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刘琳琳: 作品数：18 被引量：141H指数：8; 供职机构：湖北省疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：国家科技重大专项中美新发和再发传染病合作项目艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>; 相关领域：医药卫生更多>>

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2013年武汉市呼吸道病毒感染病原谱分析研究被引量：14: 2015年; 目的：了解2013年武汉市呼吸道疾病病毒性病原谱构成.方法采用实时荧光定量 PCR（Real-Time PCR）方法对200份流感样病例标本进行16种病毒性病原体的检测.结果共检测出13种病毒阳性,总阳性率为43％；单病毒感染阳性率排名前3位的为鼻病毒（8．5％）、腺病毒（7．0％）、呼吸道合胞病毒 A （4．5％）；混合感染的比例占阳性病例的19．77％；性别对病毒感染阳性率并无明显影响；5岁以下婴幼儿是呼吸道病毒的主要感染人群,0～岁和1～5岁年龄组病毒阳性率较高,分别为40．6％和61．8％,60～岁年龄组病毒阳性率最低,为25．0％,且不同年龄组感染的优势病原有所差别；不同病毒感染季节性不同,有的病毒表现出严格的季节性,但总体而言冬春季病毒感染率较高.结论2013年武汉市上呼吸道感染的病原体以病毒为主,尤其在低龄幼儿组,鼻病毒、腺病毒及呼吸道合胞病毒感染为其上呼吸道感染的主要病原体.; 刘琳琳方斌李翔叶国军李国明; 关键词：呼吸道疾病病毒性病原谱

湖北省2010～2014年度流行性感冒流行态势分析被引量：11: 2016年; 目的对2010~2014年度湖北省流感流行态势进行分析,为流行性感冒疾病的防控提供科学数据支持。方法通过流行病学调查、病原学监测、流感病毒分型监测和暴发疫情监测,对湖北省近年的流感流行状况进行分析。结果2010~2014年,湖北省共报告75起流感样病例暴发疫情,流感样病例（influenza-like illness,ILI）比例平均为2.71%;0~5岁年龄组人群在ILI中所占比例最大,为62.48%;60岁以上年龄组人群所占比例最小,仅为2.91%。各年龄组流感样病例比例随时间呈现季节性差异。流感病毒检出型别分布呈现交替流行态势,2011及2013年度流感流行呈冬春季单峰,其余年度均呈现冬春季及夏季2个流行高峰。疫情报告的时间分布主要为每年春节前后及开学季。结论湖北省流感流行峰及优势型别呈现季节性及交替分布态势,长期而恒定的流行病学及病原学监测可以为流感疫情的预警、疫苗株的选择提供良好的实验室依据。; 刘琳琳方斌李翔叶国军李国明; 关键词：流行性感冒流行病学病原学

2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行和进化分析被引量：19: 2016年; 目的了解2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行分布和基因进化情况。方法通过测序和全球流感共享数据库(global initiative on sharing all influenza data,GISAID)获得2010-2015年湖北省乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuramidinase,NA)氨基酸序列,分别对其进行系统进化树、氨基酸突变位点和三维建模分析,结合同期病毒分离株流行分布,分析重配株基因进化与病毒流行分布间的关系。结果 2010-2015年湖北省乙型流感病毒存在系内重配和系间重配,首例重配株出现后,该病毒都会形成较大流行。同期病毒在HA四个主要抗原表位上发现的突变位点有:N116K、N129S、A146T、K162R和N197S,在NA上发现了神经氨酸酶活性突变位点D197N,三维建模表明该位点并非直接与底物或抑制物接触。结论 2010-2015年湖北省乙型流感病毒的流行与该病毒的基因进化关系密切,监测该病毒抗原表位突变位点和耐药突变位点有助于深入分析其进化特性。; 方斌刘琳琳李翔叶国军余晓宋毅; 关键词：乙型流感病毒抗原表位进化

湖北省大流行期和流行后期新甲型H1N1流感病毒基因特性分析被引量：20: 2017年; 目的了解湖北省大流行期和流行后期新甲型H1N1流感病毒在流行分布、基因进化、抗原表位和耐药位点等方面的差异情况。方法对2009-2014年湖北省大流行期和流行后期新甲型H1N1流感病毒血凝素和神经氨酸酶的系统进化树、进化速率和氨基酸突变位点进行对比分析。结果大流行期病毒核酸阳性率大于流行后期,但大流行期病毒血凝素和神经氨酸酶基因进化速率均小于流行后期,且神经氨酸酶进化速率在两个时期都大于血凝素。血凝素抗原表位突变位点K163Q、A186T、S185T和S203T在大流行期与流行后期病毒的分布数和位置存在不同偏嗜,流行期鲜有的H275Y耐药位点在流行后期的三株病毒中被发现。结论流行后期的新甲型H1N1流感病毒进化速率不断提高,抗原表位和神经氨酸酶抑制剂耐药位点不断积累,防控工作愈加严峻,需进一步加强该病毒基因特性和耐药分析的监测。; 方斌刘琳琳李翔叶国军余晓宋毅; 关键词：疾病暴发流行点突变

湖北省2007~2012年H3N2流感病毒HA基因及抗原性分析被引量：2: 2016年; 目的研究湖北省2007~2012年H3N2流感病毒HA基因变异及抗原性变化情况。方法选取2007~2012年分离的湖北省各地区H3N2流感病毒39株,提取病毒RNA,运用RT-PCR技术扩增HA基因并测定序列,软件导出其核苷酸、氨基酸序列,采用MEGA5.2构建进化树,用红细胞凝集抑制实验检测病毒的抗原性。结果 14株毒株红细胞凝集抑制结果显示效价与参照抗原有4倍以上的差异,提示H3N2流感病毒存在抗原性变异;核苷酸有较高的同源性,为97%~99%;HA1区共有50个氨基酸发生改变,其中37个在抗原位点,受体结合位点有2个（194、225位）,抗原决定簇A区4个,B区6个,C区2个,D、E区各1个;糖基化位点有明显的地域差异,不同地区糖基化位点的数量和位置均不相同。结论湖北省2007~2012年间H3N2流感病毒抗原性和HA基因存在变异。; 梁杨霍细香方斌刘琳琳陈盛杰刘准陈丹; 关键词：抗原性分析

湖北地区季节性H1N1流感病毒HA基因特性分析被引量：1: 2011年; 目的调查分析湖北地区季节性H1N1流感病毒血凝素(HA)的基因特性。方法收集2000年以来临床样品中分离鉴定的H1N1流感病毒毒株,运用RT-PCR扩增病毒HA基因,对扩增片段进行序列测定和分析。结果 H1N1流感病毒HA基因与同期世界卫生组织推荐的疫苗株相应基因的同源性为95.8%～99.6%,分离株HA基因中潜在的抗原性位点和糖基化位点与2000～2008年的疫苗株基本相同,但与2009年疫苗株有一定差异。HA基因进化分析表明在不同年份分离出的流感毒株呈现出不同的亲缘关系。结论湖北地区2000～2008年分离的季节性H1N1流感毒株与世界卫生组织同期推荐的疫苗毒株的HA核苷酸序列有高度同源性,HA基因重要抗原位点的氨基酸没有改变,但与2009年疫苗株有所不同,序列同源性和进化关系表明历年疫苗株可以给人群提供一定程度的保护。; 李静刘琳琳叶国军方斌邓渠霍细香; 关键词：甲型流感病毒疫苗株血凝素

2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒抗原漂移分析被引量：4: 2017年; 目的了解2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒流行特征、基因进化和抗原漂移情况。方法通过2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒核酸检测阳性率划分流行高峰,分析各流行高峰病毒的阳性数、分离数和进化簇分布,结合抗原决定簇氨基酸突变位点和三维建模数据,分析3C.2a簇病毒抗原决定簇氨基酸突变位点变化情况。结果 2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒存在8个流行高峰,流行高峰会受到其他型别流感流行的影响,3C.2a簇病毒主要在第Ⅶ流行高峰后流行,与3C.3a簇病毒在HA蛋白3处抗原决定簇上存在7处不同氨基酸突变位点,3C.2a簇病毒159Y-160T位点和3C.3a簇病毒159S-160K位点在三维模拟结构图中差异明显。结论 2010-2015年湖北省H3N2亚型流感病毒进化簇不断进化,加强对近期3C.2a簇病毒的进化学监测和抗原漂移分析,有助于提高湖北省流感病原学和流行病学监测水平和能力。; 方斌余晓李翔叶国军刘琳琳; 关键词：H3N2亚型流感病毒进化

流感检测阴性流感样病例手足口病毒检测结果分析被引量：2: 2011年; 目的为了解流感样病例流感病毒核酸检测阴性样品中手足口病的感染情况,为HFMD正确的临床诊断提供科学依据。方法收集153份流感样病例流感检测阴性的样本,提取病毒RNA,采用RT-PCR一步法检测人肠道病毒(PE)的5‘-UTR区基因、肠道病毒71型(EV71)的VP3-VP1区基因和柯萨奇病毒A16型(CVA16)的VP3-VP1区基因,采用琼脂糖凝胶电泳法分析PCR产物。结果 153份流感样病例流感阴性的样本中,有24例样本PE阳性(15.69%),5份为EV71阳性(3.27%),19份其他肠道病毒阳性(12.42%),没有CVA16感染;EV71阳性病例的年龄为10个月～4岁的儿童。结论在153份流感样病例流感检测阴性样本中,检出24份PE阳性、5份EV71阳性感染。; 方斌刘琳琳叶国军彭延邹文菁李翔戴莹李静霍细香; 关键词：肠道病毒流感

湖北省2006-2012年度流行性感冒监测结果分析被引量：15: 2015年; 目的对2006-2012年湖北省流感监测结果进行分析,为湖北省的流感防控工作提供科学依据。方法通过流行病学调查及病原学监测,对湖北省近年的流感流行状况进行分析。结果 2006-2012年,湖北省共报告297起流感样病例暴发疫情,流感样病例(influenza-like illness,ILI)比例平均为4.63%;0~5岁年龄组人群在ILI中所占比重最大,为50.71%;随着年龄的增长,ILI比例逐渐递减,60以上年龄组人群所占比重最低,仅为2.24%。各年龄组流感样病例比例随时间呈现季节性差异,疫情报告的时间分布主要为每年春节前后及开学季。毒株型别分布呈现交替流行态势,且除2011年外,其余年度均呈现冬春季及夏季两个流行高峰。结论湖北省流感流行峰及优势毒株呈现季节性及交替分布态势,长期稳定的病例及病原学监测可以为流感疫情的预警、疫苗株的选择提供良好的实验室依据。; 刘琳琳方斌叶国军李翔李国明; 关键词：流行病学

湖北地区季节性H1N1流感病毒NA和M基因特性分析被引量：1: 2012年; 目的分析湖北省2000年以来甲型流感病毒株神经氨酸酶(NA)和M基因特性,以及耐药性位点的变异情况。方法从2000～2008年临床样品中分离毒株,运用RT-PCR扩增NA和M基因,对扩增片段进行序列测定,利用DNAStar软件与世界卫生组织推荐的流感疫苗毒株进行同源性比较,对NA和M基因重要功能性位点和耐药性位点进行分析,利用Mega软件进化分析。结果2000～2008年临床样品流感病毒分离株的NA和M基因与同年疫苗株相应基因的同源性分别为96.6%～99.7%和96.6%～99.6%,分离株NA基因中潜在的抗原性位点和糖基化位点与2000～2008年疫苗株基本相同,与2009年疫苗株有一定差异。NA基因未发生耐药性突变,但M基因在2005年以后的分离株中发生了S→N突变。NA和M基因进化分析表明不同年份分离株呈现出不同的亲缘关系。结论湖北省季节性甲型H1N1流感病毒分离株与2000～2008年世界卫生组织推荐的疫苗毒株有高度同源性,但与2009年疫苗株有所不同,未出现达菲类药物抗药性位点的核苷酸突变,但2005年后的分离株在M基因上均发生金刚烷胺类耐药性突变。NA和M基因进化树中可以看到甲型H1N1流感病毒进化关系在时间(年)上具有聚集性。; 李静方斌刘琳琳叶国军邓渠霍细香; 关键词：甲型流感病毒疫苗株神经氨酸酶基质蛋白

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