赵广录 作品数:36 被引量:157 H指数:7 供职机构: 深圳市慢性病防治中心 更多>> 发文基金: 广东省医学科学技术研究基金 深圳市卫生局科技项目 深圳市科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
2013—2017年深圳市非结核分枝杆菌流行状况分析 目的分析深圳市非结核分枝杆菌(NTM)的流行状况,为NTM防控策略提供依据。方法搜集2013—2017年深圳市慢性病防治中心和各区慢性病防治院收治的9427例疑似肺结核患者,对上述患者进行痰分枝杆菌培养(BACTEC M... 洪创跃 李金莉 赵广录 桂静 朱玉梅 杨争 余卫业关键词:疾病特征 流行病学研究 文献传递 拟诊为淋病患者中泌尿生殖道沙眼衣原体基因分型及序列分析 被引量:3 2010年 目的 了解深圳市拟诊为淋病患者中泌尿生殖道沙眼衣原体的合并感染情况及其基因型分布和序列变异特点.方法 采集401例拟诊为淋病患者的泌尿生殖道分泌物样本,应用Roche Amplicor全自动核酸检测系统对样本进行淋球菌和沙眼衣原体双检,提取DNA,应用巢式聚合酶链反应(nested-PGR)扩增沙眼衣原体主要外膜蛋白基因(omp1)中的VS1~VS2片段,并对其进行序列测定,所获得的序列利用Mega4.0软件与标准参考株进行比对,分析确定其基因型及序列变异情况.结果 401例拟诊为淋病患者中淋球菌的感染率为82.3%(330/401),沙眼衣原体的感染率为24.2%(97/401),淋球菌和沙眼衣原体的合并感染率为21.7%(87/401).97份沙眼衣原体阳性样本中获得73份沙眼衣原体基因片段序列,共检出8个基因型,分别为E型(27.4%)、G/Ga型(23.3%)、D/Da型(16.4%)、F型(13.7%)、J型(11.0%)、H型(5.5%)、B和K型(各1.4%).序列分析发现3例(4.1%)菌株发生错义突变,分别为D/Da型、E型、G/Ga型;F型、H型、J型和K型序列虽多见碱基突变,但均为同义突变.结论淋病患者合并感染沙眼衣原体的比例较高,且泌尿生殖道沙眼衣原体的基因型以E、G/Ga、D/Da和F型为主.序列分析可以为泌尿生殖道沙眼衣原体的分子流行病学研究提供依据. 张娟娟 赵广录 张丽君 王峰 洪福昌 蓝丽娜 吴肖冰 陶小华 张春来 卢次勇 冯铁建关键词:淋病 沙眼衣原体 巢式聚合酶链反应 基因分型 深圳地区吸毒人群HIV-1分子流行病学调查 被引量:3 2009年 目的了解HIV-1毒株亚型在深圳地区吸毒人群中的流行情况,并分析其流行趋势及进化规律。方法收集1996—2008年深圳地区吸毒人群HIV确认阳性样本166例,应用巢式聚合酶链反应(nPCR)技术,对样本膜蛋白基因(env)进行扩增,并对其基因区核苷酸序列进行测定和分析。结果166份样本中共存在CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC3种重组毒株以及B’、C、A13种亚型;其在所有分析样本中的比例分别为65.06%(108/166)、19.88%(33/166)、6.02%(10/166)、7.23%(12/166)、0.60%(1/166)和1.20%(2/166);系统进化分析发现,不同时间段HIV-1各亚型出现较明显的汇聚现象;3个不同时间段所流行的CRF01_AE、CRF07_BC亚型组内及与标准参考株间的基因离散率有较为显著性的增大趋势。结论深圳地区吸毒人群HIV-1流行毒株以CRF01_AE重组亚型为主,其次是CRF07_BC重组亚型,也存在CRF08_BC、B’、C、A1亚型,并且各亚型在流行过程中已发生较大变异。 赵广录 冯铁建 王晓辉 赵锦 石向东 张燕 甘永霞 罗贤如关键词:艾滋病病毒 吸毒人群 分子流行病学 1992--2008年深圳HIV-1CRF01_AE重组株的流行趋势与进化规律 被引量:1 2011年 目的了解HIV-1CRF01_AE重组株在深圳地区的流行情况,并分析其流行趋势及进化规律。方法收集深圳地区1992--2008年HIV确认阳性血液样本489份,应用巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)技术,对样本膜蛋白(Env)基因进行扩增,并对其基因区核苷酸序列进行测定,判定亚型结果。对获得的CRF01_AE重组株核酸序列进行系统进化分析,并计算基因离散率。结果共有465份样本获得分型结果,其中CRF01_AE重组株样本300份(占64.5%)。1992-1999、2000—2005和2006--2008年3个时间段CRF01_AE重组株所占比例分别为56.8%(21/37)、68.4%(78/114)和64.0%(201/314);在这3个时间段内,经异性性传播的比例分别为52.4%(11/21)、43.6%(34/78)和45.8%(92/201),经同性性传播的比率上升明显,分别为4.8%(1/21)、0.0%(0/78)和22.4%(45/201),经吸毒传播的比例分别为19.0%(4/21)、51.3%(40/78)和30.8%(62/210)。系统进化分析发现,不同时间段的样本出现明显的时间聚集现象,并伴有传播途径的聚集及交叉感染现象。各时间段CRF01_AE重组株组内基因离散率分别为(8.783±4.717)%、(11.054±7.141)%、(13.218±4.080)%,有明显的增大趋势。结论HIV-1CRF01_AE重组株是深圳地区的主要流行株,主要经异性性行为、同性恋和吸毒人群传播,随着时间的推移毒株变异程度逐渐增大。 于微 赵广录 张娟娟 陈琳 冯铁建关键词:HIV-1 分子流行病学 用mRNA差异显示方法筛选HIV/HCV合并感染者差异表达基因 被引量:3 2008年 目的建立信使RNA(messenger RNA,mRNA)差异显示技术平台,寻找艾滋病病毒/丙型肝炎病毒(HIV/HCV)合并感染者差异表达基因。方法分离正常人、HIV感染者、HCV感染者及HIV/HCV合并感染者的外周血单核细胞,提取RNA,定量后利用锚定引物进行逆转录合成cDNA,然后利用10对随机引物及锚定引物进行PCR扩增。行6%变性PAGE凝胶电脉,银染后分析结果,回收差异条带测序。通过SYBRgreen实时荧光定量PCR以β-actin为内参,进行大量人群样本的定量分析鉴定。结果共筛选出107条差异表达条带,其中大部分是感染者与正常人之间的差异显示条带。已鉴定6个序列,其中2个序列是未知功能基因,3个序列为锌指蛋白141 (RNF141),1个序列为环磷酸腺苷磷酸化蛋白(ARPP-19)基因。经过对超过10份病人血样RNF141荧光定量PCR初步鉴定,在HIV/HCV合并感染者、HCV感染者中,RNF141的表达水平高于正常人。结论RNF141与HIV/HCV合并感染及HCV感染可能存在一定相关性。同时证明,利用mRNA差异显示方法可以筛选出与HIV/ HCV合并感染或单独感染相关的差异表达基因。 赵锦 赵广录 周克恒 李江鹏 甘永霞 张燕 陈琳 王晓辉 冯铁建关键词:MRNA差异显示 实时荧光定量PCR 基因芯片检测结核分枝杆菌利福平异烟肼耐药性的应用评价 被引量:8 2012年 目的评价基因芯片检测结核分枝杆菌临床株对利福平和异烟肼耐药性的效果,探讨耐多药结核分枝杆菌基因检测合适的靶位点。方法回顾性收集深圳市慢性病防治中心2009年门诊患者痰标本菌株24株及2007至2009年深圳市耐药监测项目痰标本培养分离菌株127株。采用基因芯片检测其对利福平和异烟肼耐药性,与比例法药敏试验结果比较,评价其敏感度、特异度和准确性。Kappa检验评价芯片检测和表型药敏结果的一致性。对结核分枝杆菌利福平、异烟肼主要耐药相关基因rpoB、katG、inhA编码区、inhA启动子区和ahpC启动子区测序,分析耐药相关突变位点及频率。结果基因芯片检测利福平耐药的敏感度为94.4%,特异度为97.5%,准确性为96.0%;检测异烟肼耐药的敏感度为79.1%,特异度为100%,准确性为86.8%。耐利福平菌株中97.2%(70/72)在rpoB突变热点区域发生突变,位点包括531、526、516、511和533位密码子。耐异烟肼菌株中,70.3%(64/91)发生katG315密码子突变,11.0%(10/91)发生inhA-15突变,还有9株(9.9%)在ahpC启动子区发生突变,包括ahpC-9(4株)、ahpC-10(2株)、ahpC-6(2株)、ahpC-12(1株)和ahpC-32(1株)。结论基因芯片系统可以快速检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性,对利福平的检测具有良好的敏感度和特异度,检测异烟肼敏感度稍低。ahpC启动子区可以作为异烟肼耐药突变检测靶基因,联合筛选katG315密码子、inhA-15和ahpC启动子区突变可以显著提高异烟肼耐药性检测敏感度。 王峰 桂静 赵广录 崔运勇 刘小立关键词:利福平 异烟肼 寡核苷酸序列分析 男男同性恋HIV耐药的Meta分析 被引量:3 2017年 目的:了解男男同性恋(men who have sex with men,MSM)艾滋病原发性耐药及耐药基因突变位点现状。方法:检索CNKI,VIP,CBM,万方数据库,Pub Med,Web of Knowledge,Springer及Medline数据库,提取HIV耐药以及耐药基因突变位点数据,对效应量进行合并,并对样本量、地区、人种、质量评价得分及采样时间进行亚组分析。结果:共纳入43篇文献,MSM未治疗HIV感染者总耐药率、蛋白酶抑制剂(proteinase inhibitors,PI)耐药率、核苷类反转录酶抑制剂(nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NRTI)耐药率、非核苷类反转录酶抑制剂(non nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTI)耐药率分别为10.21%(95%CI:8.65%~12.03%),2.98%(95%CI:2.25%~3.93%),4.05%(95%CI:3.14%~5.21%),4.42%(95%CI:3.31%~5.88%)。PI主要突变位点、PI次要突变位点、NRTI突变位点、NNRTI突变位点的突变位点频数≥3的突变率分别为0.55%(95%CI:0.38%~0.80%),1.31%(95%CI:0.98%~1.75%),0.85%(95%CI:0.51%~1.40%),1.19%(95%CI:0.70%~2.01%);频数<3的突变率分别为0.79%(95%CI:0.55%~1.13%),1.73%(95%CI:1.21%~2.46%),0.86%(95%CI:0.61%~1.21%),2.24%(95%CI:1.77%~2.83%)。样本量、地区及人种均是异质性的来源,耐药率和基因突变位点突变率在不同的亚组中分布不同。结论:美洲、欧洲地区MSM原发性耐药率较高,亚洲地区较以往也有所升高;同时PI次要突变位点突变率亦较高,应引起重视。 杨琳 许睿玮 赵广录 冯铁建 胡平成关键词:艾滋病病毒 原发性耐药 男男同性恋 META分析 深圳地区HIV-1感染者耐药突变本底水平的调查 目的:建立一套完善,可靠,适合深圳人群的HIV-1耐药性基因型检测方法,调查分析深圳地区未接受抗病毒治疗的HIV感染者/AIDS患者的病毒株耐药突变及其本底流行情况。方法:从未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者血浆中提取病... 赵锦 马贞丽 赵广录 王晓辉 冯铁建关键词:HIV-1感染者 基因型检测 耐药突变 文献传递 深圳市医疗机构性病实验室现况调查分析 被引量:7 2011年 目的了解深圳市各级各类医疗机构性病实验室的现状,为加强性病实验室规范化建设,提高性病检测水平提供依据。方法对深圳市主要性病监测诊疗服务机构,包括市、区、街道公立医院及民营医疗机构,进行近5年来性病实验室资质、人员、检测方法、质评开展等情况的调查。结果调查的92家性病监测机构中,36家实验室建立了规范化性病实验室;平均专、兼技术人员分别从2005年的2.00和2.67上升到2009年的2.47和3.07,人员结构有所改善,业务培养得到了加强。2009年开展淋球菌涂片镜检、淋球菌培养、非梅毒螺旋体抗原血清学试验、梅毒螺旋体抗原血清学试验、沙眼衣原体抗原快速检测和核酸扩增检测的实验室比例,分别为89.13%、68.48%、96.74%、71.74%、82.61%和16.30%;2008年上述项目参加各类室间质评的比例分别为37.80%、58.73%、64.04%、65.15%、40.79%和40.00%。结论近年来深圳市性病实验室建设得到了加强,但存在不同类别医疗机构和不同区域发展不均衡现象;实验室的检测能力及质量控制需要进一步加强。 王峰 蓝丽娜 洪福昌 赵广录 冯铁建关键词:性病 实验室 HIV基因检测芯片,其制备方法和应用其检测HIV核酸的方法 本发明适用于HIV核酸检测领域,提供了一种HIV基因检测芯片,其制备方法和应用其检测HIV核酸的方法。其中在芯片的固相载体上固定有HIV特异性基因片段和阳性及阴性对照,所述HIV特异性基因片段包括SEQ IDNO:1-6... 冯铁建 赵广录 王晓辉 陈琳 石向东文献传递