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高维肺癌病例-对照研究资料的随机森林降维分析被引量：7: 2012年; 目的探讨随机森林算法在肺癌高维病例-对照资料分析中的应用效果。方法选取500例医院来源肺癌患者作为病例组，以517名社区来源对照人群作为对照组，每名研究对象均常规采集静脉抗凝血5ml，位点基因型通过GoldenGate定制芯片平台分型，经筛选获得399个SNP位点，先利用随机森林算法进行降维，再用传统的logistic回归对降维后的变量进行分析，并采用受试者工作特征曲线（ROC）曲线下面积（AUC）分析多个SNP位点与肺癌的遗传易感性。结果经随机森林算法筛得50个平均重要性得分最高且错误率最低的变量，其中环境变量（吸烟、年龄分组、性别）的重要性得分均位于前20，分别为4．05、3．12、1．16；在调整3个环境变量后，经阳性结果错误率（FDR）法进干亍多重性校正，结果仍有统计学意义的SNP位点有6个（FDR—P〈0．05），而如果直接采用传统logistic回归分析，则无法发现有统计学意义的SNP位点。对于2个ROC曲线（分别为只包含环境变量模型ROC曲线、包含环境变量和SNP位点模型的ROC曲线）AUC（分别为0．6491±0．0172、0．6811±0．0166）的似然比检验结果表明，6个SNP位点与肺癌的关联性有统计学意义（χ^2=43．82，P=3．6×10^-11）。结论利用随机森林算法先剔除高维数据的噪声位点，再利用logistic回归分析，可提高检验效能，优于直接利用logistic回归分析。; 朱晶晶赵杨陆凤胡志斌陈峰; 关键词：肺肿瘤人工智能

miR-21靶向调节MARCKS基因影响人三阴性乳腺癌细胞多西紫杉醇敏感性的研究: 目的以三阴性乳腺癌亲代敏感细胞（MDA-MB-231/S）及其同系构建的多西紫杉醇耐药细胞（Docetaxel,Doc;MDA-MB-231/Doc）为研究对象,探讨 miR-21（MicroRNA-21,miR-21）...; 赵杨; 关键词：乳腺癌 MIR-21 多西紫杉醇; 文献传递

生物医学大数据统计分析方法与临床应用研究: 2020年; 以基因组学为代表的生物医学"大数据"时代已经来临.面对上百万指标的数据,常规分析方法已不能满足实际需求.新形势下生物医学研究迫切需要新的分析策略与方法.项目以"创新多组学数据填补与整合分析方法→创新疾病关键基因的筛选策略与方法→高维交互作用分析挖掘协同/拮抗因素→率先论证呼吸系统急重症的因果机制"为主线,深入地研究多种组学数据的分析方法及策略,解决了一系列统计理论方法技术难题,并成功运用于肺癌、急性呼吸窘迫综合征等研究领域.; 张汝阳魏永越沈思鹏赵杨陈峰; 关键词：生物医学大数据

浅谈生物统计本科生国际化交流与学习心得被引量：1: 2019年; 加强本科生国际化交流与学习互动,是全面提升人才素质的重要措施,也是高等教育人才培养的重要发展趋势。作者依据个人切身体会,结合生物统计学专业培养特点,从科研体验、课堂感受和学术活动三方面浅谈生物统计学本科生国际化培养心得。; 周佳薇倪森淼张慧慧谢璐赵杨杜牧龙; 关键词：生物统计学本科教育

血浆miRNA表达谱与胰腺癌相关性的研究被引量：8: 2012年; 目的:探讨血浆miRNA的表达水平与胰腺癌发病的关联。方法:通过TLDA(TaqMan low density array)芯片系统筛选24例胰腺癌患者和24例健康对照间差异表达的miRNA,对差异表达miRNA采用实时荧光定量PCR法进行单个样本验证。结果:miR-451和miR-409-3p的表达水平在胰腺癌组和对照组中有显著的差别,P值分别为0.004 1和0.005 7。这2个miRNAs的组合以93.8%的受试工作者曲线下面积(area under the ROC curve,AUC)将健康对照组和胰腺癌患者组分开(灵敏度为95.8%,特异度为91.7%)。结论:血浆miR-451和miR-409-3p的表达水平可有效区分胰腺癌患者和健康个体。; 潘峰闻洋马士杰曹维克董静赵杨胡志斌施瑞华; 关键词：胰腺癌 MIRNA 实时荧光定量PCR

SEIR动力学模型辅助北京市新发地新型冠状病毒肺炎疫情传播起始时间溯源和防控效果评价被引量：12: 2020年; 目的推测2020年6月北京市新发地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情首例感染的传播时间起点,辅助传染病溯源,评价当前综合防控效果。方法根据北京市卫生健康委员会官方报告统计每日发病人数,建立SEIR传染病动力学模型,基于每日发病人数拟合动力学模型,并搜寻本次疫情的传播时间起点;考虑不同的防控效果而拟合6月12日至7月1日的累计发病人数,以评估当前综合防控措施效果。结果北京市新发地疫情传播首例感染应起始于5月22日至5月28日之间(累计概率为95%),起始于5月25日的概率最大(23%)。本次疫情R0为4.22(95%CI:2.88~7.02)。模型拟合结果提示,截至6月11日,累计发病为99例(95%CI:77~121),符合实际情况。若不加控制,则截至7月1日累计发病估计将达到65090例(95%CI:39068~105037)。截至7月1日,较之无防控措施的理论情况,实际感染人数减少了99%。自6月12日起,北京市采取了强有力的综合防控措施,疫情实际走势接近于传播率降低95%的推演结果,敏感性分析支持这一结果。结论针对突发性疫情,传染病动力学模型可用来辅助推演传染病传播起始时间,辅助疫情溯源。北京市针对本次突发疫情所及时采取的综合防控措施迅速控制了95%以上的传播途径,减少了99%的感染人数,快速遏制了疫情,对于未来疫情防控具有重要的指导意义。; 魏永越官锦兴赵杨沈思鹏陈峰

基于马尔科夫链蒙特卡罗模拟方法的COVID-19年龄别病死率估计被引量：4: 2020年; 目的新型冠状病毒肺炎疫情已席卷全球,疫情结束前,其病死率的估计受现有确诊病例和发病到死亡时间分布的影响,且结论尚不明确,本研究旨在对新型冠状病毒肺炎的年龄别病死率进行估计。方法收集国家卫生健康委员会和CDC发布的新型冠状病毒肺炎疫情数据信息,采用Gamma分布拟合发病到死亡时间分布规律,采用马尔科夫链蒙特卡罗模拟估计年龄别病死率。结果新型冠状病毒肺炎的发病到死亡时间M=13.77(P25~P75:9.03~21.02)d,总病死率为4.1%(95%CI:3.7%~4.4%),0~、10~、20~、30~、40~、50~、60~、70~和≥80岁组病死率分别为0.1%、0.4%、0.4%、0.4%、0.8%、2.3%、6.4%、14.0%和25.8%。结论校正删失的马尔科夫链蒙特卡罗模拟方法适用于新发突发传染病疫情期间的病死率估计,尽早明确新型冠状病毒肺炎的病死率有助于疫情的防控。; 杜志成郝元涛魏永越张志杰沈思鹏赵杨唐金陵陈峰姜庆五李立明; 关键词：病死率

靶向临床试验全随机设计四种分析策略的比较: 2018年; 目的:探讨靶向临床试验全随机设计四种分析策略的统计学性能,为靶向药物研究分析方法的选择提供依据。方法:采用蒙特卡罗方法模拟数据,在不同参数组合下,比较序贯亚组特异性策略、序贯标志物阳性和总人群策略、标志物序贯设计及倒退设计的Ⅰ类错误和检验效能。结果:在阳性亚组分析中,当人群标志物阳性率较高时,四种分析策略的检验效能的差别较小,当人群标志物阳性率较低时,若靶向药物在不同标志物状态人群中疗效差异较大,序贯亚组特异性策略、序贯标志物阳性和总人群策略及标志物序贯设计的检验效能较高,若疗效差异较小,倒退设计和标志物序贯设计的检验效能较高;序贯亚组特异性策略及序贯标志物阳性和总人群策略能控制Ⅰ类错误。在总人群分析中,当阳性率较高时,序贯亚组特异性策略和标志物序贯设计的检验效能较可靠,当阳性率较低,疗效差异较大时,标志物序贯设计的检验效能最高,疗效差异较小时,标志物序贯设计和序贯亚组特异性策略的检验效能较好且差异不大。结论:在靶向治疗药物的全随机临床试验研究中,探寻靶向药物对阳性人群疗效时,宜采用序贯亚组特异性策略及序贯标志物阳性和总人群策略,仅当明确得知靶向药物在不同标志物状态的人群疗效的差异较小且人群标志物阳性率较低时,倒退设计是最优方法;而研究总人群疗效时,首要推荐标志物序贯设计。; 徐昌榕柏建岭柏建岭陈峰魏永越陈峰黄丽红魏永越于浩

肠内营养对质子泵抑制剂导致的胃肠道不良反应的保护作用被引量：6: 2019年; 目的:观察肠内营养对危重患者质子泵抑制剂(proton pump inhibitors,PPIs)相关的消化道不良反应的作用。方法:采用横断面研究,对全国100家医院ICU内2017年4月25日住院的所有患者(不包括当天新入院患者)进行问卷调查。所用问卷包括自行设计问卷和标准化问卷,了解患者一般情况、使用的药物和治疗、营养实施情况、喂养耐受性评估、实验室检查结果、体重指数(body mass index,BMI)、急性胃肠损伤(acute gastrointestinal injury,AGI)分级、SOFA(sepsis-related organ failure)评分、急性生理功能和慢性健康状况评分系统Ⅱ(acute physiology and chronic health evaluationⅡ,APACHE-Ⅱ)评分等。采用单因素分析使用PPIs是否对胃肠功能有所影响,多因素Logistic回归模型考察肠内营养是否为患者发生AGI的影响因素。结果:(1)未给予肠内营养的508例患者中,使用PPIs的401例(78.9%),未使用PPIs的107例(21.1%)。使用PPIs组的AGI 2～3级和AGI 4级的患者比例(17.0%和3.8%)明显高于非PPIs组(9.3%和1.9%),差异有统计学意义(P=0.027);(2)1 138例使用过PPIs的患者中,已开始肠内营养的724例(63.6%)患者AGI分级评分(AGI 2～3级为10.5%,AGI 4级为0.7%)优于未开始肠内营养的401例(35.2%)患者(AGI 2～3级为17.0%,4级为3.8%),差异有统计学意义(P<0.001)。但两组在28 d转归方面差异无统计学意义。多因素Logistic回归结果显示,肠内营养为AGI评分的独立保护因素(OR=0.353,95%CI:0.242～0.513,P<0.001)。结论:肠内营养与保护PPIs所导致的ICU患者胃肠功能损伤存在关联性,但未发现其与患者死亡率降低有关。; 董杰邢娟路国涛李百强杨琦童智慧赵杨李维勤; 关键词：肠内营养质子泵抑制剂 ICU

ADaM在仿制药生物等效性试验安全性分析中的应用被引量：2: 2020年; 目的:将临床数据交换标准协会(Clinical Data Inter-change Standards Consortium,CDISC)标准推广到临床试验中,推动临床试验数据的标准化。方法:结合分析数据模型(Analysis Data Model,ADaM)实施指南以及实际数据的常见问题,介绍分析数据模型ADaM在仿制药的生物等效性试验安全性中的应用。结果:针对不同类型的临床试验数据,根据可能发生的多种情形,生成了符合标准的安全性分析数据集。结论:在我国仿制药不断发展和临床试验数据标准化程度不高的背景下,在临床研究中使用CDISC标准,一方面可以推动临床试验数据的标准化,另一方面可以缩短统计分析的时间,加快药物研发的进程。; 朱天一蔡晶晶黄家俊耿正赵杨娄冬华于浩柏建岭; 关键词：生物等效性试验

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赵杨

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