孙华
- 作品数:5 被引量:9H指数:2
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- 远交群体动态性状基因定位的似然分析 Ⅰ.理论方法被引量:6
- 2004年
- 受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发 ,将关于时间 (测定日期 )的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中 ,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用 ,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。利用远交设计群体 ,阐述了动态性状基因定位的似然分析原理 ,推导了定位参数似然估计的EM法两步求解过程。结合动态性状遗传分析的特点和普通数量性状基因定位研究进展 。
- 杨润清高会江孙华Shizhong Xu
- 关键词:动态性状基因定位LEGENDRE多项式
- 远交群体动态性状基因定位的似然分析 Ⅱ.模拟研究被引量:2
- 2004年
- 以远交设计群体为例 ,在推导出动态性状基因定位的似然法分析过程的基础上 ,选择 3阶Legendre多项式为子模型 ,采用Monte Carlo方法模拟研究了不同个体数、测定日频数、标记密度和QTL遗传贡献率对两种分析方法检测QTL效率的影响。每个因素都取高、中和低 3个水平 ,利用正交设计安排模拟因素试验组合。模拟试验结果表明 :高QTL遗传贡献率要比低QTL遗传贡献率的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样 ;但不论QTL遗传贡献率多大 ,30 0以上的群体大小和 5 %以上的测定日频数都可以保证足够高的检测效率。个体数和测定日频数对动态性状QTL的分析和检测具有几乎相同的作用 ,而且相同样本含量条件下两者呈现互补的关系。就某个动态点的QTL检测而言 ,模拟试验也同时证明
- 杨润清高会江孙华Shizhong Xu
- 关键词:动态性状基因定位LEGENDRE多项式
- 动物保种群有效含量的估计方法被引量:1
- 2003年
- 针对动物保种群的特点,指出了现行群体有效含量估计方法之不足;提出在估计保种群有效含量时应同时考虑来自群体数量结构与亲缘关系两个方面因素的影响;在改变了理想群体一个条件的前提下,推导出亲缘群有效含量的估计公式:或还给出保种群在两性数目不等情况下有效含量的估计方法,并通过举例演示了运用新公式的具体计算过程。1Ne=23N1+1∑N2Ni=∑12Nj=i+1F()ijNe=1.
- 孙华杨润清潘玉春
- 关键词:亲缘关系估计方法动物
- 动态性状基因定位理论框架的初步构建
- 把表型值随着时间(生命时期,年龄,胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态,生产水平,代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状.受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)...
- 孙华
- 关键词:LEGENDRE多项式最大似然法计算机模拟
- 文献传递
- F_2群体动态性状基因定位的极大似然分析被引量:1
- 2006年
- 把表型值随着时间(生命时期、年龄、胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态、生产水平、代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。以F2遗传设计群体为例,论述了动态性状基因定位分析的基本原理,推导了QTL效应大小和位置的极大似然法估计过程。选择3次Legendre多项式为子模型,采用MonteCarlo方法模拟F2设计群体,研究抽样群体大小和测定日密度对不同遗传力QTL检测效力的影响。利用正交设计安排因素试验组合,分析模拟试验结果表明:高遗传力的要比低遗传力的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样;但不论QTL的遗传力多大,300以上的群体大小和5%以上的测定日密度都可以保证足够高的检测效力。
- 高会江孙华陈学辉杨润清徐士忠
- 关键词:动态性状基因定位LEGENDRE多项式