程刚
- 作品数:5 被引量:15H指数:3
- 供职机构:新疆大学生命科学与技术学院生物资源基因工程重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金新疆维吾尔自治区科技支疆项目新疆特殊环境微生物重点实验室开放课题更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 新疆尉犁县胡杨内生微生物群落多样性的研究
- 为探究新疆尉犁县胡杨内存液中内生微生物的群落构成,本研究利用免培养方法对其中细菌、古菌和真菌的多样性进行了研究,通过直接提取胡杨内存液中总DNA,分别使用细菌、古菌和真菌通用引物进行rRNA基因扩增,构建相应的rRNA基...
- 程刚
- 关键词:免培养法多样性RRNA系统发育分析
- 文献传递
- 异子蓬PEPC基因原核表达及其重组菌在非生物胁迫下的耐受力解析被引量:8
- 2015年
- 该研究在Escherichia coli Transetta(DE3)中表达了C4盐生植物异子蓬的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(PEPC),并进行了酶学特性及非生物胁迫响应分析,以期初步阐明PEPC基因在非生物胁迫下的生物学功能,为异子蓬PEPC的非生物胁迫的抗性生理研究提供参考依据。基于5′-RACE技术获得异子蓬PEPC全长基因(GenBank登录号为KP985714),构建了E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重组菌株。通过分光光度法和酶联免疫吸附技术(ELISA)分别测定了PEPC重组蛋白的酶活和含量,并检测E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重组菌株在非生物胁迫下的耐受性。生物信息学分析发现,该PEPC基因的cDNA全长为2 901bp,编码966个氨基酸,与甜菜(Beta vulgaris)PEPC的氨基酸序列一致性达90%,具有PEPC的典型保守结构域(PEPcase)以及VlTAHPTQsiRR和VMIGYSDSgKDAG活性位点;PEPC蛋白属PEPC-1型的不含信号肽的非分泌型亲水蛋白。Western blot结果显示,融合GST的PEPC蛋白的分子量约130~140kD;在37℃用0.8 mmol/L IPTG诱导E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重组菌株显示出更高的PEPC酶活及含量,而且E.coli Transetta::pGEX-4T-1-PEPC重组菌在200~800mmol/L NaCl、5%~20%聚乙二醇(PEG)6 000、25℃~52℃温度范围、50~400μmol/L甲基紫精和pH 3.0~11.0的非生物胁迫下生长均明显优于对照。研究表明,异子蓬PEPC基因的表达提高了E.coli耐受非生物胁迫的能力。
- 程刚兰海燕
- 关键词:磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶非生物胁迫
- 新疆库米什金矿土壤可培养细菌的多样性分析
- 2011年
- 【目的】了解新疆库米什一处金矿土壤可培养细菌的多样性及建立菌种资源库。【方法】采集库米什金矿土壤样品,采用两种不同培养基(LB,TSB)分离纯化细菌,对其进行形态观察(菌落及细胞)、生理测定、16SrDNA测序和系统进化分析。【结果】从两种培养基上总共得到50株细菌,根据基于16S rDNA的系统进化分析表明,50株菌分别属于3个大类群:厚壁菌门(Firmicutes),放线菌门(Actinobacteria),γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria),12个属,30个分类单元。其中芽孢杆菌属(Bacillus)为优势细菌种群,占已测种群的63.3%。菌株L10-5与Bacillus foraminis(AJ717382)有96.463%的相似率,可能为潜在新种。【结论】库米什金矿土壤可培养细菌具有较高的多样性,存在潜在新菌种资源,值得进一步研究。
- 艾尼江.尔斯曼玛丽帕.吐达洪马丽艳木.阿木东卡依尔.玉素甫祖母拉提.阿布都热依木程刚艾尔肯.热合曼
- 关键词:库米什金矿可培养细菌RDNA序列多样性
- 沙雅县胡杨林土壤可培养细菌的多样性分析被引量:3
- 2011年
- 【目的】了解新疆沙雅县胡杨林土壤可培养细菌的多样性。【方法】沙雅县胡杨林采集土壤样品,采用两种不同的培养基(LB,TSA)分离纯化细菌,并对它们进行16SrDNA测定和系统进化分析。【结果】分离纯化不同表型的57株细菌。对它们16SrDNA序列分析表明,57株菌分别属于3个大类群厚壁菌门(Firmicutes),放线菌门(Actinobacteria),γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria),13个属,33个种;芽孢杆菌属是优势细菌种群,它占已测种群的67.2%。其中6株菌M28,M13,CT3,YS30—1,CM5,CL19初步被认为是潜在的新种(16SrDNA相似率为96.780%~97.961%)。【结论】沙雅县胡杨林可培养细菌不仅具有比较高的多样性,并存在一些潜在的新的细菌菌种资源,极具进一步发掘的潜力。
- 马丽艳木.阿木东谢仁娜依.甫拉提卡依尔.玉素甫艾尼江.尔斯曼玛丽帕.吐达洪程刚祖母拉提.阿布都热依木艾尔肯.热合曼木合塔.阿不都克里木
- 关键词:可培养细菌RDNA序列多样性
- 一株分离自胡杨树杆液的内生酵母菌初步鉴定被引量:4
- 2012年
- 【目的】依据形态学、生理生化和26S rDNA D1/D2区序列特征,确定一株胡杨内生酵母菌的分类学地位。【方法】通过平板划线分离法分离纯化胡杨树干部内存液样品中的内生酵母菌;检测分离菌株形态学特征和生理生化特征,进一步对酵母菌株的26S rDNA D1/D2区序列进行扩增以及系统进化分析。【结果】传统的形态学特征和生理生化特征鉴定及26S rDNA D1/D2区序列分析结果表明菌株ZA-7与Rhodotorulaminuta(FR870029)相近,相似率为99.4%,存在4个碱基的差异。【结论】从胡杨树干液中分离得到了一株尚未从植物中分离到的内生酵母菌,并将该菌株鉴定为Rhodotorula minuta的近似种。
- 祖母拉提.阿布都热依木程刚布阿依夏姆.阿木提努力曼姑.司马义热孜亚.艾肯木合塔尔.阿布都克里木艾尔肯.热合曼
- 关键词:RHODOTORULARDNA