杨润清
- 作品数：22 被引量：58H指数：4
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金博士科研启动基金黑龙江省青年科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学理学自动化与计算机技术更多>>
- 利用Bayesian方法进行番茄产量相关性状QTL连锁检测
- 番茄的始花节位,每序花数,结实率及单果重是影响番茄产量的重要的经济性状,因此研究控制这4个性状的基因数目,位置和基因效应,对于指导番茄分子辅助育种具有重大意义。本研究以性状差异显著的栽培番茄 XF98-7与野生醋栗番茄杂...
- 刘杨杨润清陈火英
- 文献传递
- 利用贝叶斯法进行水稻籽粒植酸含量性状的QTL定位及互作分析被引量：1
- 2009年
- 利用水稻植酸含量差异较大的品种中花11(粳型)和LPA(籼型)为亲本杂交获得F2群体的172个单株,构建了含126个SSR和4个STS标记的遗传连锁图谱,利用贝叶斯(Bayesian)法对水稻籽粒植酸含量性状进行了主效应QTL定位和上位性互作分析。共检测到3个与水稻籽粒植酸含量性状有关的主效QTL,分布在第3、5和6染色体的相应区间内,表型贡献率分别为5.38%、8.02%和4.62%,降低籽粒植酸含量的等位基因均来自亲本LPA。检测到10对上位性互作影响籽粒植酸含量,分布于水稻第1、3、5、6、11染色体上,互作效应值为1.69～5.18,其表型变异的解释率为8.67%～24.73%。
- 李茂柏王慧张建明李丁鲁杨润清周宇琼朴钟泽
- 关键词：水稻植酸数量性状基因座贝叶斯法
- 动物保种群有效含量的估计方法被引量：1
- 2003年
- 针对动物保种群的特点,指出了现行群体有效含量估计方法之不足;提出在估计保种群有效含量时应同时考虑来自群体数量结构与亲缘关系两个方面因素的影响;在改变了理想群体一个条件的前提下,推导出亲缘群有效含量的估计公式:或还给出保种群在两性数目不等情况下有效含量的估计方法,并通过举例演示了运用新公式的具体计算过程。1Ne=23N1+1∑N2Ni=∑12Nj=i+1F()ijNe=1.
- 孙华杨润清潘玉春
- 关键词：亲缘关系估计方法动物
- 动态性状主基因的分离分析新方法被引量：3
- 2005年
- 根据Legendre多项式的正交、可加和普适的特性,将关于时间的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,建立了动态性状主基因分离分析的数学模型,采用极大似然法求解模型参数。同建立在混合Logistic模型基础上的动态性状主基因分离分析法相比,新的方法在理论和实践上具有明显的优势:1)适合任何动态性状;2)能够同时分析主基因遗传效应和各种系统环境因素对动态性状变化过程的影响;3)便于计算;4)很容易推广到其他资源群体和复杂交配群体,充分利用多世代的资料实现对主基因的联合分离分析。以大豆1个F2群体为例采用新方法探索影响豆荚生长发育过程的主基因,结果表明:用2阶Legendre多项式能最佳的拟合主基因的作用和豆荚生长发育的变化规律;豆荚的生长发育过程受1对呈完全显性的主基因控制。
- 田佺杨润清宁海龙李文斌
- 关键词：动态性状LEGENDRE多项式主基因豆荚
- 随机回归模型理论及其应用被引量：4
- 2008年
- 随机回归模型在动物育种中已然成为分析纵向数据或者个体重复记录的一般方法。随机回归模型可分为基于重复率模型的随机回归模型、基于母体效应模型的随机回归模型、基于公畜模型的随机回归模型和二维随机回归模型等等。随机回归模型广泛应用于产奶性状、生长性状、生存性状、繁殖性状、基因型、环境互作的遗传分析;与此同时,人们也一直探索随机回归模型的优化问题,子模型函数的选择是其中热点之一。文章对随机回归模型的分类、优化及其在动物育种领域的应用进行了综述。
- 刘永新杨润清
- 数量性状基因定位的理论与实践
- 数量性状是可以量化的性状，由多个作用大小不尽相同且可能彼此间存在交互作用的基因控制并受环境影响。本文结合相关工作实例，较为详细地阐述数量性状基因定位的理论和应用效果。指出采用多个分析方法同时分析将比逐个分析多个标记或位点...
- Yang Runqing杨润清
- 关键词：基因定位数量性状工程实践
- 动物试验多指标差异的统计比较方法被引量：1
- 2005年
- 面对动物试验指标的综合性特征,过去人们习惯按每个试验指标分别独立地采用一元协方差分析法比较不同水平或处理效果间的差异,其结果一方面由于每个指标在不同水平或处理的表现可能不完全一致而很难下一个综合的结论;另一方面因为没有考虑各指标间可能存在的相关而最终得不到正确的统计结论.鉴于此,此次根据试验目的,结合多元方差分析、T检验与一元协方差分析方法系统地探讨了动物试验多指标差异的统计比较问题.
- 方铭高会江杨润清
- 关键词：T检验
- 远交群体动态性状基因定位的似然分析 Ⅰ.理论方法被引量：6
- 2004年
- 受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发 ,将关于时间 (测定日期 )的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中 ,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用 ,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。利用远交设计群体 ,阐述了动态性状基因定位的似然分析原理 ,推导了定位参数似然估计的EM法两步求解过程。结合动态性状遗传分析的特点和普通数量性状基因定位研究进展 。
- 杨润清高会江孙华Shizhong Xu
- 关键词：动态性状基因定位LEGENDRE多项式
- 数量性状两个候选基因检测效率分析被引量：1
- 2006年
- 文章采用Monte Carlo模拟方法分析了各种因素对两对数量性状检测效率的影响。采用回归分析法估计候选基因检测分析统计模型的参数;考虑了群体大小(个体数)、候选基因遗传贡献率和基因频率等3个因素。模拟试验结果表明,个体数对检测效率的影响不如遗传贡献率显著;检测高遗传贡献率的候选基因要比低遗传贡献率需要的群体小;基因频率对候选基因的检测效率几乎没有影响。
- 高会江郝立国罗静杨润清
- 关键词：数量性状候选基因MONTECARLO模拟
- 分类性状基因定位的多性状似然分析法
- 2005年
- 简单线性模型统计方法是业已被证明的与GLM法具有相近参数估计准确度和检测效率的一种二歧性状基因定位分析的简化方法。将适于二歧性状的一元线性模型推广到多类别分类性状基因定位分析中,文中提出采用多元线性模型对多类别分类性状进行基因定位分析。该方法首先将分类性状的各个类别转化为不同的二歧性状,并把每个二维数据看作是连续的,然后采用似然分析法,根据多性状联合定位的统计准则判断QTL的位置和估计QTL效应。模拟结果表明:新方法在大样本和中等遗传力条件下,能够以很高的计算效率相当准确地估计分类性状隐含变量给定的QTL位置和效应。
- 田佺杨润清
- 关键词：多性状基因定位多元线性模型遗传力大样本
