王化军
- 作品数：6 被引量：10H指数：2
- 供职机构：中国科学院生物物理研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 用神经网络法预测膜蛋白RH和BR的二级结构被引量：6
- 1990年
- 膜蛋白的结构预测目前还十分困难.本文以两个典型的膜蛋白为选材,用神经网络方法对其二级结构做了预测.预测结果与实验资料的符合率与该方法用于球蛋白时的结果一致,因此是较好的.鉴于目前还没有人将此方法用于膜蛋白的结构预测.我们拟进一步发展此方法.
- 陈润生王化军倪向善石秀凡
- 关键词：膜蛋白RHBR神经网络法
- 预测蛋白质二级结构的人工神经元网络方法被引量：4
- 1989年
- 本文独立地建立了用人工神经元网络预测蛋白质二级结构的方法,并通过分析我们提出的分布矩阵(表达每一类构象被预测成所有各类构象的可能性的矩阵),对于这一方法的误差以及造成误差的可能的原因进行了较过去更为深入的分析.并在此基础上提出了一种修正的学习方法,结果对于规则二级结构(α螺旋和β折叠)的预测精度和相关系数均有提高.
- 王化军陈润生倪向善石秀凡凌伦奖
- 关键词：蛋白质结构
- 基于从头计算的丙氨酸、缬氨酸两性离子和水分子的相互作用势
- 1991年
- 用理论方法研究生物分子的水溶液时,常要用到水和生物分子的相互作用势。在水和氨基酸的相互作用势方面,关于中性氨基酸的研究目前已有很多,而关于氨基酸两性离子的研究却相对很少。事实上,在水溶液中氨基酸主要以两性离子的形式存在。因此,构造更多的水和氨基酸两性离子的相互作用势是很有意义的。近年来,我们已在这方面做了些工作,先后构造了水和丙氨酸两性离子及缬氨酸两性离子的相互作用势。本文的目的是构造一个同时适合这两种情况的相互作用势,以期提高势函数的普适性。
- 凌伦奖倪向善石秀凡王化军陈润生
- 关键词：从头算相互作用势
- 全文增补中
- 基于从头算的缬氨酸两性离子和水分子的相互作用势
- 1990年
- 本工作分两个阶段,第一阶段用从头算方法计算纳氨酸两性离子同处于160种不同位置的水分子的相互作用能,计算时采用最小基组并进行了基组重叠修正,最后还对计算得的相互作用能用Slater-Kirwood公式作色散能修正.第二阶段是势函数拟合的工作,做法是舍弃12个相互作用能大于5Kcal/mole或原子间距离小于1.68(?)的布点,对其余148个布点进行拟合.拟合结果的标准偏差为SD=0.48Kcal/mole.
- 凌伦奖倪向善王化军陈润生石秀凡
- 关键词：缬氨酸两性离子水分子相互作用
- 胰凝乳蛋白酶原激活过程的分子动力学研究
- 1990年
- 本文报道了我们使用分子动力学方法模拟胰凝乳蛋白酶原激活过程的研究.使用我们所提出的虚拟势法,通过对不加虚拟势和加大小不等的虚拟势的几种情形的模拟和比较,对于激活过程可能具有的时间尺度以及过程中势垒的位置及性质都给出了一定的信息,这是只用普通(?)分子动力学方法不易达到的.
- 王化军凌伦奖倪向善陈润生石秀凡
- 关键词：分子动力学
- 使用人工神经元网络方法预测蛋白质分子主链的二面角
- 1991年
- 本文使用人工神经元网络预测蛋白质分子主链的二面角,通过分别学习所有残基,成规则二级结构的残基,无规线团的二面角,结果表明由蛋白质分子的一级序列出发预测主链二面角,对于α螺旋成功率最高,β折叠次之,而无规线团的二面角和其一级序列相关很小,故难以预测.
- 王化军凌伦奖陈润生石秀凡
- 关键词：蛋白
