包改丽
- 作品数：8 被引量：27H指数：3
- 供职机构：云南农业大学植物保护学院农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：高层次科技人才培引工程公益性行业(农业)科研专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学经济管理更多>>
- 同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法
- 本发明涉及一种同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法，属植物保护领域。通过分别设计合成SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2特异性的正向引物和四种病毒的通用反向引物，CTAB法提取病组织总核酸，采用一步...
- 李凡陈海如许东林王海宁左瑞娟谭冠林包改丽
- 文献传递
- 三七Y病毒部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析被引量：2
- 2016年
- 对云南文山地区三七上获得的三七Y病毒（Panax virus Y,PnVY）不同分离物进行了部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析,获得的部分ci基因长657 nt,编码219个氨基酸;获得的部分cp基因长834 nt,编码278个氨基酸。所获得的11个PnVY分离物的ci基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为80.8%～99.8%和91.3%～100%,与其他PnVY分离物的同源性分别为80.8%～98.8%和92.7%～99.5%。所获得的18个PnVY分离物的cp基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为91.8%～99.9%和93.9%～100%,与其他PnVY分离物的同源性分别为92.0%～100%和95.7%～100%。系统进化树分析表明,基于ci基因可以将PnVY分为2个大组,第Ⅱ组分离物之间的差异相比第Ⅰ组的复杂;基于cp基因可以将PnVY分为3个大组,第Ⅲ组分离物之间差异最大。基于ci基因和cp基因的分析结果均表明,PnVY不同种群间存在较为丰富的遗传多样性,但尚不清楚PnVY的分子变异是否与PnVY引起的多种症状类型有关。
- 李梅蓉李晓静包改丽朱静杨馨谭冠林兰平秀李凡
- 关键词：CP基因分子变异
- 三七病毒病病原的初步鉴定
- 三七(Panax notoginseng (Burk)F.H.Chen)具有较高的药用价值，是许多名贵中成药的主要成分.由于其特殊的生长习性，主要集中在云南文山州境内种植.近年来，随着三七的规模化种植，病毒病大面积发生，...
- 包改丽朱静王海宁谭冠林陈海如李凡
- 关键词：病毒病病原鉴定
- 同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法
- 本发明涉及一种同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法，属植物保护领域。通过分别设计合成SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2特异性的正向引物和四种病毒的通用反向引物，CTAB法提取病组织总核酸，采用一步...
- 李凡陈海如许东林王海宁左瑞娟谭冠林包改丽
- 云南甘薯病毒的检测及主要病毒的多样性分析被引量：15
- 2013年
- 【目的】明确云南甘薯病毒的种类,并对主要病毒进行遗传多样性分析。【方法】利用PCR/RT-PCR技术,对采自云南16个县、市的279个甘薯样品进行扩增、测序,对所得序列应用分子生物学软件MEGA 5进行系统发育分析。【结果】除普洱和祥云的样品中未检测到任何病毒外,其余14个县、市的123个甘薯样品中共检测到甘薯褪绿斑病毒(SPCFV)、甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)、甘薯卷叶病毒(SPLCV)、甘薯C病毒(SPVC)、甘薯G病毒(SPVG)和甘薯病毒2号(SPV2)等6种病毒。其中SPVG的检出率最高,达39.1%,为云南甘薯病毒的优势种,SPFMV和SPVC的检出率分别为26.9%和24.7%,而SPLCV检出率最低,仅为0.4%。在所检测的样品中未发现甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)和甘薯轻斑驳病毒(SPMMV)。云南甘薯病毒多数为2?5种病毒复合侵染,占总样品数的31.9%,其中2?3种病毒复合侵染现象最为常见,单一病毒侵染占总样品数的12.2%。检出率比较低的SPCFV、SPLCV和SPV2未发现单独侵染现象。【结论】云南甘薯上发生的SPFMV分离物存在EA株系和O株系,未发现RC株系,另有两个分离物同EA、O、RC之间的亲缘关系均较远,有可能是一个新的株系;SPVC和SPVG分离物均可分为3个不同的组,大部分SPVG云南分离物属于Ⅰ组。
- 包改丽左瑞娟饶维力LI Ru-Hui李凡
- 关键词：甘薯病毒病病原检测复合侵染
- 云南番木瓜环斑病毒部分ci基因的克隆及序列分析
- 2013年
- 对云南昆明、楚雄、保山、德宏、临沧、玉溪、红河等地番木瓜、南瓜和罗汉果上获得的番木瓜环斑病毒（Papayaringspotvirus，PRSV）不同分离物进行了部分ci基因的克隆和序列分析，获得的部分ci基因长666nt，编码221个氨基酸。关于13个PRSV云南分离物部分ci基因核苷酸序列的同源性为80％。98％，氨基酸同源性为92％-100％。选取本文具有代表性的9个PRSV分离物与国内外12个PRSV分离物相比，核苷酸序列的同源性为79％-93％，氨基酸序列同源性为92％-99％。运用MEGA软件绘制的基于部分ci基因核苷酸序列的系统进化树表明，这些PRSV病毒可以分为两个大组，本文获得的9个云南分离物中的8个分离物与印度分离物（India—W—EU475877）聚为第1组，第Ⅱ组成员比较复杂，包括大部分的亚洲分离物及全部美洲分离物。
- 朱静谭冠林李晓静刘芳包改丽李凡
- 关键词：番木瓜环斑病毒克隆
- 云南番木瓜环斑病毒的发生及遗传多样性被引量：5
- 2014年
- 【目的】明确云南省番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)发生情况,并对其进行遗传多样性分析。【方法】利用RT-PCR技术,于2011-2012年对采自云南省昆明市、楚雄州、保山市、德宏州、西双版纳州、临沧市、玉溪市、红河州、文山州等地的24个番木瓜、南瓜和罗汉果疑似病样进行扩增、测序,对样品中获得的940 bp PRSV部分cp基因及3′端非编码区的序列应用分子生物学软件MEGA 5进行系统发育分析。【结果】从17个样品中检测到了PRSV,检出率为70.8%,表明该病毒在云南的发生较为普遍。云南PRSV不同分离物间的核苷酸序列变异较大,与其他已报道的PRSV分离物之间的基因组3′端核苷酸序列一致性为81.7%-100%。基于PRSV的CP部分氨基酸序列及基因组3′端核苷酸的系统进化分析结果表明,来自亚洲、北美洲、南美洲和大洋洲的PRSV分离物可以分为2个组,其中第Ⅰ组均为来自中国的分离物,包括了大部分的PRSV云南分离物,第Ⅰ组内分离物间的差异较第Ⅱ组大;第Ⅱ组的分离物来源较为复杂,亚洲、北美洲、南美洲和大洋洲均有分布。基于PRSV CP部分氨基酸序列构建的系统进化树中,各分离物之间没有明显的地理和寄主相关性,而基于PRSV基因组3′端核苷酸序列构建的系统进化树中,除中国大陆分离物和印度分离物外,其他地区的PRSV在进化上与其地理来源有明显的相关性。【结论】PRSV在云南的昆明市、楚雄州、保山市、德宏州、西双版纳州、临沧市、玉溪市、红河州和文山州等地都有不同程度发生,且为害寄主植物涉及番木瓜、南瓜及罗汉果,PRSV侵染罗汉果为云南首次发现。云南PRSV分离物的分子变异很大,但是关于PRSV的分子变异是否与其地理分布及症状表现有关,以及P型和W型的分子区分特征还有待进一步研究。
- 朱静谭冠林包改丽刘芳李晓静吴祖建李凡
- 关键词：番木瓜环斑病毒CP基因分子变异
- 云南柑橘黄龙病病原检测及其16S rDNA序列分析被引量：6
- 2011年
- 利用柑橘黄龙病菌的特异引物,对采自云南红河州建水县和个旧市、玉溪市华宁县、大理州宾川县、昭通市盐津县、德宏州瑞丽市以及保山市隆阳区等地共151个疑似柑橘黄龙病样品进行了黄龙病菌的检测,其中建水县有5个样品检测结果为阳性,检出率为33.3%;个旧市、华宁县和宾川县各有1个样品为阳性,检出率分别为8.3%,5.5%,6.7%;而昭通、德宏和保山的样品均为阴性。表明黄龙病在云南的主要柑橘产区建水、个旧、华宁和宾川均有不同程度的发生,其中建水县发生率较高,生产上应尽快引起重视。对所获得的黄龙病菌16S rDNA进行了克隆和序列测定,发现8个云南柑橘黄龙病菌16S rDNA的序列一致性均为100%,与柑橘黄龙病菌亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus)相应序列的一致性为98.7%～100%,与柑橘黄龙病菌非洲种(Candidatus Liberibacter africanus)的一致性为97.5%～98.7%,而与柑橘黄龙病菌美洲种(Candidatus Liberibacter americanus)的一致性均为96.5%。表明云南主要柑橘产区发生的黄龙病菌均属于柑橘黄龙病菌亚洲种。
- 董鹏包改丽冉志伟陈海如李凡
- 关键词：柑橘黄龙病病原检测RDNA基因克隆
