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严洁: 作品数：30 被引量：76H指数：5; 供职机构：南京师范大学生命科学学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金江苏省高校自然科学研究项目江苏省“青蓝工程”基金更多>>; 相关领域：生物学农业科学文化科学医药卫生更多>>

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教学改革驱动下的微课发展现状与相关问题分析被引量：5: 2016年; 微课作为一种新的教学资源,近几年来以其突破传统课堂教学的时空限制、促进课程资源共享等特有的优势推动了教育教学改革的新发展。本文主要从国内外微课的发展状况、微课的特征优势、微课的制作模式以及微课在当下的应用和出现的问题等方面进行了概述。微课的相关建设机构特别是教育部门应加强对优秀微课资源的整合利用,合理提升与开发微课在教学或培训过程中的应用,以此促进微课理论的深化改革,促使建设的系列微课程不断完善发展。; 李鹏刘雨亭刘晓璇周长发徐士霞严洁赵梦飞孙亚辉吐逊阿依·日介甫郭婉银; 关键词：教学模式

无蹼壁虎6个鸟类Z染色体连锁基因的cDNA克隆和序列分析: 2014年; 利用RT-PCR技术从无蹼壁虎中获得了6个鸟类Z染色体连锁基因的cDNA片段序列。与铅山壁虎的同源基因序列相比，除CHD1-5＆#39;端序列中有3 bp的缺失外，其他基因序列均具有相同的核苷酸和氨基酸长度，且核苷酸序列和氨基酸序列的保守性均非常高（97%~100%）。在与有鳞目、龟鳖目和鳄目的其他已知序列比较时，发现6个基因的8个片段有不同程度的同源性，其中GHR基因的同源性最低，与该基因片段在进化分析中较高的ω值（ Ka/Ks）是一致的。性染色体连锁基因的克隆和染色体定位，将有助于进一步了解壁虎类甚至高等脊椎动物不同类型性染色体的起源和进化。; 夏文君袁亚辉贺晓烈李鹏严洁周开亚; 关键词：无蹼壁虎性别决定

MHC及其在种群遗传学和保护遗传学中的应用被引量：30: 2002年; 主要组织相容性复合体(majorhistocompatibilitycomplex,MHC)是脊椎动物体内与免疫应答调节密切相关的一个基因家族,是基因组中多态性最丰富的区域。通过MHC的遗传变异分析可以提供物种的遗传多样性水平、进化历史和种群动态,以及种群遗传结构等信息,并在濒危物种饲养繁殖种群的遗传管理中有重要应用。; 杨光陈旭衍任文华严洁; 关键词：MHC 种群遗传学保护遗传学主要组织相容性复合体种群生存力种群遗传结构

中国壁虎属9物种的DNA条码技术被引量：3: 2010年; 测定了无蹼壁虎、粗疣壁虎和中国壁虎共17个样品的COI基因部分片段,结合其他已知序列,对我国9种壁虎的DNA条码序列进行比较分析,计算种间及种内平均遗传距离,并构建系统发生树.结果显示所有DNA条码都为各物种所独有,不存在物种之间的共享.属内种间差异明显大于种内差异,且同一物种的不同个体均聚成高支持率的单系群,提示该条码在壁虎属物种中有很好的识别能力,可以用于物种鉴定.DNA条码还为粗疣壁虎和铅山壁虎的物种有效性提供了有力的分子证据.; 严洁马晓燕杜婕周开亚; 关键词：DNA条码

克氏原螯虾PcCyc基因克隆及其对光周期的表达响应被引量：2: 2021年; 利用cDNA末端快速扩增技术克隆克氏原螯虾生物钟核心基因之一的周期循环蛋白(CYC)基因(命名为PcCyc基因)的部分cDNA序列。取雄性克氏原螯虾(体长9~11 cm)在全光谱日光灯不同光周期下(12L∶12D、0L∶24D和0L∶72D)培养结束后,于7:00、11:00、15:00、19:00、23:00、翌日03:00、7:00取样,采用实时荧光定量PCR检测PcCyc基因在脑、眼柄和肝胰腺中的mRNA表达水平。试验结果显示,PcCyc基因完整的开放阅读框共2010个碱基,可编码669个氨基酸。氨基酸序列与红螯螯虾CYC蛋白相似性为94%;蛋白分子量约73.963 ku,理论等电点6.56,为疏水性非分泌蛋白,无信号肽;结构域分析结果显示,PcCYC蛋白含有BHLH/PAS结构域,包括1个HLH结构域和2个PAS结构域;二级结构包含11个α-螺旋、12个β-折叠和24个无规则卷曲。不论光照如何改变,PcCyc基因在眼柄和肝胰腺中都基本遵循着24 h的节律振荡,而在大脑中的节律振荡随光照周期改变被打破。试验结果将为进一步探究克氏原螯虾Cyc基因在其昼夜生物钟节律中发挥的作用及机制奠定基础。; 谢伟蒋琦辰孙宾杨颖李鹏严洁周开亚; 关键词：克氏原螯虾 MRNA表达生物信息学

PCR扩增Sry基因进行鲸类动物性别的鉴定被引量：8: 2005年; 哺乳动物Y染色体短臂上的Sry基因决定雄性发育方向。本研究参照哺乳动物Sry基因保守区序列设计引物 ,以非性别特异性的线粒体DNA细胞色素b基因作为阳性对照 ,用PCR扩增江豚、长喙真海豚等鲸类动物的Sry基因片断并对其进行凝胶电泳分析来鉴定鲸类动物的性别。通过此方法对 87个已知性别鲸类动物标本的检验 ,结果完全正确 ,并进一步应用此方法成功地完成了另外 33个未知性别鲸类标本的性别鉴定。由此建立了一套简单、快速。; 王加连杨光周开亚魏辅文严洁; 关键词：SRY基因性别鉴定性发育 PCR扩增鲸类动物哺乳动物

中华绒螯蟹热激蛋白90基因内含子的克隆与界定被引量：1: 2013年; 热激蛋白家族中分子量为90kDa的热激蛋白(HSP90)是真核细胞胞质中最丰富和高度保守的蛋白质之一.HSP90作为一种重要的分子伴侣,广泛参与细胞的激素信号通路、细胞周期调控以及细胞发育等重要的生理过程;内含子(intron)是基因中的非编码DNA片段,参与基因的组织特异性表达、蛋白质变异、基因转录等多种生物学过程.本文通过PCR扩增得到了中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)HSP90(命名为EsHSP90)的3个内含子序列(分别为296 bp、140 bp和173bp),内含子1和内含子3的剪接符合GT-AG规律,而内含子2不遵循GT-AG或AT-AC规律.EsHSP90的DNA序列全长为3 126 bp.序列比对分析显示EsHSP90与已知甲壳动物的HSP90具有高于80%的序列相似度.; 张入峰宋金远李鹏陆舟严洁吴烨高勍; 关键词：中华绒螯蟹热激蛋白90 内含子

天空岛屿与半叶趾虎物种多样化: 在我国半叶趾虎属(Hemiphyllodactylus)物种主要分布于云贵高原地区，有海拔高、小种群、种群间相互隔离、多为局域分布且特有性高等的特点。本文联合线粒体ND2 和20 个核微卫星标记，对该属物种的遗传多样性、...; 刘莹莹陈靖哲蒋顺季柏儒柏林李鹏严洁周开亚

中华绒螯蟹翻译起始因子4G基因在幼体发育阶段的mRNA表达模式与适应性进化分析: 2022年; 真核生物翻译起始因子4G(eIF4G)充当衔接eIF4F复合体的骨架蛋白,在帽依赖性翻译起始中起关键作用.为探究中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)eIF4G基因在幼体发育阶段的作用,本研究利用RACE技术克隆了中华绒螯蟹eIF4G基因(命名为EseIF4G)的全长cDNA序列,利用实时荧光定量PCR技术检测该基因在幼蟹不同发育阶段的mRNA表达模式,并探讨其在节肢动物进化过程中是否发生了适应性进化.生物信息学分析显示,EseIF4G基因的cDNA全长为3769 bp,包含一个2379 bp的开放阅读框,编码792个氨基酸;该编码蛋白具有保守的MIF4G、MA3和W2结构域,无跨膜区、疏水性区域和信号肽,是不稳定且非分泌型蛋白.荧光定量PCR检测显示,EseIF4G基因在中华绒螯蟹受精卵、溞状幼体Ⅰ~Ⅴ期、大眼幼体期和仔蟹Ⅰ~Ⅲ期共10个幼体发育阶段广泛表达,EseIF4G基因mRNA表达量在卵至溞状幼体Ⅳ期相对较高,而在溞状幼体Ⅴ期至仔蟹Ⅱ期相对较低,在溞状幼体Ⅴ期降至最低,与在仔蟹Ⅱ期的表达量没有显著差异(P>0.05).选择压力分析显示,PAML的位点模型和分支位点模型没有鉴定出正选择位点,分支模型在中华绒螯蟹末端分支没有检测到正选择信号;利用Datamonkey在EseIF4G的氨基酸水平鉴定出两个正选择位点(448G和655N).现有数据表明,EseIF4G基因可能参与中华绒螯蟹幼蟹发育过程,特别是短尾化过程,调控mRNA翻译和蛋白质相互作用;同时,其在节肢动物进化过程中进化相对保守.; 吴海霞时昕晔周开亚严洁李鹏; 关键词：中华绒螯蟹 CDNA克隆适应性进化

基于模式物种的快速同源搜索软件基准测试: 2022年; 传统的blast+软件包中的blastp搜索,在大数据时代下,序列搜索速度已经慢得难以接受.同源搜索软件的开发在过去十几年取得了巨大进展,但缺乏综合的评估.本研究对7个快速同源搜索软件与blastp进行了综合比较,结果发现,diamond的fast模式总体上来说相比其他软件更快,并且有着最低的错误发现率,是追求快速搜索的最佳选择;在内存消耗上,MMseqs2的算法在内存消耗上非常低,而ghostx则最高;在鉴定的hits数量方面,除了blasp以外,MMseqs2的s7.5模式在中等基因组相似度GSS下得到的结果最多,但s5模式应是更好的选择.随着GSS的降低,ghostx得到的结果最多,而随着GSS的升高,ublast得到的结果最多;在鉴定的Reciprocal Best Hits(RBH)数量上,ghostx在远缘搜索上具有优势,这一优势同样也具有共线性证据支持.在同源搜索方面,除ghostx有43.4%的额外结果外,几乎所有软件的搜索结果之间都有着很大的重叠,并且ghostx还有着非常低的错误发现率,而MMseqs2的s3模式却有着最高的错误发现率.总之,MMseqs2、diamond和ghostx是综合来说最好的三款替代blastp搜索的软件,diamond非常适合进行直系同源推断,并且可以用“fast”模式准确地快速搜索,而“very”是权衡下来最佳的搜索模式,但如果是进行远缘物种的搜索,ghostx则更有优势,而对于中等GSS下同源蛋白的鉴定,MMseqs2的s5可能是更好的选择.; 王殷伟武晶菁张宸宁华宜家李鹏严洁

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