徐春艳
- 作品数:19 被引量:6H指数:2
- 供职机构:中国科学院上海应用物理研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国科学院知识创新工程领域前沿项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学理学核科学技术机械工程更多>>
- 多波长反常散射法解析Sau3AI蛋白C端结构域晶体结构被引量:1
- 2008年
- 用同步辐射装置收集了Sau3AI的C端蛋白晶体在Se吸收边附近三个波长下的衍射数据,通过多波长反常散射(Multi-wavelength Anomalous Dispersion,MAD)法解决了晶体的衍射相位问题,解析了Sau3AI的C端蛋白的结构。结果表明,Sau3AI-C的结构与DNA错配修复蛋白MutH相似,结构中间的凹槽是Sau3AI-C与DNA的潜在结合区域。
- 徐春艳郁峰孙丽华唐琳胡小健何建华
- 关键词:晶体结构
- 火球菌RecJ蛋白的表达纯化及结晶
- 2013年
- RecJ蛋白是一类在细菌和古菌中高度保守的蛋白,在细胞内参与同源重组、甲基指导的碱基错配修复和碱基切除修复等过程。RecJ蛋白除了可以从单链DNA的5端降解DNA外,还可以从单链RNA的3端降解RNA。为能够从结构上阐明古菌火球菌(Pyrococcus furiosus)RecJ蛋白在细胞内的功能和其对不同底物(RNA/DNA)的降解活性的影响,本实验采用蛋白质晶体学的方法,通过蛋白质的表达纯化,晶体筛选得到了火球菌RecJ蛋白的晶体,并通过结晶条件的初步优化得到了有衍射的晶体。
- 杨敏李敏军周欢陈亚星孙丽华郁峰徐春艳唐琳何建华
- 关键词:X射线衍射
- 沼泽红假单胞菌砷(Ⅲ)S-腺苷甲基转移酶的初步晶体学分析
- 2012年
- 含砷化合物有高毒性,一直是全球性的公共卫生难题。许多微生物能利用S-腺苷甲基转移酶(ArsM酶)催化有剧毒的无机As(Ⅲ)发生甲基化而解毒。为揭示酶促反应的真实机制,我们将来源于沼泽红假单胞菌(Rhodopseudanonas palustris)的ArsM酶(RpArsM)重组表达、纯化及结晶。在上海光源BL17U1线站收集蛋白晶体衍射数据,初步晶体学分析表明,RpArsM酶的晶体属于P212121空间群,晶胞参数分别是a=45.92,b=66.58,c=147.82,α=β=γ=90°,衍射分辨率达2.0。
- 黄麟飞郁峰徐春艳唐琳何建华
- 关键词:沼泽红假单胞菌
- 上海光源生物大分子晶体学光束线站实验技术发展
- 何建华汪启胜王志军郁峰张坤浩潘强岩杨利峰周欢徐春艳孙波
- 1.9分辨率μ-crystallin蛋白晶体结构及其酮亚胺还原酶活性位点分析被引量:2
- 2012年
- 采用不同的结晶条件生长了μ-crystallin晶体(CRYM)并解析了人源CRYM与NADPH复合物晶体结构(PDB code 2I99),将分辨率由2.6提高至1.9,修正了2I99的结构。CRYM单体相较2I99结构少3个β折叠和一个310螺旋。NADPH Pro-R面具有多个保守位点可能参与酮亚胺还原酶活性,通过与同源蛋白OCD和AlaDH比对,推测了底物结合位点和催化位点。
- 许新磊李健孙丽华徐春艳何建华
- Sau3AI蛋白C端结构域晶体结构与功能
- 限制性内切酶Sau3AI识别5’-GATC-3’序列,并在G的5’端切断双链DNA。Sau3AI由两个结构域组成,其N端结构域(残基1-219)与DNA错配修复蛋白MuLH有高达40%的序列同源性,并且都含有在二型限制性...
- 徐春艳郁峰李颖丁滪孙丽华唐琳胡小健张志鸿何建华
- 文献传递
- 采用裸云母作为蛋白质晶体生长基底的方法
- 本发明公开了一种采用裸云母作为蛋白质晶体生长基底的方法,其包括下列步骤:将蛋白及其沉淀剂溶液滴在硅烷化的云母表面,在液滴上面覆盖新解理的裸云母片,在覆盖之前先在两云母片之间设置隔离装置;再将得到的体系翻转覆盖在按常规加有...
- 唐琳孙丽华徐春艳胡钧何建华
- 文献传递
- 热休克蛋白90的N端与ATP类似物的晶体结构揭示其功能调控被引量:2
- 2012年
- 分子伴侣热休克蛋白90(Hsp90)对于许多涉及细胞周期调控、信号转导以及细胞生长调控蛋白质的折叠、成熟及稳定是必需的.Hsp90的N端结构高度保守,包含一个ATP结合口袋并具有ATP酶活性,Hsp90的功能依赖于ATP与Hsp90结合后诱导的构象重排及之后的ATP水解.为了深入研究ATP与Hsp90结合后N端的结构及其功能状态,使用悬滴法共结晶了Hsp90的N端与ATP类似物AMPPNP及ATPγS的复合物,并利用分子置换法对其结构进行了解析.两个复合物晶体结构都捕获到了核苷酸的电子密度,尤其是γ-磷酸的电子密度,从而观察到γ-磷酸与蛋白质之间的相互作用.ATPγS中γ-磷酸的捕获证实了之前报道的结构中没有捕获到γ-磷酸是其处于无序状态而非被水解.单体状态下的人源Hsp90N-AMPPNP与处于二聚体化的酵母Hsp90-AMPPNP结构对比可见S1和ATP lid的位置有明显区别,结构分析表明,E18-K100和N40-D127之间形成的氢键相互作用,在一定程度上阻碍了S1和ATP lid的摆动,很可能阻止了二聚体的形成.
- 李健孙丽华徐春艳郁峰周欢唐琳何建华
- 关键词:相互作用
- 上海光源生物大分子晶体学线站
- 上海光源生物大分子晶体学光束线站(BL17U1)是上海光源首批七条线站中专门用于蛋白质晶体结构测定的线站,具有高通量、较小光斑、低发射度、高分辨率、小等特点,可满足从较大晶胞到较小晶体的蛋白质晶体结构测定。为了提升实验站...
- 汪启胜郁峰王思胜黄胜孙波徐春艳刘科孙丽华王志军张坤浩潘强岩杨利峰何建华
- 文献传递
- 上海光源生物大分子晶体学光束线站实验技术发展
- <正>上海光源生物大分子晶体学线站(BL7U1)作为上海光源第一条蛋白质晶体结构研究线站,建造之时主要技术指标确定为高通量、低发散度、较小聚焦光斑尺寸(30~70?m),以兼顾各种实验需求、实现对常见晶体类型的高分辨、高...
- 何建华汪启胜王志军郁峰张坤浩潘强岩杨利峰周欢徐春艳孙波
- 文献传递