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水稻瘤矮病毒S11-S12组分基因沉默抑制子的鉴定和功能分析: ＜正＞水稻瘤矮病毒（Rice gall dwarf virus,RGDV）为植物呼肠孤病毒属（Phytoreovirus）成员,此病毒最早于1979年在泰国发现,连续多年在广东、福建等地发生,使水稻分蘖数和抽穗率显著减少...; 沈文锦赵芹万婕邓永枢阮小蕾李华平; 文献传递

水稻瘤矮病毒S11-S12组分基因沉默抑制子的鉴定和功能分析: 水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)为植物呼肠孤病毒属(Phytoreovirus)成员,此病毒最早于1979年在泰国发现,连续多年在广东、福建等地发生,使水稻分蘖数和抽穗率显著减少,给水...; 沈文锦赵芹万婕邓永枢阮小蕾李华平; 关键词：水稻瘤矮病毒编码基因基因鉴定功能分析

菠萝杆状DNA病毒的全基因组序列测定及分析被引量：1: 2010年; 【目的】证明中国湛江地区菠萝上是否存在菠萝杆状DNA病毒(Pineapple bacilliform comosus virus,PBCoV),并获得PBCoV的基因组全序列,分析该病毒与其它Badnavirus病毒分离物间的分子差异。【方法】设计特异引物,通过反向PCR及分段克隆两种方法扩增PBCoV,克隆后测序获得PBCoV基因组全序列,利用不同生物学软件进行序列分析。【结果】PBCoV基因组为环状结构,全长7543bp;含有3个典型的ORFs,推测其编码蛋白的分子量分别为20.4、14.0和217.6kD。其基因组与GenBank登录的PBCoV ORF3部分核苷酸序列同源性87%-97%,其ORF3编码的氨基酸序列与已报道的Badnavirus病毒ORF3氨基酸序列间一致率小于50.8%。Southern blot分析显示该病毒基因组能整合到植物基因组中。【结论】在中国湛江地区菠萝上存在PBCoV,该病毒属于Badnavirus属病毒,与香蕉线条病毒(Banana streak virus)Mys分离物(BSV-Mys)亲缘关系最近。这是PBCoV基因组全序列的首次报道。; 吴丽婷阮小蕾沈文锦谭小勇翟国会李华平; 关键词：菠萝全序列

水稻瘤矮病毒S11编码蛋白的寄主互作因子鉴定: 病毒病害的致病机理是生物学研究的一个重点,同时也是生产防治的首要根据水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)作为中国及东南亚国家水稻上的一个要病原,给水稻生产带来了严重的经济损失。我们发现水稻...; 沈文锦赵芹阮小蕾李华平

水稻瘤矮病毒Pnsll蛋白功能和P6蛋白寄主互作因子鉴定: 水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus，RGDV)是中国、日本、朝鲜以及其他东南亚国家水稻上的一种重要病毒。RGDV属于呼肠孤病毒科(Reoviridae)，植物呼肠孤病毒属(Phytoreovirus...; 沈文锦; 关键词：水稻 RNA沉默抑制子

水稻瘤矮病毒Pns11蛋白的寄主互作因子鉴定: 由水稻瘤矮病毒(Rice Gall Dwarf Virus,RGDV)引起的水稻瘤矮病是东亚和东南亚稻区具经济重要性的病毒病之一,给水稻生产造成严重损失.RGDV病毒含有12个基因组分,其中的S11组分编码的Pns11蛋...; 沈文锦阮小蕾白亭亭李信申李华平; 关键词：水稻瘤矮病毒水稻

湛江地区侵染菠萝的病毒检测及鉴定: 本文根据已报道的不同菠萝病毒的基因保守区设计各种病毒的简并和特异引物，采用RT-PCR和PCR技术，简并引物与特异引物相结合，对来自湛江的22个菠萝样品进行检测并对扩增阳性的片段进行基因克隆和核苷酸序列分析，确定了病毒种...; 吴丽亭沈文锦阮小蕾李华平; 关键词：菠萝病毒检测分子鉴定基因克隆核苷酸序列

水稻瘤矮病毒S11基因沉默抑制子的原核表达及抗血清制备被引量：3: 2010年; 以采自广东省水稻瘤矮病的典型病株为材料,通过RT-PCR法扩增和克隆了水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)S11组分核苷酸序列全长。序列分析结果表明,RGDV广东分离物S11(登录号EF532326)核苷酸序列全长1168bp,含有一个1068bp的开放阅读框,编码一条355个氨基酸的多肽,推测分子量约40kD,与泰国分离物基因结构基本一致,其核苷酸与氨基酸序列相似性分别为94.3%和98.8%。将广东分离物S11基因克隆至pBV221温敏表达载体上,在大肠杆菌DH5α中实现了高效表达。以诱导蛋白为抗原免疫家兔获得了抗血清。利用ELISA法测定抗血清的效价为1∶4096,Western blot分析结果表明,抗血清能与S11蛋白发生特异血清学反应。这可为进一步研究S11蛋白的结构和功能,揭示其抑制基因沉默的作用机制提供参考。; 赵芹沈文锦张翼翔刘福秀李华平; 关键词：水稻瘤矮病毒原核表达抗血清制备

香蕉线条病毒ORF I基因的原核表达及抗体制备被引量：1: 2009年; 利用PCR方法从含香蕉线条病毒广东分离物(BSV-GD)部分基因组的质粒中扩增该病毒的ORF I基因,将其克隆到pET-28b(+)原核表达载体中进行了融合表达.SDS-PAGE电泳发现,目的融合蛋白与预期大小一致,相对分子质量约为23 000,表达产物主要以不可溶的包涵体形式存在,将其变性溶解后利用N端的组氨酸标签进行纯化.以纯化产物为抗原免疫兔子制备了香蕉线条病毒的阳性兔抗血清,Western blot和ELISA分析表明,制备的兔抗血清为香蕉线条病毒的高效特异性抗血清,效价高达1∶51 200.; 何云蔚陈秀阮小蕾沈文锦刘福秀李华平; 关键词：香蕉线条病毒 ORF I 原核表达抗血清

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沈文锦