陈洪 作品数:10 被引量:430 H指数:7 供职机构: 中国科学院遗传与发育生物学研究所 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 更多>>
RAPD Appraisal of Purity of the Hybrid Rice SY63 被引量:2 1996年 使用纯度低或真实性差的杂交种子会给农业生产造成极大损失。然而杂交种子的纯度无法单纯从种子形态上鉴别.本文首次采用RAPD特异扩增谱带做为分子标记对水稻杂交种纯度进行了鉴定。汕优63杂交水稻种子由中国水稻研究所从某制种单位随机取样获得。珍汕97A不育系和明恢63恢复系等品种由中国水稻研究所提供。在做形态观察的同时,分别取上述三种材料叶片制备DNA作为初始模板DNA。对300个RAPD随机引物,经过三次多态性初筛复筛,发现随机引物P18可以稳定地扩增出一条来源于父本明恢63的0.8kb的特异条带。用P18引物对100株汕优63杂交单株进行RAPD扩增,其中83个获得了0.8kb特异条带(Fig.1upper)。分子杂交证明其结果是可靠的(Fig.1Lower)。以RAPD扩增结果为依据,对这100株材料进行植株形态比较,发现那17个不能扩增出特异条带的单株均为假杂种。说明该制种单位汕优63的假种率为17%。大大超过农业部的有关规定。应对其原因和后果进行追究。用P18引物对18种分别为籼粳及其中间型的常用稻种进行RAPD扩增鉴定,除明恢63的亲本──圭630和中间型Pccos,Aus373具有0.8kb的特异条带? 陈洪 钱前 朱立煌 闵绍楷 陈美玲关键词:RAPD 水稻双单倍体群体的分子标记图示基因型分析 被引量:9 1995年 利用窄叶青8号(籼稻)/京系17(粳稻)花培产生的双单倍体群体建立了一个包含160个分子标记的遗传连锁图,在此基础上利用HYPERGENE软件建立了52个DH系的图示基因型,并对DH系的亲本基因组比率和染色体的交换重组频率进行了比较分析。结果表明本实验所用的DH群体没有显著偏离正态分布,籼粳稻杂交后代中植株的籼粳表现与同工酶、形态指数和基因组比率的分析结果一致,此外还发现DH群体中出现了大量的交换罕见染色体。利用图示基因型分析发现株高和分子标记RZ978和RG4A相关,生育期和RRK08-1、RG477和RG511相关。本文还就图示基因型分析技术在DH群体的遗传分析和选择育种中的应用进行了讨论. 徐吉臣 陆朝福 陈洪 何平 陈英 朱立煌 徐云碧关键词:水稻 双单倍体群体 分子标记 RAPD技术在异精激发方正银鲫比较研究中的应用 被引量:83 1994年 银鲫是自然界能进行雌核发育的鱼类,同时它也能广泛的受到异种鱼类精子的激活而获得生长速度快的后代.在理论上这种用异种精子激活的后代(称异育银鲫)在其发育过程中不进行雄、雌原核的融合,但从目前已有的形态学(体形、体重、体色等差异)和同工酶(酶谱、酶活等变化)研究结果又都确认了外源精子的影响. 陈洪 朱立煌 杨靖 薜国雄关键词:RAPD 方正银鲫 银鲫 异质育种 杂交水稻汕优63杂种纯度的RAPD鉴定 被引量:104 1996年 目前,全国杂交水稻播种面积已占水稻播种总面积的40%,产量则达到水稻总产量的50%以上.随着杂交水稻种植面积不断扩大,原种生产和销售过程中的种子纯度问题显得日趋重要,杂交种子纯度无法单纯从种子形态上分辨,往往需要将种子播种后至成熟期方能辨别,使用纯度低或真实性差的种子会给农业生产造成极大损失.简便、快速、准确和早期地鉴定杂交水稻种子纯度的方法将为稳定杂交水稻的增产效果提供保证.在本研究中,我们使用RAPD(Random amplified polymorphic DNA)技术,针对全国播种面积最大的由雄性不育系珍汕97A为母本,恢复系明恢63为父本制成的杂交水稻汕优63(F1),利用RAPD随机引物扩增筛选出F1与父本相同或与母本相同或与父母本相互补的RAPD特异扩增谱带,并以此特异谱带做为分子标记首次对杂交水稻杂种纯度进行鉴定. 陈洪 朱立煌 陈美玲 钱前 闵绍楷关键词:杂交水稻 杂种纯度 RAPD鉴定 汕优63 水稻 中国普通野生稻遗传分化的RAPD研究 被引量:29 1996年 Ninety accessions which included Chinese common wild rice (Oryza rufipogon) from 8 provinces and traditional cultivars from lower and middle basins of Yangtze River, southeast of China and Yunnan Province as well as some commercial varieties were analyzed by RAPD with 24 primers. A scattered figure suggesting the indica japonica and wild domestication differentiations among 90 rice accessions was generated based on RAPD data. The results indicated that Chinese common wild rice, indica and japonica accessions were divided into 3 groups respectively. Chinese common wild rice were somewhat closer to the japonica type than the indica type. 王振山 陈洪 朱立煌 王象坤关键词:野生稻 普通野生稻 遗传分化 RAPD标记 SRFA法构建水稻DNA指纹图谱 被引量:27 1996年 水稻基因组DNA用PstⅠ酶切同时与人工接头连接后,使用选择性引物进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳检测所构建的水稻DNA指纹图谱。结果表明在JX17和ZYQ8间以及5种野生稻间均存在DNA多态性片段。 陈洪 王振山 朱立煌关键词:水稻 DNA指纹图谱 RAPD标记构建水稻分子连锁图 被引量:121 1995年 利用随机扩增多态性DNA(RAPD),在一个水稻(Oryza sativa L.)的双单倍体(DH)群体中发展分子标记,仅用52 个RAPD标记建成了一个水稻RAPD分子连锁图。该图覆盖基因组的总长度为898.4 cM (centim organ),标记间的平均间距为17.3 cM。 陈洪 朱立煌 徐吉臣 陈美玲关键词:水稻 随机扩增多态性 DNA 分子连锁图 RAPD PCR技术检测人乳头状瘤病毒DNA 1993年 本文用一对适合人乳头状瘤病毒DNA的通用PCR引物对临床阳性和正常组织进行了PCR扩增检测分析,阳性组织均得到一条特异性的DNA扩增片段,正常组织均没有任何扩增片段。阳性组织DNA扩增片段经克隆后进行DNA序列分析,证明该扩增片段确为目标DNA扩增片段。 陈洪 翟文学 朱衡 周骏马 孔繁荣 朱学骏关键词:乳头状瘤病毒 DNA 聚合酶链反应 致病性念珠菌DNA的AFLP指纹图谱 被引量:76 1996年 半知菌亚门中的念株菌(Candida)约有20个种是人体呼吸道,胃肠道,皮肤及生殖器官的常见腐生菌,它们还是AIDS患者念株菌性鹅口疮、食道炎及侵袭性感染常见的原因.通常的血清学鉴定方法是以不同菌体表面多糖抗原物质的差异为依据,但由于念珠菌有些菌体间抗原物质很相似,相互间有交叉反应,因此很难反映出实际的感染情况;而传统的表型分型法除了受环境因素和真菌本身变异的影响外,还受到实验本身重复性差,操作过程繁琐以及实验结果的判断有时并不十分明确等诸多因素的干扰.因此,建立一种稳定、快速、准确的致病性念珠菌基因分型鉴定方法在临床上对指导诊断和治疗具有重要的意义.由Zabeau等人1992年创立的AFLP(Amplified fragment length polymorphism)技术是目前国际上构建DNA指纹图谱的最新方法之一,该方法结合了RFLP(Restriction frag-ment length polymorphism)技术和RAPD(Random amplified polymorphic DNA)技术的特点,使用人工接头(Adapter)与限制性内切酶酶切的基因组DNA片段连接并以此为DNA模板,合成系列3’-末端随机变化数个碱基且与人工接头序列相互补的PCR引物进行PCR特异条件扩增,经电泳检测后可获得DNA指纹图谱.本研究针对临床上常见的8种致病性念珠菌,以Pst 陈洪 朱立煌 陈美玲 李冬梅关键词:AFLP 念珠菌 DNA指纹图谱 病原真菌 SRFA法构建水稻DNA指纹图谱 1997年 RAPD用于生物鉴定具有快速、简便、经济等优点。但是,由于该法所用引物通常为9-10个寡聚核苷酸,与PCR使用特异引物相比,其Tm值相对较低,扩增反应易受外界条件影响,重复性较差。SRFA技术采用设计有限制内切酶位点的人工合成接头与引物互补,弥补了RAPD法的上述不足。Fig.1为SRFA的技术路线。为提高连接效率,在同一试管内,用PstI酶解基因组DNA,并与人工接头连结,制备SRFA扩增的模板。合成与接头序列相应的引物。对5上野生稻品种和籼、粳稻各一个栽培品种SRFA刊物放增。Fig.2表示:每种材料均能获得约10条以得一条(1.3kb)片段,用引物2可得2条(1.1kb、0.7kb)片段。与FAPD法相比,SRFA法增加20%的多态性。栽培稻与野生稻之间在多态性没有差异,说明两乾亲缘关系非常接近。五种野生稻的图谱可分为两类:江西、湖南、广西的与籼稻相近,广东、云南的与粳稻相近。当然,这还有待其它方面的研究来验证。接头的设计要求避免自身连续,与目的的自然连续后不能再被PstI切开。引物包括不变序列和选择序列两部分,前者与接头互补,后者为数个隋机序列。因此,SRFA法除了重复性好以外,还可通过增加(或减少)选择序列的数目扩增较少(或多)的产物片段,满足不同的需要。每一对设计有不同限制酶切位点的接头和引物可扩增出一个特异的DNA指纹图谱,与RAPD法相比,SRFA法操作稍显繁琐,模板DNA用量大、质量要求高,由于酶切和连续,成本也相对较高。 陈洪 王振山 等关键词:DNA指纹图谱