王志鹏
- 作品数：40 被引量：88H指数：9
- 供职机构：清华大学理学院化学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学文化科学生物学化学工程更多>>
- 生命体系中金属元素的作用机理与选择原理被引量：19
- 2016年
- 自然界采用基于碳氢的非金属元素体系构建了生命体系。而从元素种类上看,地球上存在的元素绝大多数都属于金属元素,但是这些金属元素只有极少数被用于生命体系,且总体含量极低。更值得思索的是,生物体内不存在的金属元素常常对其有各种不利的生理效应。本文尝试分析讨论其中的几个问题和与之对应的原因,并归纳自然界选择利用某种特定金属元素的要求与逻辑。同时,对于常见的各种金属元素在生物体内的作用机制提供一些分析与理解。以期对生物无机化学与生物有机化学教学与相关科研有助。
- 王志鹏邱天袁金颖
- 关键词：金属元素离子势生物进化
- 生物大分子相对分子质量估算法
- 2020年
- 生物大分子相对分子质量的计算在科学定量分析中非常重要,但并非所有情况都可进行精确的计算,而需要基于聚合物大小进行估算。通过回归生物大分子之高分子本质,系统性地分析以单体平均相对分子质量出发进行估算的方法。以蛋白质和单双链脱氧核糖核酸(DNA)及核糖核酸(RNA)为例进行分析,旨在探讨和比较基于单体的相对分子质量估计法对不同的生物大分子的可能最大误差。同时指出一个关于双链DNA常被忽略的知识。
- 王志鹏王志鹏车子良马新雨汪璐姜汉杰王鹏王鹏
- 关键词：生物大分子相对分子质量碱基脱氧核糖核酸
- 金属酶中双氧活化的模型研究及应用被引量：2
- 2013年
- 金属酶活化双氧的过程对生物体内新陈代谢、信号转导等一系列功能至关重要。生物体内实现双氧活化功能的金属酶主要有血红素酶和非血红素酶两类。对模型化合物催化双氧活化过程中间体的表征及催化反应产物的分析可以揭示金属酶的双氧活化机理;对模型化合物的反应活性与配体电子效应的研究将为配合物催化剂的配体设计提供指导。特别是血红素酶和非血红素酶可以实现对C—H键的选择性活化,这是化学反应的难题之一。因此这些模型化合物可以被用做催化剂来解决药物发现、工业生产以及能源转化中的难题。本文介绍了血红素酶和单核非血红素酶模型化合物在机理研究上的近期进展,分析了卟啉类似物、二组氨酸一羧酸面式结构酶模型化合物等模型的设计思想和高价金属氧合中间体的电子结构,总结了配体电子效应和模型化合物催化活性之间的关系。最后,提出了目前模型化合物在双氧活化研究中存在的一些不足,并对其在基础研究及应用方面的发展进行了展望。
- 王志鹏张艳王晓青
- 过渡态理论于磺胺药物抑菌机理刍议被引量：12
- 2013年
- 依据酶过渡态理论,通过量子化学计算实验对磺胺类药物抑菌机制进行了尝试性的探讨.发现对氨基苯磺酰胺与二氢蝶酸反应的过渡态确实相似于对氨基苯甲酸与二氢蝶酸反应的过渡态结构,从而可以竞争性抑制二氢蝶酸合成酶的催化作用.计算结果能够更深刻地解释对氨基苯磺酰胺N原子上进行取代的必要性和磺酰胺结构片段的构效关系.另外,本文猜想磺胺类药物产生杀菌作用更重要的原因可能是其本身代谢产物对催化下游反应的叶酰聚谷氨酸合成酶的直接抑制作用.
- 王志鹏冯天师崔丽嘉石玉洁沙耀武
- 关键词：磺胺类药物抑菌作用
- 将医学知识引入基础化学教学之探索:以牙科为例被引量：3
- 2021年
- 医学向来是化学和生命科学密不可分的兄弟学科和下游学科,很多化学原理在医学中得以体现。同时,众多化学发现、物质和技术也被应用于医学发展。对于生理学与医学相关问题的认知和讨论具有加深学生对对应基础化学理论认识的作用,从客观理性和直观感性上促进其对化学理论联系实践的感知。以牙科医学为例,探索将医学知识与基础化学教学相结合,系统讨论其中涉及的若干无机化学、有机化学和高分子化学问题,希为相关学科的教学提高素材与借鉴。
- 王志鹏王志鹏蒋振雄汪璐马新雨尹晟王鹏王鹏张军
- 关键词：牙科化学专业本科教育
- 浅析对血红素氧合过程认识的几个争议被引量：4
- 2014年
- 血红蛋白是高等动物体内广泛存在的一种载氧蛋白,其活性中心是血红素,氧分子可与血红素中的铁可逆结合实现载氧。虽然人们对血红蛋白运载氧气的生物化学作用机制已有系统的认识,但由于研究方法的限制与分析数据的差异和分歧,对于血红素中心铁离子与氧分子配位的键合结构及相关性质变化仍存在诸多争议。本文就目前教学中存在的部分争议进行梳理总结,同时结合相关研究进展,对几种血红素氧合过程的结构模型进行合理性分析。
- 王志鹏张艳王晓青
- 关键词：血红素
- 羧基活化转化的机理及其在化学与生物体系中的应用被引量：4
- 2015年
- 羧基活化转化反应是有机化学的重要问题之一,同时在生物体系中也广泛存在,研究其机理具有广泛的意义.本文结合相关物理有机化学和生物化学原理,用势能面图从动力学和热力学2方面对该过程的过渡态和中间体进行分析讨论,同时考查了缩合过程使用催化剂与否对该过程的影响,提出各种羧基活化转化反应机理的一般规律.结合这一原理对比了化学活化与生物活化的异同,并对其在不同体系中的应用进行了评述,以期对发展新型羧基活化方式与物理有机化学教学提供有意义的参考.
- 王志鹏邓耿席婵娟
- 关键词：催化剂多肽合成
- 酶促反应中的化学平衡改变被引量：13
- 2015年
- 一般教科书中认为酶促反应不能改变其本身化学平衡的方向和限度。但酶学研究表明:酶促反应中的化学平衡可以从热力学或动力学角度发生改变,相关酶促反应的内部化学平衡理论和天然产物酶促选择性合成实例业已广泛报道,在教学与科研中应予重视,这对深入认识酶催化的本质、指导药物化学等研究具有重要意义。
- 王志鹏邓耿
- 关键词：酶促反应化学平衡
- 蛋白质中新型赖氨酸翻译后修饰的结构简介被引量：7
- 2017年
- 近年来各种新型蛋白质赖氨酸翻译后修饰被逐渐发现。这些翻译后修饰在蛋白质组中广泛存在,具有高度的结构多样性,并对染色体结构和基因表达具有重要的表观遗传调控作用。本文将从化学的角度对这些新型赖氨酸翻译后修饰的发现与结构特点进行简述,以期对教学与科研有帮助。
- 王志鹏王志鹏梁妍钰马新雨
- 关键词：赖氨酸翻译后修饰蛋白质组
- 从人造碱基重议天然碱基结构、性质与功能被引量：4
- 2017年
- 自然界中,碱基的互补配对对DNA双螺旋的结构稳定与功能实现有重要作用,也是高校相关生物化学、分子生物学、化学生物学、生物有机化学等课程教学的重要内容。近年来随着人造碱基的逐渐发展,合成生物学极大地拓宽了碱基结构与互补配对的模式,同时也反映出教学中对于天然碱基互补配对的一些不当或不完善的认识。本文从最近的人造碱基配对入手,分析其设计本质和应用特性,并借此重新认识天然碱基配对的结构与性质,探讨传统教学中不当的论点,以期对教学与科研有助。
- 王志鹏王志鹏马新雨张军
- 关键词：核酸核苷酸氢键生物化学
