通过序列特征的分析和比较搜索相似序列。在此基础上,建立了基于特征的序列数据库搜索系统,并利用序列的碱基关联性特征搜索人类基因组序列,结果表明,新搜索方法具有较高的命中率,并且搜索速度非常快,适合于大规模基因组序列的搜索。
- 焦典顾珉傅静李石法谢建明孙啸
- 关键词：基因组数据库
- 基于序列统计特征的全基因组系统发生分析
- 系统发生(phylogeny)是指生物形成或进化的历史.系统发生分析就是通过对生物学数据的建模,直接比对DNA序列或蛋白质序列获得距离矩阵,或者提取特征,比较特征(特征相似的生物被认为在遗传学上接近),从而,研究生物形成...
- 傅静
- 关键词：系统发生分析
- 文献传递
- 利用序列统计特征分析基因组序列
- 本文从一个新的角度来分析DNA序列，探索DNA序列的统计特征，研究基于特征的序列分析方法。利用序列的两个统计特征，即核苷酸单词频率特征(WF)和碱基关联性特征(BBC)，分析基因组序列，发现核苷酸单词频率特征可用于辨别基...
- 孙啸傅静焦典胡弘周士新谢建明
- 关键词：生物信息学
- 文献传递
