谭小林
- 作品数：7 被引量：14H指数：3
- 供职机构：泸州医学院附属医院更多>>
- 发文基金：四川省卫生厅科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 血清低分子量差异蛋白质组在食管癌诊断和分期中的作用研究
- 2011年
- 目的:研究食管癌癌变过程中血清低分子量蛋白的细微变化,探索食管癌发生的机制、寻找食管癌早期诊断的生物标志物和方法。方法:应用表面激光解析电离飞行时间质谱技术对食管癌患者和健康对照血清进行蛋白质谱指纹图谱检测,通过Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,使用人工神经网络软件建立食管癌早期诊断模型并用盲法验证其诊断效果;将食管癌早期和中晚期食管癌患者血清质谱图进行比对分析,寻找各期差异蛋白,并建立分期诊断模型。结果:发现食管癌和正常人差异蛋白5种,早期食管癌和中晚期食管癌差异蛋白3种。通过早期食管癌组和健康对照组建立早期诊断模型的灵敏度87.88%,特异度91.43%,准确度89.71%,经过盲法验证结果为灵敏度95.83%,特异度89.13%,准确度91.43%。建立的分期诊断模型中,早期食管癌和中晚期筛选的差异蛋白建立的分期诊断模型灵敏度75.76%,特异度79.17%,准确度77.19%。结论:表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)联合人工神经网络技术操作较为简便,在食管癌的诊断和分期上具有可行性。
- 任兴军谭小林杨成虎李小琼冯峰胡琼英丁银环戴天阳王开正
- 关键词：食管癌蛋白组学SELDI-TOF-MS
- 食管癌血清蛋白质谱揩纹图分析及人工神经网络诊断模型研究
- 2010年
- 目的利用高通量和高灵敏的表面激光解析电离飞行时间质涪技术（SELDI—TOF—MS）寻找食管癌患者血清中微量的标志性差异蛋白质组，为探索食管癌发生与基因转录的蛋白调控机制，基因治疗以及早期诊断提供参考数据，方法用SELDI—TOF—MS检测食管癌及其相关人群的血清蛋白质谱指纹图，用Biomarkex Wizaid Software软件筛选出差异蛋白，选择具有标志性的差异蛋白质组建立人工神经网络诊断模型，使用SPSS分析其诊断效能。结果在食管癌患者血清中发现89个差异蛋白（P〈0．05）。其中有显著差异（P〈0.001）的蛋白质如下：在食管癌患者血清中表达增高的蛋白（5017．6Da，7458、5Da，7908，1Da，8111.9Da，8577，8Da）和表达降低的蛋白（4215.8Da，5890.9Da，7749.3Da）。利用筛选出8个有明显表达差并的蛋白质组建立食管癌人工神经网络筛查模型和诊断模型，其灵敏度达到93．2％和96.3％，特异度分别为95．6％和97．2％，经大样本盲法验证的灵敏度为75.4％和75.8％，特异度分别为84．8%和86．7％，经蛋白组数据库检索发现两种蛋白分别为血清淀粉样蛋白A和子宫球蛋白。结论血清蛋白质谱指纹图结合人工神经网络技术进行蛋白组学数据挖掘对食管癌的筛查和诊断以及探索其基因和蛋白调控机制具有重要的临床意义。
- 任兴军谭小林杨成虎王开正冯峰胡球英丁银环戴天阳
- 关键词：食管癌血清蛋白质组人工神经网络
- 原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究被引量：6
- 2011年
- 目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋白标志物并建立ANN诊断模型,验证集用于模型诊断效度的盲法验证。结果共发现7个有明显表达差异的标志蛋白。用其建立ANN诊断模型对原发性肝癌进行盲法验证,诊断的灵敏度和特异度分别为84.00%和81.25%,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.847,阴性预测值94.20%,阳性预测值58.33%,准确度为81.90%。结论原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,据其建立的人工神经网络模型可为原发性肝癌的诊断提供新方法,有重要的参考价值。
- 胡琼英王开正谭小林李小琼丁银环严莉
- 关键词：原发性肝癌表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白标志物受试者工作特征曲线
- 血清低相对分子质量差异蛋白质组在食管癌诊断和分期中的作用
- 2010年
- 目的:研究食管癌癌变过程中血清低相对分子质量蛋白的细微变化,探索食管癌发生的机制,寻找食管癌早期诊断的生物标志物和方法.方法:应用表面激光解析电离飞行时间质谱技术对食管癌患者血清和健康对照血清进行蛋白质谱指纹图谱检测,通过Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,使用人工神经网络软件建立食管癌早期诊断模型并用盲法验证其诊断效果;将食管癌早期和中晚期食管癌患者血清质谱图进行比对分析,寻找各期差异蛋白,并建立分期诊断模型.结果:发现食管癌和正常人差异蛋白5种,早期食管癌和中晚期食管癌差异蛋白3种.通过早期食管癌组和健康对照组建立早期诊断模型的灵敏度87.88%,特异度91.43%,准确度89.71%,经过盲法验证结果为灵敏度95.83%,特异度89.13%,准确度91.43%.早期食管癌和中晚期筛选的差异蛋白建立的分期诊断模型灵敏度75.76%,特异度79.17%,准确度77.19%.结论:表面增强激光解析离子化飞行时间质谱联合人工神经网络技术操作较为简便,在食管癌的诊断和分期上具有可行性.
- 任兴军谭小林杨成虎李小琼冯峰胡琼英丁银环戴天阳王开正
- 关键词：食管癌蛋白组学表面增强激光解析离子化飞行时间质谱
- SELDI-TOF-MS血清蛋白指纹分析诊断食管癌的系统评价被引量：1
- 2010年
- 目的系统评价表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测血清蛋白组对食管癌的诊断效率。方法通过计算机检索Pubmed、Higwire等数据库和手工检索相关期刊全面检索当前使用SEL-DI-TOF-MS诊断食管癌的文献,并使用QUADAS工具对纳入的文献进行质量评价,采用MetaDisc1.4软件进行Meta分析,综合评价灵敏度、特异度、似然比、诊断优势比和综合接受者工作特征(SROC)曲线下面积(AUC)、Q*指数等指标。结果共检索到11个文献研究符合纳入标准,累积样本含量1350例。Meta分析结果显示,综合灵敏度为90.00%、特异度84.11%、阳性似然比5.09、阴性似然比0.14、诊断优势比39.17。SROC曲线分析,AUC=0.9160,Q*=0.8488。结论 SELDI-TOF-MS检测血清蛋白组对诊断食管癌具有较高的临床应用价值。
- 谭小林任兴军王开正
- 关键词：食管癌蛋白组学
- 食管癌血清差异蛋白质组测定结果分析被引量：3
- 2011年
- 目的用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)寻找食管癌(EC)患者血清中差异蛋白质组,并建立诊断模型,为其广泛用于临床诊断积累数据资料。方法用SELDI芯片检测食管癌及其相关人群的血清,Biomarker Wiz-ard Software软件筛选出差异蛋白,选择具有显著差异的蛋白质组建立人工神经网络诊断模型,经盲法验证后使用SPSS软件分析各个差异蛋白以及联合人工神经网络技术后的诊断效率,并鉴定相关蛋白。结果筛选出显著差异(P<0.01)的蛋白质组如下:在食管癌患者血清中表达增高蛋白组[(5 017.6±4.89)、(7 458.5±6.49)、(7 908.1±7.80)、(8 111±8.45)、(8 577±7.80)kD],表达降低蛋白组[(7 748.3±9.10)、(5 890.9±7.32)、(4 213.8±5.93)kD]。差异蛋白质组建立食管癌人工神经网络筛查模型和诊断模型,其灵敏度和特异性超过90%,盲法验证的效果好;人工神经网络预测输出值构成的ROC曲线下面积分别为81.6%和82.1%,经查阅数据库鉴定发现两种蛋白质。结论血清蛋白质谱指纹图结合人工神经网络技术进行蛋白质组学数据挖掘所建模型诊断价值较大,与临床诊断符合程度良好。
- 谭小林任兴军王开正杨成虎冯峰胡琼英丁银环戴天阳
- 关键词：食管肿瘤质谱分析法蛋白质组学神经网络计算机
- 鳞癌与腺癌患者血清差异蛋白质组分析被引量：4
- 2011年
- 目的为鉴定鳞癌与腺癌的血清标志物和病理分型提供依据。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)对254份血清(鳞癌120份、腺癌82份,健康人52份)进行蛋白质谱指纹图分析,筛选鳞癌与腺癌的差异蛋白。结果 254份血清共筛选出83个差异表达的蛋白,其中5个差异表达最明显的蛋白质峰的质荷比(m/z)分别为2953、3285、6625、6646、9257。对5个峰强度分别进行F检验,P均<0.05。结论鳞癌、腺癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,为癌症的诊断和病理分型研究提供了新思路。
- 胡琼英彭瑛王开正郑旅芳丁银环谭小林李小琼严莉
- 关键词：鳞癌腺癌表面增强激光解吸电离飞行时间质谱蛋白标志物
