李金金
- 作品数:4 被引量:26H指数:3
- 供职机构:中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划全球变化研究国家重大科学研究计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 异育银鲫消化道微生物群落对恢复投喂的响应被引量:6
- 2014年
- 以实验室养殖的异育银鲫(Carassius auratus gibelio)"中科3号"成鱼为对象,利用PCR-DGGE技术比较研究了其经饥饿与恢复投喂后消化道微生物多样性的变化。实验共检测到23条谱带,其中饥饿组、投喂组谱带数分别为18条和17条(共有谱带12条),投喂组大部分谱带亮度高于饥饿组。基于PCR-DGGE所得到的谱带进行的CA(Correspondence Analysis)分析和聚类都表明饥饿组与投喂组消化道微生物存在明显不同。结果表明,在充分饥饿处理后,恢复饲料投喂可导致消化道微生物种类减少及微生物平均密度的增加,同时对消化道微生态系统内微生物种类组成有显著影响。研究为进一步阐述消化道微生物功能基因奠定了基础,也为水产鱼类肠道菌群研究提供一些基础数据。
- 李星浩颜庆云胡红娟李金金王纯余育和
- 关键词:异育银鲫PCR-DGGE肠道微生态系统
- 8种不同食性鱼类消化道微生物群落结构比较研究
- 李金金倪加加王纯李家林李星浩吴姝张堂林余育和颜庆云
- 关键词:消化道微生物高通量测序微生物多样性鱼类
- 草鱼与团头鲂肠道菌群结构比较分析被引量:18
- 2014年
- 选取湖泊养殖的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)和团头鲂(Megalobrama amblycephala)为研究对象,通过对其消化道细菌群落16S rDNA进行细菌群落聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析,比较了其消化道微生物群落结构。在两种草食性鱼类消化道中分别检测到不同的谱带,其中草鱼的平均谱带数为(33.3±2.8)条,团头鲂的平均谱带数为(38.0±2.5)条。基于所得PCR-DGGE指纹图谱谱带丰度值数据的UPGMA聚类分析和PCA排序均显示草鱼消化道微生物群落并没有与团头鲂消化道微生物群落分开;相比于草鱼和团头鲂消化道微生物群落之间的差异,草鱼和团头鲂个体间差异更加明显,而且草鱼消化道微生物群落的个体分化更为明显。对特定条带的切胶回收测序结果显示,草鱼和团头鲂消化道内检测到的菌群都主要来自γ-变形菌门、梭杆菌门和厚壁菌门,另外草鱼消化道中还检出少量拟杆菌门细菌。以上结果表明同一生境中食性相同的野生草鱼与团头鲂消化道微生物群落组成不存在显著差异,条带回收测序检测到相似的微生物种类。研究结果补充了人们在食性对消化道微生物群落结构影响方面的认识,同时也暗示草鱼和团头鲂消化道内微生物群落对营养物质的代谢方式类似,这为深入研究草食性鱼类消化道微生物菌群参与营养物质代谢积累了资料。
- 王纯倪加加颜庆云李金金李星浩余育和
- 关键词:草鱼团头鲂PCR-DGGE
- 南方大口鲇消化道细菌群落结构与其胃肠分化的关系被引量:4
- 2013年
- 以肉食性南方大口鲇(Silurus soldatovi meridonalis Chen)为对象,研究采用PCR-DGGE指纹技术对其仔稚鱼胃肠道分化过程及细菌群落结构进行了对比分析,进而探讨了细菌群落与胃肠道分化的关系。消化道外部形态和胃肠切片显示13日龄样品起,胃肠在结构上出现较大的分化。DGGE分析结果显示胃肠道细菌群落的分化始于18日龄:从18日龄样品起,肠内细菌群落明显开始分化,但在随后的18—33日龄期间细菌群落结构相对稳定,而胃内细菌群落则一直处于动态变化中。这说明,南方大口鲇仔稚鱼的个体发育过程中,随着胃肠在组织结构上的分化,其消化道细菌群落结构也出现了明显分化,并且胃和肠内细菌群落结构的分化在时间上存在差异。该研究结果将为深入研究胃和肠内细菌群落的功能差异提供基础资料。
- 李金金倪加加李学梅颜庆云余育和
- 关键词:细菌群落结构PCR-DGGE南方大口鲇