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俞倩

作品数：1 被引量：2H指数：1
供职机构：江苏大学基础医学与医学技术学院更多>>
发文基金：江苏省自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇RNA

机构

  • 1篇江苏大学
  • 1篇江苏省人民医...

作者

  • 1篇孙金燕
  • 1篇李全双
  • 1篇魏继福
  • 1篇曹威
  • 1篇成婧
  • 1篇张驰宇
  • 1篇俞倩

传媒

  • 1篇江苏大学学报...

年份

  • 1篇2006
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
RNAstructure软件不同版本对FORS-D分析的影响被引量：2
2006年
目的:研究RNAstructure两个不同版本(4.2和3.6版)对FORS-D分析的影响。方法:以H IV-1 CRF01_AE基因组为对象,将其分隔成连续的含200碱基的片段,两个连续片段之间互相重叠150碱基。用序列打乱程序将每个片段打乱成10个碱基组成相同的随机片段。用RNAstructure软件分别计算每个片段核酸二级结构的最小自由能。结果:两个不同版本RNAstructure软件获得的FONS、FORS-M和FORS-D值在基因组上具有完全一致的分布。用Z检验分别比较两组数据的平均值,发现4.2版获得的FONS(P<0.05)和FORS-M(P<0.01)值明显低于3.6版,而对FORS-D(Z=0.127 1,P>0.05)值没有明显影响。另外,发现GC含量不是两个版本软件造成FONS(P=0.29)和FORS-M(P=0.40)差异的主要因素。结论:使用不同版本的RNAstructure不会影响FORS-D值,但因4.2版可以产生更稳定的二级结构,并具有更高的预测准确性,使用RNAstructure 4.2版进行FORS-D分析将是更好的选择。
张驰宇李全双曹威成婧俞倩孙金燕魏继福
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共1页<1>
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