李武峰 作品数:37 被引量:194 H指数:7 供职机构: 山西农业大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 中国博士后科学基金 山西省回国留学人员科研经费资助项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 文化科学 更多>>
绵羊Nanog基因部分编码序列的克隆及分析 2009年 利用NCBI中GenBank里查询到已登录的人、猪、牛和山羊的NanogmRNA序列,通过多重同源比较,获得高度保守区域序列,设计了同源引物,并首次对绵羊Nanog部分编码序列进行了分子克隆。经过PCR扩增,获得绵羊Nanog基因第二外显子168 bp(GenBank Accession:EF436277)、第四外显子124 bp(GenBank Acces-sion:EF596905)和第二外显子至第四外显子498 bp(GenBank Accession:EU016097)三个序列片段。经测序,三个序列已登录GenBank。绵羊Nanog第二显子168 bp与山羊相应序列相似性最高达97%,与人相应序列相似性最低达84%;绵羊Nanog第四显子124 bp与山羊相应序列相似性最高达100%,与人相应氨基酸序列相似性最低达73%;经判断,绵羊Nanog第二外显子至第四外显子498 bp序列片段应该是一段假基因序列,与山羊mRNA相应序列相似性最高达98%,与人mRNA相应序列相似性最低达83%。本研究为进一步研究绵羊Nanog基因表达谱提供了序列信息。 李武峰 岳文斌关键词:绵羊 NANOG 分子克隆 广灵驴 CAPN1基因克隆、生物信息学分析及表达研究 被引量:4 2020年 本研究旨在对钙蛋白酶1(CAPN1)基因CDS区进行克隆及生物信息学分析,并鉴定其在广灵驴各组织中的表达量。应用生物信息学方法对广灵驴CAPN 1基因CDS区进行序列分析,并对其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、翻译后修饰结构和蛋白结构进行预测;利用实时荧光定量PCR技术对CAPN 1基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌6种组织中的表达水平进行分析。结果显示,广灵驴CAPN 1基因CDS区全长2148 bp,可编码715个氨基酸,已提交至NCBI,登录号为:MN158194,其核酸序列与马、绵羊、牛、人、山羊、小鼠、猪的同源性分别为99.7%、92.3%、92.5%、92.0%、92.5%、85.9%和92.9%;CAPN1蛋白的分子质量为82.01 ku,理论等电点为5.59,平均疏水性为-0.374,不稳定系数为36.42,不存在跨膜区及信号肽;其编码蛋白的二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、β-转角和延伸链组成;CAPN 1基因在广灵驴的6种组织中均表达,其中在背最长肌中的表达量最丰富,其次是肝脏,在心脏中的表达最低。本研究成功克隆了广灵驴CAPN 1基因CDS,并对其在不同组织中的表达量进行了分析,为进一步研究CAPN 1基因在肌肉嫩度方面的表达调控功能及发展地方品种广灵驴肉制品产业提供了理论依据。 赵婧微 孙瑜彤 李武峰关键词:广灵驴 CAPN1基因 克隆 生物信息学分析 广灵驴SCD基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析 被引量:1 2021年 [目的]本试验旨在对广灵驴SCD基因CDS区进行生物信息学分析,并检测其在广灵驴组织中的表达,为探究SCD基因在广灵驴脂肪沉积中的作用提供理论参考。[方法]设计SCD基因同源引物,RT-PCR法克隆CDS序列,对SCD基因编码产物进行生物信息学预测,同时使用qRT-PCR法检测广灵驴7个组织中SCD基因的表达量。[结果]广灵驴SCD基因CDS长1080 bp,可编码359个氨基酸,提交到GenBank,获得登录号:MW132164。广灵驴编码序列与马、牛、双峰驼、猪、绵羊、人、小鼠、大鼠的同源性分别为99.4%、89.2%、90.7%、90.1%、89.5%、88.2%、81.2%、82.4%。SCD蛋白分子质量为41.55 ku,等电点为9.29,不稳定指数为45.54,平均疏水指数为-0.146,属于不稳定的碱性亲水蛋白。SCD蛋白既没有信号肽也没有卷曲螺旋,有4个跨膜区,主要定位在内质网。二级、三级结构显示,SCD蛋白主要由α-螺旋(40.67%)和无规则卷曲(40.11%)构成。SCD基因在广灵驴7个组织内都表达,在肝脏、肺脏和皮下脂肪中的表达量最高,心脏和背最长肌最低。[结论]本研究结果可为今后探究SCD基因在广灵驴脂肪沉积中的功能,以及提高广灵驴乳肉品质奠定基础。 关家伟 孙瑜彤 邱丽霞 李武峰 杜敏关键词:广灵驴 基因克隆 生物信息学分析 哺乳动物克隆技术研究进展 被引量:4 2017年 自首例克隆羊"多莉"诞生以来,哺乳动物克隆技术研究就广受关注,应用此技术已获得了小鼠、水牛以及家兔等动物。总结了近年来克隆过程中的关键技术和获得的研究成果,不仅更进一步了解了胚胎发育、细胞生长等生物现象,同时也为将来解决克隆中存在的问题,如成功率低、胎盘肥大、重编程异常、出生死亡率高等奠定了理论基础,开拓了新的思路。随着哺乳动物克隆技术的迅速发展,其在多个领域应用前景广阔,如利用克隆技术进行快速大规模的品种改良、有效地保护濒危动植物,并可将核移植技术应用于疾病的治疗,通过克隆生物反应器生产所需的物质,具有重要的实践意义。 张荣华 王曦 李武峰关键词:哺乳动物 克隆技术 晋南驴mtDNA D-loop区部分序列系统进化分析与体型测定 被引量:4 2020年 [目的]晋南驴是中国优良的中大型地方良种。随着社会经济的发展,这一种质资源的规模已经大为减小。为保护晋南驴种质资源,急需对晋南驴进行系统化分析与测定。[方法]本研究以晋南驴为研究对象,测定了试验驴群的身高、体长、胸围和管围等体型性状,并就晋南驴每一个体mtDNA D-loop保守区480 bp的片段进行测序,并使用ClustalX和Dnasp5.10等软件分析了驴群的变异情况。[结果]该驴群mtDNA D-loop区核苷酸多样度为0.02707;核苷酸多态位点97个,多态位点比例为20.21%。共检测到54种单倍型,单倍型多样度为0.867,单倍型比例为54.55%,采用邻近归并法构建的系统发育树分析结果显示该群体的亲缘关系主要分为两支。[结论]晋南驴遗传多样性较为丰富,但该晋南驴群体在亲缘关系上有一定的分化,说明该驴群有一定的混杂,急需开展相应的晋南驴保种工作。 李慧锋 赵婧微 陈员玉 程俐芬 曹宁贤 解建平 靳鲁柱 李武峰关键词:亲缘关系 基于HS-SPME-GC-MS和OPLS-DA模型探究不同嫩度驴肉的关键挥发性物质成分差异 被引量:8 2022年 旨在检测驴肉挥发性物质成分,探究与广灵驴嫩度相关的关键差异风味物质并解析关键挥发性物质与嫩度基因之间的功能与联系。本研究选用30头生长环境和饲养条件相同、年龄相近的雌性广灵驴为研究对象,进行剪切力和肌内脂肪的测定并依据含量差异将其分为高嫩度组(HT,n=4)和低嫩度组(LT,n=4)。通过HS-SPME-GC-MS技术检测广灵驴背最长肌挥发性物质成分,利用香气活性值(odor activity value, OAV)筛选驴肉关键风味物质,并结合多元统计分析方法获得变量重要性投影(variable importance in the projection, VIP)筛选与嫩度相关的关键差异风味物质,后基于Pearson系数与转录组学进行联合分析,寻找出驴肉嫩度关键风味物质与差异基因之间的联系。结果,在广灵驴背最长肌中共鉴定出41种挥发性物质,包括醇类、醛类、烃类、酮类、酯类以及2种其他物质。通过OAV筛选出13种关键风味物质,发现影响驴肉的主要挥发性物质和贡献者是醛类。通过VIP和OAV值筛选出1-辛烯-3-醇、1-辛醇以及月桂醛既是嫩度的差异物质又是对驴肉风味有贡献的关键风味物质。利用Pearson系数筛选与关键风味物质相关的差异基因并对其进行KEGG功能分析,发现1-辛烯-3-醇的相关基因主要富集在果糖和甘露糖代谢、糖酵解/糖异生、胰高血糖素信号通路等;1-辛醇相关基因主要富集在胰岛素信号通路、丁酸代谢、Ⅱ型糖尿病、多种脂肪细胞因子信号通路等;月桂醛相关基因则多富集在次生代谢物的生物合成、胰岛素信号通路、糖酵解/糖异生、戊糖磷酸途径等。这些通路可能参与了驴肉关键风味物质1-辛烯-3-醇、1-辛醇以及月桂醛的形成。本研究利用SPME-GC-MS技术检测了驴肉的风味挥发性物质并分析了驴肉不同嫩度风味差异,筛选出1-辛烯-3-醇、1-辛醇和月桂醛3种嫩度差异物质和关键风味物质。KEGG富集结果分析 李武峰 邱丽霞 关家伟 李丽 杜敏关键词:嫩度 风味 转录组学 牛4个、山羊3个和绵羊1个基因克隆、序列特征分析、SNP检测及与生产性状的关联分析 李武峰大类招生模式下生物技术专业创新型人才管理模式的改革与实践 被引量:3 2018年 为了解决大类招生后重组班级种学生间的熟悉和凝聚力下降等问题,探索创新型人才管理的新模式,培养出适应能力强的复合型人才。本文对基于大类招生下的生物技术专业学生的管理模式进行探究。 张利环 牛颜冰 李武峰 朱芷葳 王向英 赵慧婷 温娟关键词:大类招生 生物技术 广灵驴ADD1基因的克隆和序列分析与组织表达 被引量:1 2020年 运用RT–PCR方法,克隆广灵驴的ADD1基因的CDS区,对其进行序列分析,并通过qRT–PCR技术鉴定ADD1基因在广灵驴心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌中的相对表达水平。结果表明:广灵驴ADD1基因完整的CDS序列全长为2223 bp,可编码740个氨基酸,序列已提交到NCBI,登录号为MN_166472,其核苷酸序列与马的核苷酸序列的同源性最高,达99.6%;生物信息学预测ADD1蛋白为结构稳定的亲水性蛋白,理论等电点为5.58,二级结构主要以α–螺旋和无规则卷曲为主,存在1个Ⅱ类醛缩酶和内收蛋白N端超家族结构域,该蛋白没有信号肽及跨膜区域,主要定位在细胞核中,序列中共存在88个磷酸化位点,69个O–糖基化位点和3个N–糖基化位点;实时荧光定量检测结果表明,ADD1基因在广灵驴的6种组织中均有表达,但存在差异,在背最长肌中表达量最丰富,在肝脏中表达量最低。 李武峰 孙瑜彤 赵婧微 李树军关键词:广灵驴 克隆 生物信息学分析 广灵驴CAST基因的克隆与表达 被引量:2 2020年 对广灵驴钙蛋白酶抑制(CAST)基因进行克隆及序列分析,并用实时荧光定量PCR技术对其在心、肝、脾、肺、肾和背最长肌等6种组织中的表达水平进行分析,探究CAST基因对驴肉品质的影响.结果表明,广灵驴CAST基因的CDS编码区全长2427 bp,共编码808个氨基酸,将测序序列提交至NCBI,得到的GenBank登录号为MN231002.广灵驴CAST蛋白的氨基酸序列与马、牛、人、猪、山羊、绵羊、小鼠、鸡的同源性分别为98.6%、77.1%、70.8%、77.5%、70.1%、60.9%、65.1%和41.5%;CAST基因在广灵驴6种组织中均存在表达,其中,表达量最高的组织为背最长肌.本试验成功获得了广灵驴的CAST基因,并发现其在背最长肌中高度表达,为进一步研究CAST基因在肌肉嫩度方面的表达调控功能提供参考. 李武峰 赵婧微 孙瑜彤 杜敏关键词:广灵驴 基因克隆