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38kDa抗原用于肺结核血清学诊断的meta分析: 2011年; 目的系统评价38kDa抗原对肺结核的诊断价值并作meta分析。方法制定原始文献的纳入、排除标准及检索策略，检索Pubmed，EMBASE，BIOSIS，WebofScience以及维普、万方、中国知网（日期：1990年1月01日-2009年11月30日。纳入的文献采用QUADAS进行质量评价，用MetaDisc1．4软件进行meta分析。结果符合标准的共有26个研究，备研究间存在畀质性，但不存在阈值效应。合并后的诊断优势比为29．48195％C1（14．43～60．26）1，敏感度为O．53195％CI（0．51-0．55）]，特异度为O．94195％CI（0．93～0．95）]，阳性似然比为14．22195％CI（6．77—29．89）】，阴性似然比为0．51195％CI（0．45～0．57）]。SROC曲线的AUC面积为0．730，Q＊指数为0．667。结论血清38kDa诊断肺结核的效能中等，不能取代痰涂片检查。; 吴奎海王凤平孙静静王前芮勇宇; 关键词：肺结核 META分析

洋葱伯克霍尔德菌整合子Ⅰ和ISCR1分布及ERIC-PCR分型被引量：6: 2011年; 目的研究临床分离洋葱伯克霍尔德菌的整合子Ⅰ和ISCR1的分布情况,并对其进行基因分型。方法分离临床70株洋葱伯克霍尔德菌,用WHONET5.4分析菌株药敏情况,ERIC-PCR进行基因分型。PCR检测整合酶Ⅰ、整合子Ⅰ、ISCR1以及ISCR1携带的耐药基因。结果洋葱伯克霍尔德菌对氨曲南、庆大霉素、阿米卡星高度耐药,对复方新诺明、米诺环素、哌拉西林/他唑巴坦、美洛培南的敏感率较高。70株洋葱伯克霍尔德菌分为15个基因型,14株整合酶阳性,9株整合子Ⅰ阳性,4株ISCR1阳性,2株ISCR1和ISCR1携带的耐药基因阳性。结论整合子Ⅰ和ISCR1在洋葱伯克霍尔德菌的携带率低,ERIC-PCR可用于临床分离洋葱伯克霍尔德菌的基因分型。; 吴奎海孙静静陈清俞守义王前芮勇宇; 关键词：洋葱伯克霍尔德菌整合子 ERIC-PCR

实时荧光定量PCR技术诊断肺结核的meta分析被引量：2: 2011年; 目的系统评价实时荧光定量PCR技术对肺结核的诊断价值并作meta分析。方法检索Pubmed,EMBASE,BIOSIS,Web of Science以及维普、万方、中国知网、中国医学生物文献数据库。按照Cochrane协作网推荐的诊断试验纳入标准筛选文献,纳入的文献采用QUADAS进行质量评价,用MetaDisc 1.4进行meta分析。结果符合标准的共有21个研究,各研究间存在异质性,但不存在阈值效应。合并后的诊断优势比为105.32,敏感度为0.64,特异度为0.96,阳性似然比为19.79,阴性似然比为0.31。SROC曲线的AUC面积为0.9816,Q*指数为0.9402。结论荧光定量PCR技术检测结核分枝杆菌有着较高的敏感性和很强的特异性,可作为临床肺结核诊断的重要辅助手段,但并不能完全取代痰涂片检查。; 郑芬吴奎海孙静静芮勇宇; 关键词：实时荧光定量PCR 肺结核 META分析

临床难鉴定细菌和真菌核糖体基因扩增及序列分析被引量：3: 2011年; 目的建立核糖体测序方法鉴定临床难鉴定的细菌和真菌。方法分别利用通用引物扩增细菌16S rRNA基因和真菌核糖体转录间隔区2(ITS2),对PCR产物进行测序,在GenBank中对测序结果进行Blastn等分析。结果21株临床常见细菌和8株真菌测序结果与表型鉴定符合,检测出6株临床难鉴定细菌和真菌。结论核糖体测序可以作为临床难鉴定细菌和真菌的分子生物学诊断方法。; 吴奎海孙静静王前芮勇宇; 关键词：细菌真菌 16SRRNA基因转录间隔区

泛耐药鲍曼不动杆菌整合子Ⅰ和ISCR1结构及基因分型研究被引量：3: 2012年; 目的研究从临床分离的鲍曼不动杆菌的整合子Ⅰ和ISCR1的分布及结构情况,并对其进行基因分型。方法分离自临床的57株鲍曼不动杆菌,PCR检测整合酶Ⅰ、整合子Ⅰ、ISCR1以及ISCR1可变区,PCR产物进行限制性片段长度多态性(RFLP)分型并进行测序分析可变区携带的耐药基因盒,ERIC-PCR进行基因分型。结果 49株整合酶I阳性,其中47株整合子I扩增阳性,RFLP分为2型,测序结果为aacA4-catB8-aadA1和drf17-aadA5。3株ISCR1以及ISCR1可变区扩增均阳性,可变区经RFLP分为1型,测序结果为orf513-qnrA1-ampR-qacEdeltal,ISCR1阳性菌整合子I均阳性,经ERIC-PCR检测将57株鲍曼不动杆菌分为27个基因型。结论Ⅰ类整合子广泛存在于鲍曼不动杆菌中,ISCRI携带率较低,氨基糖苷类、甲氧苄啶类和β-内酰胺类耐药基因盒较常见,ERIC-PCR可用于临床鲍曼不动杆菌的分子流行病学研究。; 孙静静吴奎海陈清俞守义芮勇宇; 关键词：鲍曼不动杆菌整合子 ERIC-PCR

嗜麦芽窄食单胞菌整合子I和ISCR1研究及ERIC-PCR基因分型被引量：4: 2011年; 目的了解临床分离嗜麦芽窄食单胞菌的整合子I和ISCR1的分布情况及其基因型。方法分离临床85株嗜麦芽窄食单胞菌,用WHONET5.4分析菌株药敏情况,采用ERIC-PCR方法进行基因分型。采用PCR检测整合酶I、整合子I、ISCR1以及ISCR1携带的耐药基因。结果嗜麦芽窄食单胞菌对亚胺培南、氨曲南、庆大霉素、阿米卡星高度耐药,整合子I阳性菌株和整合子I阴性菌株对复方新诺明耐药性差异有统计学意义。85株嗜麦芽窄食单胞菌12株整合酶阳性,11株整合子I阳性,2株ISCR1和ISCRI携带的耐药基因阳性,ERIC-PCR分为75个基因型。结论整合子I在嗜麦芽窄食假单胞菌中介导复方新诺明耐药性方面有重要作用,ERIC-PCR是研究临床分离嗜麦芽窄食假单胞基因分型的有效方法之一。; 吴奎海孙静静陈清俞守义王前芮勇宇; 关键词：嗜麦芽窄食单胞菌整合子 ERIC-PCR 基因分型

铜绿假单胞菌整合子Ⅰ和ISCR1分布及ERIC-PCR分型被引量：6: 2012年; 目的研究临床分离铜绿假单胞菌的整合子Ⅰ和ISCR1的分布情况,并对其进行基因分型。方法分离临床234株铜绿假单胞菌,用WHONET5.4分析菌株药敏情况,PCR检测整合酶Ⅰ、整合子Ⅰ、ISCR1以及ISCR1携带的耐药基因。ERIC-PCR进行基因分型。结果铜绿假单胞菌对阿莫西林/克拉维酸、氨苄西林、氯霉素、头孢唑啉、米诺环素、氨苄西林/舒巴坦高度耐药,对环丙沙星、头孢他啶、头孢哌酮/舒巴坦、阿米卡星、亚胺培南、美洛培南较敏感,118株整合酶Ⅰ阳性,95株Ⅰ类整合子可变区阳性,3株ISCR1和ISCRI携带的耐药基因阳性。118株整合酶Ⅰ阳性铜绿假单胞菌分为89个基因型。结论Ⅰ类整合子广泛存在于铜绿假单胞菌中,ISCRI携带率较低,ERIC-PCR可用于临床分离铜绿假单胞菌的基因分型。; 孙静静吴奎海芮勇宇; 关键词：铜绿假单胞菌整合子 ERIC-PCR

铜绿假单胞菌整合子Ⅰ和ISCR1分布及ERIC-PCR分型: 目的研究临床分离铜绿假单胞菌的整合子Ⅰ和ISCR1的分布情况,并对其进行基因分型。Ⅰ类整合子广泛存在于铜绿假单胞菌中,ISCRI携带率较低,ERIC-PCR可用于临床分离铜绿假单胞菌的基因分型。; 孙静静吴奎海芮勇宇; 文献传递

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孙静静