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成婧
作品数:
2
被引量:23
H指数:2
供职机构:
江苏大学基础医学与医学技术学院
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发文基金:
江苏省自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
张驰宇
江苏大学基础医学与医学技术学院
曹威
江苏大学基础医学与医学技术学院
李全双
江苏大学基础医学与医学技术学院
孙金燕
江苏大学基础医学与医学技术学院
俞倩
江苏大学基础医学与医学技术学院
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江苏大学学报...
年份
2篇
2006
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荧光实时定量PCR的研究进展
被引量:21
2006年
张驰宇
成婧
李全双
曹威
孙金燕
关键词:
荧光实时定量PCR
RNAstructure软件不同版本对FORS-D分析的影响
被引量:2
2006年
目的:研究RNAstructure两个不同版本(4.2和3.6版)对FORS-D分析的影响。方法:以H IV-1 CRF01_AE基因组为对象,将其分隔成连续的含200碱基的片段,两个连续片段之间互相重叠150碱基。用序列打乱程序将每个片段打乱成10个碱基组成相同的随机片段。用RNAstructure软件分别计算每个片段核酸二级结构的最小自由能。结果:两个不同版本RNAstructure软件获得的FONS、FORS-M和FORS-D值在基因组上具有完全一致的分布。用Z检验分别比较两组数据的平均值,发现4.2版获得的FONS(P<0.05)和FORS-M(P<0.01)值明显低于3.6版,而对FORS-D(Z=0.127 1,P>0.05)值没有明显影响。另外,发现GC含量不是两个版本软件造成FONS(P=0.29)和FORS-M(P=0.40)差异的主要因素。结论:使用不同版本的RNAstructure不会影响FORS-D值,但因4.2版可以产生更稳定的二级结构,并具有更高的预测准确性,使用RNAstructure 4.2版进行FORS-D分析将是更好的选择。
张驰宇
李全双
曹威
成婧
俞倩
孙金燕
魏继福
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