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miRNA介导的病毒-人相互作用研究进展被引量：3: 2010年; 微小RNA(microRNA,miRNA)是一类内源性,长度约为22核苷酸的单链RNA分子,可通过5′端的种子区与靶标转录本mRNA的3′UTR配对,导致靶mRNA的降解或翻译抑制。越来越多的研究发现,miRNA在介导病毒-人相互作用过程中发挥着重要的作用,作用模式包括病毒miRNA靶向人及自身的转录本、人miRNA靶向病毒及自身的转录本、病毒的miRNA介导人miRNA调控的网络、RNA干扰(RNAi)相关和干扰素相关的宿主对病毒的抑制及反抑制。miRNA介导的病毒-人相互作用的研究对于全面理解病毒-宿主相互作用的机制、开发抗病毒的药物具有重要意义。; 李臻鹏李非余光创应德全伯晓晨王升启; 关键词：微小RNA 干扰素

MagicStream:一个基于P2P技术的视频点播系统被引量：2: 2007年; 本文详细介绍了一个基于P2P技术的视频点播系统(MagicStream)的系统结构和软件流程,接着针对部分关键技术提出了解决方案,最后介绍了实现的系统原型并对实验结果进行了分析。; 刘锋彭宇行李慧霸李非; 关键词：P2P 视频点播

幽门螺杆菌感染激活人蛋白相互作用子网的构建: 2012年; 目的从整体水平探索幽门螺杆菌(Hp)感染后宿主的蛋白相互作用网络,挖掘其感染宿主细胞和导致宿主细胞病变的关键基因,为Hp感染的机制提供新的线索,可以为细菌-宿主联合靶向治疗提供基础。方法利用Hp感染的宿主细胞表达谱,基于激活子网算法构建了Hp感染激活子网,并对子网中的基因进行基因本体(GeneOntology,GO)分类。结果通过GO分类发现,子网中主要涉及宿主免疫反应的基因、细胞骨架相关基因和细胞增殖相关基因。结论幽门螺杆菌侵染宿主主要引发宿主的免疫反应、细菌进入宿主细胞的反应和宿主增殖与病变的反应。; 黎宏章徐燕君陈娇娥张洪生李非伯晓晨虞朝辉; 关键词：幽门螺杆菌基因表达谱

病毒—宿主蛋白质相互作用网络计算分析关键技术研究: 病毒性疾病是严重危害人类健康和生命安全的一大类传染病,历史上几次全球范围的病毒性疾病流行给人类带来了深重的灾难。近年来SARS、HIV、甲型H1N1等病毒的肆虐造成了极大的社会恐慌和难以估算的经济损失,病毒性生物恐怖剂制...; 李非; 关键词：蛋白质相互作用网络; 文献传递

生物医学数据分析中的深度学习方法应用被引量：17: 2016年; 生物医学数据的积累速度史无前例,为生物医学研究带来机遇的同时,也让传统数据分析技术面临巨大挑战.本文综述了深度学习方法应用在生物医学数据分析中的最新研究进展.首先阐述了深度学习方法,列举深度学习方法的主要实现模型,随后总结了目前生物医学数据分析中的深度学习方法应用情况,分析了在数据处理、模型构建和训练方法等方面共有问题的解决方法,最后给出了深度学习方法应用于生物医学数据分析时可能存在的问题及建议.; 李渊骆志刚管乃洋尹晓尧王兵伯晓晨李非; 关键词：数据挖掘

基于高通量测序技术的微生物检测数据分析方法被引量：22: 2017年; 高通量测序技术的发展正在逐渐改变诸多生物学领域的研究方法.为应对突发疫情以及新发未知微生物威胁的需求,微生物鉴定技术逐渐从传统的物理化学方法及核酸杂交等分子水平方法进一步走向利用无需培养的测序数据进行快速分析检测.随之而来的是对高通量数据分析在精度及速度的要求.基于高通量测序数据的微生物检测数据分析方法在近些年得到了快速的发展.本文分析了目前基于高通量测序数据的微生物检测数据分析方法,对其数据分析的处理流程和计算方法进行了研究,比较了各个微生物检测数据分析方法的特点及适用场景.最后结合本实验室工作总结微生物检测数据分析方法在实际应用中可能遇到的问题,希望对该应用领域的研究有一定的参考意义.; 周子寒彭绍亮伯晓晨李非; 关键词：高通量测序微生物检测数据分析方法性能评测

长背鳍波动推进游动研究被引量：23: 2006年; 以依靠长背鳍推进的“尼罗河魔鬼”为研究对象,对弓鳍目模式推进进行了研究。在“尼罗河魔鬼”巡航游动试验的基础上,通过对鱼体几何形态和柔性长背鳍波动的运动学分析,建立了“尼罗河魔鬼”长背鳍波动推进的简化运动学模型,并利用大摆幅伸长体理论分析了长背鳍波动推进的水动力学特性。计算表明:“尼罗河魔鬼”在0．728～0．985身长／s的速度范围内,长背鳍波动推进的水动力学效率介于81．664％-86．420％之间,表明长背鳍波动推进游动是一种适应水中环境的高效游动模式。; 王光明胡天江李非沈林成; 关键词：运动学模型

柔性长鳍波动推进试验及分析被引量：6: 2006年; 以依靠长背鳍推进的“尼罗河魔鬼”为研究对象,对柔性长鳍波动推进模式的运动学进行了研究。介绍了“尼罗河魔鬼”巡航游动试验的实验原理及方法,通过试验揭示了波动柔性长背鳍的形态学特征、运动特性及运动参数间的相关性,定性描述了“尼罗河魔鬼”正、逆向行进时背鳍产生波形的差异,在此基础上建立了柔性长鳍波动的运动学简化模型,利用细长体理论估算样本巡航游动时的水动力学效率大于83.12%。; 王光明沈林成胡天江李非; 关键词：尼罗河魔鬼运动学模型

布氏杆菌PBP_(39)蛋白抗原表达及免疫效果的研究被引量：2: 2005年; 目的　获得纯化的布氏杆菌PBP3 9重组蛋白抗原,观察PBP3 9重组蛋白的免疫原性。方法　扩增不同种布氏杆菌PBP3 9基因,测序、连接表达载体PET3 2a ,诱导表达,柱纯化PBP3 9重组蛋白抗原,免疫BALB/c小鼠,ELISA检测抗体及抗体亚型。结果　我国牛、羊、猪布氏杆菌PBP3 9基因与国外已报道的PBP3 9编码基因不完全相同。在蛋白N端5 8位碱基后多一G ,造成移码突变。故在85、86、87位编码终止子TCA。而在13 4、13 5、13 6位的ATG又编码了新的起始密码。布氏杆菌PBP3 9蛋白在大肠杆菌高效表达,表达量达40 % ,纯化重组蛋白抗原免疫BALB/c小鼠,产生了较高水平的特异性抗体免疫应答,抗体亚型主要是IgG1。结论　我国牛、羊、猪布氏杆菌PBP3 9编码抗原蛋白同国外已报道的不完全相同,纯化的PBP3 9重组蛋白抗原可诱导高水平的抗体反应,为筛选布氏杆菌病新型疫苗保护性抗原分子奠定了基础。; 罗德炎曾政李非高永辉李鹏王希良何凤田; 关键词：免疫原性

基于遗传算法的水下航行器形体优化设计方法: 本文提出了一种用于水下航行器形体优化设计的非梯度方法。不同于传统方案,该方法采用遗传算法,针对水下航行器初始形体,根据综合性能评估准则(如阻力、隐身、噪声、机动性等)进行优化设计,充分考虑水动力效应,给出较优的外形结构和...; 胡天江李非王光明沈林成; 关键词：遗传算法; 文献传递

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李非