目的：了解2013年武汉市呼吸道疾病病毒性病原谱构成.方法采用实时荧光定量 PCR（Real-Time PCR）方法对200份流感样病例标本进行16种病毒性病原体的检测.结果共检测出13种病毒阳性,总阳性率为43％；单病毒感染阳性率排名前3位的为鼻病毒（8．5％）、腺病毒（7．0％）、呼吸道合胞病毒 A （4．5％）；混合感染的比例占阳性病例的19．77％；性别对病毒感染阳性率并无明显影响；5岁以下婴幼儿是呼吸道病毒的主要感染人群,0～岁和1～5岁年龄组病毒阳性率较高,分别为40．6％和61．8％,60～岁年龄组病毒阳性率最低,为25．0％,且不同年龄组感染的优势病原有所差别；不同病毒感染季节性不同,有的病毒表现出严格的季节性,但总体而言冬春季病毒感染率较高.结论2013年武汉市上呼吸道感染的病原体以病毒为主,尤其在低龄幼儿组,鼻病毒、腺病毒及呼吸道合胞病毒感染为其上呼吸道感染的主要病原体.
目的了解2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行分布和基因进化情况。方法通过测序和全球流感共享数据库(global initiative on sharing all influenza data,GISAID)获得2010-2015年湖北省乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuramidinase,NA)氨基酸序列,分别对其进行系统进化树、氨基酸突变位点和三维建模分析,结合同期病毒分离株流行分布,分析重配株基因进化与病毒流行分布间的关系。结果 2010-2015年湖北省乙型流感病毒存在系内重配和系间重配,首例重配株出现后,该病毒都会形成较大流行。同期病毒在HA四个主要抗原表位上发现的突变位点有:N116K、N129S、A146T、K162R和N197S,在NA上发现了神经氨酸酶活性突变位点D197N,三维建模表明该位点并非直接与底物或抑制物接触。结论 2010-2015年湖北省乙型流感病毒的流行与该病毒的基因进化关系密切,监测该病毒抗原表位突变位点和耐药突变位点有助于深入分析其进化特性。
目的建立一种快速、灵敏、可视化的H7亚型禽流感病毒等温核酸扩增检测方法。方法针对H7N9禽流感病毒的HA片段保守区序列设计引物、探针,优化反应温度,建立H7亚型禽流感病毒的重组酶聚合酶扩增结合侧流层析试纸条检测技术,评价其特异性和敏感性,并与Real time PCR方法进行比较。结果该方法检测H7亚型禽流感病毒的最低检出限为20拷贝/μL,与其他流感/禽流感病毒无交叉反应,反应可在20~50℃温度范围内进行,临床样本检测结果与Real time PCR法一致性为100.0%。结论该检测方法具有快速、特异及灵敏的特点,为在基层和现场快速检测H7亚型禽流感病毒提供了新的方法。
