戚继
- 作品数：5 被引量：19H指数：3
- 供职机构：中国科学院理论物理研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 组分距离方法构建基于核糖体蛋白质或氨酰tRNA合成酶的原核生物亲缘树被引量：5
- 2004年
- 最近新发展的基于计算短串频度,推断原核生物系统发生关系的K串组分距离方法,以整个蛋白质组作为数据集.采用每个物种的全部核糖体蛋白质或氨酰tRNA合成酶,得到一致结果.已知后一组蛋白质在单个使用时,产生彼此不同的进化树.我们构建进化树不需做任何序列联配,所得亲缘树包括16个古细菌、105个细菌和2个真核生物.大部分低层分支与《伯杰系统细菌学手册》(第2版),即2003年第4次发布的细菌系统分类大纲相一致,而且对高层分支关系给出一些建议.
- 卫海滨戚继郝柏林
- 关键词：古细菌系统发生树核糖体蛋白质氨酰TRNA合成酶
- 原核生物系统发生学与分类学的一致性:组份矢量树与原核生物分类系统的详尽比较被引量：3
- 2007年
- 截至2006年12月31日,NCBI共有432个原核生物的全基因组可供下载.基于这些数据,我们用组份矢量方法构建了原核生物的进化树.最新的《伯杰系统细菌学手册》的在线大纲体现了细菌学家的分类系统.我们对两者从各个分类单元、各个分支进行了详尽的比较.组份矢量方法所得到的亲缘树和伯杰分类系统在整体结构和绝大多数的细微分支上都相当一致.同时,两者的多数不同之处也已经在一定程度上为生物学家所知,从而为原核生物分类系统的修正提供了一定的启示.本文重点阐述两者之间分岐之处的生物学含义,而不再对居主导地位的相同之处做详细叙述.
- 高雷戚继孙健冬郝柏林
- 关键词：RRNA
- 冠状病毒和人类SARS病毒的分子亲缘关系研究被引量：9
- 2003年
- 组分矢量方法是一种从全基因组出发,研究物种亲缘关系的新方法。本文使用这一方法,通过对外类群的适当选取,研究包括SARS病毒的冠状病毒进化关系。SARS病毒作为一个单系,由于彼此之间的序列相似程度非常高,难以为其选取适当的外类群。我们利用核苷酸的突变计数来构造距离矩阵,并将其超度规化,在此基础上揭示SARS病毒自身的演变关系。本文采用了更多的序列和新的方法,反映了更为详细的冠状病毒进化关系,使得不同方法的比较成为可能,为冠状病毒进化关系的研究提供了新的视角。
- 高雷戚继戚继孙奕钢郝柏林
- 关键词：冠状病毒SARS病毒严重急性呼吸综合征分子进化
- 生物信息学与重复序列分析被引量：3
- 2002年
- 介绍了生物信息学的含义、主要内容和研究方法 ;阐明研究重复序列的重要意义 。
- 韦芳萍陈光旨戚继
- 关键词：生物信息学基因数据库
- 基于全蛋白质组的系统发生学：组分矢量方法
- 我们提出了一个用以推断生物系统发生关系的新方法——组分矢量方法.它以物种的全蛋白质组作为数据集,通过比较物种间的氨基酸短串频度差异来构建亲缘树.该方法避开了序列联配在全基因组应用中所遇到的困难和基因选择的主观性,而且仅有...
- 戚继
- 关键词：亲缘关系生命之树原核生物叶绿体
- 文献传递
