吴世容
- 作品数：25 被引量：205H指数：7
- 供职机构：重庆大学化学化工学院更多>>
- 发文基金：教育部“春晖计划”霍英东基金重庆市应用基础研究项目更多>>
- 相关领域：理学医药卫生生物学农业科学更多>>
- 一种基于三维原子场相互作用矢量的新型氨基酸结构信息描述子被引量：8
- 2006年
- 从分子的三维空间结构出发,按照不同类型原子之间静电和立体作用得到一种新的分子结构表达方法——三维原子场相互作用矢量(3D-VAIF).利用该矢量对20种天然氨基酸空间结构性质进行计算,通过主成分分析获得单个氨基酸的特征描述子——氨基酸结构信息得分(SSIA).分别使用58个血管紧张素转化酶抑制剂、48个苦味二肽以及31个缓激肽对SSIA的性能进行了测试,所得模型的复相关系数R2cum和交互检验复相关系数Q2LOO分别为0.789,0.773;0.856,0.837和0.838,0.815.结果表明将SSIA用于肽类似物定量序列活性建模(定量序效建模,QSAM)效果优于传统氨基酸描述子.
- 周鹏周原吴世容李波田菲菲李志良
- 关键词：定量构效关系量子化学计算
- 将潜因多元建模技术与遗传虚拟筛选模式相结合：改善定量构效关系被引量：1
- 2008年
- 提出了改进的定量构效关系(mmQSAR)研究方法,即认为在知晓配基与受体相互作用模式前提下建立一种较可靠的定量构效关系模型,从而克服了传统做法中仅根据样本集分子自身信息来构建预测模型的某些弊端.将此思路应用于功能肽/蛋白质亲和活性考察,采用遗传算法(GA)筛选虚拟受体结合靶点及相互作用模式,结合偏最小二乘(PLS)潜因多元建模技术,通过交互检验均方根误差(RMSCV)作适应度评价函数筛选变化位点和受体残基,完成种群进化以最优个体为最终确定模型,得到一种新颖QSAR方法(mmQSAR):基于功能肽/蛋白质作用模式的遗传虚拟筛选(暂称GVSPPC).该法成功解决了诸多QSAR研究难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解的配基与之结合方式.分别使用生物功能寡肽和多肽体系对GVSPPC加以检验,其结果表明,GVSPPC得到了优于传统方法QSAR结果(R2cu>0.75～0.91,Q2cv>0.71～0.86,ERMS为0.19～0.95)且深入阐明配基与受体间作用机理,物理意义较为明确;同时计算选中模式作用能并与样本活性建立PLS模型,以其交互检验均方根误差(ERMScv)作评价函数完成种群进化.通过大规模迭代直到规定的终止条件或到达最大繁殖代数,以该过程最优个体作为最终确定QSAR模型.
- 李志良田菲菲吴世容杨善彬杨胜喜张巧霞周原覃仁辉梅虎陈刚李根容
- 关键词：定量构效关系偏最小二乘遗传算法评价函数
- 定量构效关系方法学研究与应用
- 李志良梅虎周原杨善彬杨力周鹏吴世容李根容杨胜喜蔡绍皙梁桂兆刘树深曾晖田菲菲张巧霞陈刚张梦军周丽平廖春阳
- 该项目系统提出“构效学四化”问题，深化提炼研究思路与集成构建方法体系，并将原始性和集成性自主创新成果深度融合，用以解决某些重要而复杂基础性和紧急性问题；从拓扑结构、物化性质、三维力场及相互作用场等方面入手，成功发展出具原...
- 关键词：
- 关键词：定量构效关系分子结构参数化
- 原子电性作用矢量用于呋喃糖核磁共振碳谱化学位移计算被引量：3
- 2006年
- 从分子二维拓扑结构出发,借助用于描述原子所处分子微观化学环境的原子电性作用矢量(AtomicElementaryElectronegativityInteractionVector,AEIV)对25种呋喃单糖中共计148个等价共振碳原子进行了表征,并以此建立起用于模拟单糖分子13CNMR化学位移的两参数多元线性回归方程,所得模型的复相关系数Rcum、交叉检验QLOO及均方根误差RMS分别达到0.907、0.901和6.757,并采用对半划分样本集交叉验证的方法来测试模型的稳定性能和预测能力.结果表明AEIV能够很好的模拟糖类物质13C化学位移值.
- 田菲菲李志良吴世容周鹏
- 关键词：原子电性作用矢量多元线性回归定量构谱关系
- 银杏叶中黄酮类化合物的提取及其医药学应用被引量：30
- 2004年
- 本文应用银杏叶提取物及口服药物银可络治疗老年冠心病患者 2 6例 ,观察治疗前、后血液流变学 (包括血液\还原 \血浆粘度 ,红细胞压积 \刚性 \变形 \聚集指数 )及心功能指标 (包括每搏量 \心排血量 \射血分数 )的变化 (p <0 .0 1 - 0 .0 5 ) ,结果发现治疗后左心室收缩期功能明显改善 .所有数据经统计学处理用x±s表示 ,组间差异采用t检验。讨论银杏叶提取物及其主要有效成分黄酮苷和银杏内脂的扩张动脉血管 ,降低血粘度 ,抑制血小板聚集 ,拮抗特异性血小板活化因子 ,改善周围血管循环等作用 .本实验提示老年冠心病口才长期服用银可络 ,可缓解心绞痛 ,预防心肌梗塞及猝死发生 ;血液粘度增加是冠心病的潜在危险因素 。
- 覃仁辉张梦军吴世容李志良
- 关键词：银杏叶黄酮醇老年冠心病血液流变学
- 电性距边矢量系统(MED)应用于生物医药分子建模与定量构效优化
- 李志良刘树深蔡绍皙李根容吴世容廖春阳周丽平张梦军梅虎孙立力杨胜喜覃仁辉曹晨忠熊清周原李波叶楠兰玉坤侯敏刘振德李伯玉聂金媛尹子卉徐红王远强曾晖刘永红仇亮加林光华
- 该课题据分子拓扑结构并依原子划分方案，按原子电性和间距描述相互作用，提出系列二维新型电性距边矢量（MED/MDE/MEE/MHD）描述子，用于生物与药物及毒物分子结构表达。通过不同结构分辨及定量构效相关考察，证明能高效简...
- 关键词：
- 关键词：医药
- 微波辅助提取茯苓中茯苓多糖的研究被引量：54
- 2004年
- 目的 将微波辅助提取新技术应用于茯苓水溶性多糖的提取 ,寻求最佳提取工艺。方法 采用均匀优化设计试验条件 ,以苯酚 -硫酸法测定样品中多糖含量。对超声辅助提取和传统水提法比较 ,并对水解前后的微波提取多糖衍生物用毛细管电泳检测。结果 最佳提取条件 :时间为 18m in;固液比为 1∶ 5 0 ;微波占空比 4 2 % ,此时提取率为 2 .792 %。优于传统。结论 微波辅助提取速度更快、提取效率更高 ;毛细管电泳检测表明微波提取茯苓多糖过程合理 ,能得到较理想的提取物。
- 聂金媛吴成岩吴世容李志良
- 关键词：茯苓茯苓多糖微波辅助提取毛细管电泳
- 一种基于遗传算法的肽/蛋白质结合模式虚拟筛选建模技术被引量：4
- 2006年
- “合理”QSAR模型是指在了解配体与受体相互作用模式的前提下建立定量构效关系,这样避开了传统做法仅仅依靠样本集分子自身信息来构建预测模型的诸多弊端.本文将此思想应用于肽/蛋白质亲和活性的研究当中,借助于遗传算法作为虚拟受体结合靶点及相互作用模式的筛选手段得到了一种新的建模技术:肽/蛋白质结合模式遗传虚拟筛选(geneticvirtualscreeningofcombinativemodeforpeptide/protein,GVSC).该法成功解决了“合理”QSAR研究中的难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解配基与之发生的结合方式.分别使用58个血管紧张素转化酶,18个Camel抗体蛋白cAb-lys3双位点突变残基对GVSC加以检验,其结果表明GVSC能够较好地阐明配基与受体之间的作用机理,并能得到优于传统方法的QSAR模型.
- 周鹏田菲菲李波吴世容李志良
- 关键词：定量构效关系遗传算法偏最小二乘回归
- 生物质谱的研究及其应用被引量：26
- 2004年
- 发展生物质谱是为解决生命科学中有关生物物质分析问题,主要借助软电离质谱技术对生物大分子如蛋白质、核酸和多糖等进行结构分析。生物质谱已成为质谱学中最活跃的研究领域,推动了质谱分析理论和技术的发展。笔者简要介绍了生物质谱的发展,重点讨论因"发明了对生物大分子的质谱分析法"而荣获2002年诺贝尔化学奖金一半的美国科学家约翰.芬恩教授(JohnB.Fenn)和日本科学家田中耕一工程师(KoichiTanaka)分别研发的电喷雾电离质谱(ESI-MS)和基质辅助激光解吸电离质谱(MALDI-MS),特别阐述它们应用于蛋白质、核酸和糖结构分析及基因组学、蛋白质组学、糖组学等生物组学和化学组学中。
- 吴世容李志良李根容杨胜喜
- 关键词：生物质谱蛋白质核酸多糖基因组学蛋白质组学糖组学
- 分子电距矢量对山矾花中头香成分气相色谱保留时间的估计和预测被引量：5
- 2004年
- 用分子电距矢量(MEDV)描述子对22个从山矾花中分离出的头香成分的分子进行结构表征,对MEDV矢量和其气相色谱保留时间之间建立了定量结构-色谱保留值关系。线性回归10参数模型的复相关系数R达到了0 972,逐步回归5参数模型复相关系数R为0 952,交互检验的相关系数RCV值为0 882,表明模型对样本具有较好的稳定性能和预测能力。
- 聂金媛廖春阳吴世容李志良
- 关键词：分子电距矢量
