李小琼
- 作品数：6 被引量：15H指数：3
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- 血清蛋白指纹图与大肠癌预后诊断被引量：4
- 2010年
- 目的:研究从不同病程的大肠癌患者血清蛋白指纹图谱中筛选出的特征蛋白质组,以期对大肠癌患者进行预后判断以及帮助制定个体化的医疗措施.方法:用高通量高灵敏的表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测大肠癌组(45例)、术后预后良好组(术后无复发和无转移14例)、术后预后不良组(术后复发或转移13例)、肠道良性疾病组(24例)和健康人群组(155例)的血清蛋白指纹图谱,利用Biomarker Wizard软件进行差异蛋白质筛选,人工神经网络技术建立大肠癌的诊断模型和预后模型,并检验模型的诊断效率.结果:筛选出7个表达有明显差异的标志蛋白质(P<0.01),其相对分子质量为4955Da、5325Da、5890Da、6615Da、7739Da、8109Da、8575Da.利用这7个标志蛋白质建立人工神经网络大肠癌的诊断模型,再利用相对分子质量为4955Da、5325Da、5890Da、6615Da、7739Da的5个差异蛋白建立人工神经网络大肠癌的预后模型.其中诊断模型对大肠癌的诊断灵敏度和特异度分别为82.22%和80.45%,阴性预测值94.74%,阳性预测值51.39%,准确度为80.80%.预后模型对大肠癌术后复发或转移的诊断符合率为62.96%.结论:从SELDI-TOF-MS血清蛋白指纹图谱中找到了大肠癌不同病程时期的标志蛋白质组,并建立了大肠癌的分类树模型.
- 王专李小琼王开正邓明明徐亮
- 关键词：大肠癌人工神经网络预后判断蛋白组学
- 大肠癌血清差异蛋白质组诊断和预后模型的建立
- 目的:大肠癌/(Colorectal cancer/)是我国常见恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率在欧美及中国均居前列,且多年来居高不下。另外大肠癌也有年轻化的趋势,且症状隐匿,病情发展快,多数患者被诊断为大肠癌时已属中晚期...
- 李小琼
- 关键词：大肠癌SELDI-TOF-MS技术人工神经网络预后判断蛋白组学
- 文献传递
- 血清低分子量差异蛋白质组在食管癌诊断和分期中的作用研究
- 2011年
- 目的:研究食管癌癌变过程中血清低分子量蛋白的细微变化,探索食管癌发生的机制、寻找食管癌早期诊断的生物标志物和方法。方法:应用表面激光解析电离飞行时间质谱技术对食管癌患者和健康对照血清进行蛋白质谱指纹图谱检测,通过Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,使用人工神经网络软件建立食管癌早期诊断模型并用盲法验证其诊断效果;将食管癌早期和中晚期食管癌患者血清质谱图进行比对分析,寻找各期差异蛋白,并建立分期诊断模型。结果:发现食管癌和正常人差异蛋白5种,早期食管癌和中晚期食管癌差异蛋白3种。通过早期食管癌组和健康对照组建立早期诊断模型的灵敏度87.88%,特异度91.43%,准确度89.71%,经过盲法验证结果为灵敏度95.83%,特异度89.13%,准确度91.43%。建立的分期诊断模型中,早期食管癌和中晚期筛选的差异蛋白建立的分期诊断模型灵敏度75.76%,特异度79.17%,准确度77.19%。结论:表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)联合人工神经网络技术操作较为简便,在食管癌的诊断和分期上具有可行性。
- 任兴军谭小林杨成虎李小琼冯峰胡琼英丁银环戴天阳王开正
- 关键词：食管癌蛋白组学SELDI-TOF-MS
- 原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究被引量：6
- 2011年
- 目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋白标志物并建立ANN诊断模型,验证集用于模型诊断效度的盲法验证。结果共发现7个有明显表达差异的标志蛋白。用其建立ANN诊断模型对原发性肝癌进行盲法验证,诊断的灵敏度和特异度分别为84.00%和81.25%,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.847,阴性预测值94.20%,阳性预测值58.33%,准确度为81.90%。结论原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,据其建立的人工神经网络模型可为原发性肝癌的诊断提供新方法,有重要的参考价值。
- 胡琼英王开正谭小林李小琼丁银环严莉
- 关键词：原发性肝癌表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白标志物受试者工作特征曲线
- 鳞癌与腺癌患者血清差异蛋白质组分析被引量：4
- 2011年
- 目的为鉴定鳞癌与腺癌的血清标志物和病理分型提供依据。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)对254份血清(鳞癌120份、腺癌82份,健康人52份)进行蛋白质谱指纹图分析,筛选鳞癌与腺癌的差异蛋白。结果 254份血清共筛选出83个差异表达的蛋白,其中5个差异表达最明显的蛋白质峰的质荷比(m/z)分别为2953、3285、6625、6646、9257。对5个峰强度分别进行F检验,P均<0.05。结论鳞癌、腺癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,为癌症的诊断和病理分型研究提供了新思路。
- 胡琼英彭瑛王开正郑旅芳丁银环谭小林李小琼严莉
- 关键词：鳞癌腺癌表面增强激光解吸电离飞行时间质谱蛋白标志物
- 血清低相对分子质量差异蛋白质组在食管癌诊断和分期中的作用
- 2010年
- 目的:研究食管癌癌变过程中血清低相对分子质量蛋白的细微变化,探索食管癌发生的机制,寻找食管癌早期诊断的生物标志物和方法.方法:应用表面激光解析电离飞行时间质谱技术对食管癌患者血清和健康对照血清进行蛋白质谱指纹图谱检测,通过Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,使用人工神经网络软件建立食管癌早期诊断模型并用盲法验证其诊断效果;将食管癌早期和中晚期食管癌患者血清质谱图进行比对分析,寻找各期差异蛋白,并建立分期诊断模型.结果:发现食管癌和正常人差异蛋白5种,早期食管癌和中晚期食管癌差异蛋白3种.通过早期食管癌组和健康对照组建立早期诊断模型的灵敏度87.88%,特异度91.43%,准确度89.71%,经过盲法验证结果为灵敏度95.83%,特异度89.13%,准确度91.43%.早期食管癌和中晚期筛选的差异蛋白建立的分期诊断模型灵敏度75.76%,特异度79.17%,准确度77.19%.结论:表面增强激光解析离子化飞行时间质谱联合人工神经网络技术操作较为简便,在食管癌的诊断和分期上具有可行性.
- 任兴军谭小林杨成虎李小琼冯峰胡琼英丁银环戴天阳王开正
- 关键词：食管癌蛋白组学表面增强激光解析离子化飞行时间质谱
