刘昌文
- 作品数：5 被引量：4H指数：1
- 供职机构：广州医学院第二附属医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的对比评价被引量：3
- 2010年
- 比较不同MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的优缺点,为后续应用提供依据。在众多HLA-Ⅱ类抗原表位中,选取HLA-DR的6个表位(DRB1*0101,0301,0401,0701,1101和1501)为代表,选取MHCBN数据库中的309条已知抗原表位的肽链为待测肽链。使用近年来常用的7个表位预测软件,根据不同软件的临界值确定入选结果数据,比较各软件所得结果与已有的实验结果之间的差距以确定其优劣。综合7个软件预测结果进行评价,得出NetMHCⅡ和NetMHCⅡpan所得结果准确率最高。可以用NetMHCⅡpan及NetMHCⅡ进行MHC-Ⅱ类分子抗原表位预测。不同软件HLA的各个亚型的预测所得指标不一致,提示综合运用不同软件对多肽表位进行预测十分必要。
- 李胜涛刘昌文邹泽红陶爱林
- 关键词：表位预测
- 甲型H1N1病毒HA、NA氨基酸序列比较及抗原性表位预测被引量：1
- 2013年
- 目的:比较新型甲型H1N1流感病毒分离株HA、NA氨基酸序列之间的差异,分析HA、NA蛋白可能的抗原性细胞表位。方法:从GenBank中选取28株世界各地的新型甲型H1N1流感病毒分离株并下载各株HA、NA的氨基酸序列;使用ClustalX和MEGA2.0软件对氨基酸序列的进行进化树分析;用Protean软件预测HA、NA蛋白的B细胞表位;用NetMHCⅡ2.2预测T细胞抗原表位。结果:世界范围的毒株之间氨基酸序列相对保守,HA及NA均只有少数位点的变异,HA蛋白氨基酸序列之间较NA蛋白氨基酸序列之间变异较大;预测HA蛋白具有8个B细胞表位和10个T细胞表位;NA蛋白有12个B细胞表位和7个T细胞表位。结论:HA、NA蛋白的少数区域抗原性相对比较稳定,可以作为检测以及疫苗研究的靶区域。
- 邹泽红张俊艳刘兆宇刘昌文李胜涛何颖
- 关键词：H1N1流感病毒血凝素神经氨酸酶
- 甲型H1N1病毒HA、NA氨基酸序列比较及B细胞抗原表位预测
- 目的:比较新型甲型H1N1流感病毒分离株HA、NA氨基酸序列之间的差异,分析HA、NA蛋白可能的B细胞表位。方法:从GenBank中选取28株世界各地的新型甲型H1N1流感病毒分离株并下载各株HA、NA的氨基酸
- 刘昌文李胜涛邹泽红陶爱林
- 文献传递
- MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的对比评价
- 目的比较不同MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的优缺点,为后续应用提供依据。方法在众多HLA-Ⅱ类抗原表位中,选取HLA-DR的6个表位(DRB1*0101,0301,0401,0701,1 101
- 李胜涛刘昌文邹泽红陶爱林
- 文献传递
- 一种低过敏原性重组免疫毒素及其制备方法和应用
- 本发明公开了新的重组免疫毒素。该免疫毒素是由靶向分子和毒素分子构成。在此基础上分析了免疫毒素的抗原性位点，并通过突变等方法获得抗原性降低的免疫毒素。其既保留了特异性导致特定细胞凋亡或抑制其生长的能力，同时具有更低的过敏原...
- 陶爱林邹泽红刘昌文
- 文献传递
